種子是否能夠發芽，發育成正常幼苗和正常植株，其關鍵在于它是否具有健全、正常的胚根、胚芽、胚軸的盾片或子葉。而這些都是蘊含在種子內部的，因此以往鑒定種子活力，都需要將種子剖開觀察，而現在使用種子軟X射線儀進行種子造影之后，只需要對影像進行觀察和分析，就可以進行正確的鑒定了。
有生活力的種子通常是指具有正常胚部的種子，而如果胚的主要構造有損傷或死亡的，則被列為無生活力種子。因此使用種子軟X射線儀鑒定種子活力的時候，也多是通過影像鑒定來判斷種子胚主要構造是否有損傷。種子軟X射線儀配備有顯示屏，因此可以方便檢驗人員直接觀察和分析。使用種子軟X射線儀鑒定種子活力的方法如下：
在觀察鑒定時，直接使用種子軟X射線儀進行透射，在熒光屏上直接觀察，由于死傷組織滲透鋇而吸收了X-射線，因此在熒光屏上呈現黑色，而活組織不滲透鋇則能投過較多的X-射線，所以呈現較為白色透明。在底片上，經顯影定影后，凡種胚透明的為無活力的種子，凡種胚呈現黑色的為有活力種子。在照片上，凡種胚呈黑色的為無生活力種子，凡種胚呈現白色的為有活力種子。
使用種子軟X射線儀鑒定種子活力的方法是目前比較先進的一種方法，既可以避免對種子造成的損傷，又可以清楚的觀察種子內部的情況，因此它不僅可用于鑒定種子活力，也常用于鑒別種子內部蟲害中心空洞，因此可以更加客觀的評定種子的品質。