實驗方法原理 的提取是植物分子生物學和基因工程研究的一種基本的技術,至今已有了數種方法。此方法最大的特點是:將SDS同時用作細胞膜的去污劑和蛋白質的變性劑,變性的蛋白質通過離心而不是酚抽提除去,使得整個操作過程變得簡單快捷,比較溫和,1小時左右就可以獲得純化的植物DNA。用這種方法得到的DNA能直接被限制性內切酶酶解,純度較高,適用于分子生物學的研究。本實驗的目的是掌握DNA提取的原理和方法。
實驗步驟
一、材料與方法:
1、植物材料:螺旋藻(Spirulina platensis)、水稻(Oryza sativa)和煙草(Nicotianatabacum).
2、試劑和溶液:
(1)20×SSC:3mol·L-1檸檬酸鈉,pH8.0:
(2)溶菌酶、10μg·μl-1Rnase、10%SDS(均為Sigma產品);
(3)酚:氯仿:異戊醇=25:24:1
(4)TE:10mmol·L-1Tris-HCL、1mmol·L-1EDTA,pH7.6。
3、提取步驟:
收集對數生長期的螺旋藻細胞,懸浮于5倍體積(v/w)含2mg·mL-1溶菌酶的20×SSC中,室溫保持10分鐘,偶爾搖動混勻。水稻幼苗和煙草嫩葉在液氮中研磨成粉狀后,立即用5倍體積的20×SSC懸浮,并輕輕拌勻。上述懸浮液在冰上先放置3分鐘,然后加入10% SDS至終濃度為2%,混勻;繼續放置10分鐘后,在4℃用11000×g離心15分鐘。上清液轉移至新的離心管中,并用相同體積的TE稀釋,再加入RNase至終濃度為10μg·ml-1,室溫放置30分鐘。11000×g離心15分鐘,所得的DNA沉淀用70%的乙醇洗兩次后,真空中抽干或自然干燥,最后溶于適量的TE中。
二、結果與討論:
利用本方法,從煙草、水稻和螺旋藻中提取了DNA。因為整個過程的操作步驟較少,也較溫和,減少了DNA被弄斷的機會,所以所得的DNA分子量較大,大部分都比完整的λ噬菌體的DNA(48.5Kb)還大。另外,用此方法所提的DNA的OD260/OD280的比值1.8至1.9之間,并能被限制性內切酶酶切,顯示有較好的純度。
在使用本方法時,須注意下面的幾個問題。當20×SSC的懸浮液中加入SDS至2%后,溶液中會出現白色絮狀物質,表明蛋白質已經變性,這是本方法的主要特點之一。它通過變性后離心而不是常用的多次酚抽方法,將絕大部分的蛋白質除去。離心所得的上清液,需要用TE稀釋,這是因為溶液中的鹽濃度較高,如不稀釋,RNase就無法起作用;而且在沉淀DNA時,如用乙醇會將溶液中的鹽析出,如用異戊醇則形成兩相的界面,將溶液中鹽的濃度降低后,就解決了這些問題。但是,加大稀釋TE的體積,對于DNA的產量并無非常明顯的作用,用等體積的TE稀釋即可。DNA抽提液經RNase酶解后,再用酚:氯仿:異戊醇抽提一次,用以除去剩余的蛋白質和酶。本方法適用于大量和微量的DNA制備。大量制備時,RNase酶解和酚:氯仿:異戊醇的抽提步驟可以在DNA濃縮一些后再使用,這樣就較便于操作,并且節省RNase和酚。通常,用這種方法能從每克新鮮組織中提取到10至15μg的DNA。
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