產氣莢膜桿菌是氣性壞疽的主要病原菌，并可引起厭氧性蜂窩織炎、泌尿系感染和食物中毒。存在于人糞及溫血動物的糞便內，可作為糞便污染水體和土壤的指示菌。此菌具有芽胞，污染水體后存活時間較長，對氯等消毒劑有較強的抵抗力。如水體內未檢出糞大腸菌群和糞鏈球菌而僅檢出此菌，說明該水體以往曾有過糞便污染。產氣莢膜桿菌作為判斷土壤是否被糞便污染及污染程度的指示菌。通常用產氣莢膜桿菌值表示。
