在急性期中，經過及時、積極的治療，多數病例可獲得治愈，但仍有不少病人發生慢性骨髓炎。形成慢性骨髓炎常見的原因如下：
（一）在急性期未能及時和適當治療，有大量死骨形成。
（二）有死骨或彈片等異物和死腔的存在。
（三）局部廣泛疤痕組織及竇道形成，循環不佳，利于細菌生長，而抗菌藥物又不能達到。
毒力基因的調控金葡菌的毒力基因調控極為復雜，受多種環境因素和細菌產物的影響。研究較多的是agr基因和sar基因，這兩個基因可以上調細菌分泌蛋白的表達，減少細胞壁相關蛋白的合成。葡萄球菌的耐藥性：葡萄球菌是耐藥性最強的病原菌之一，該屬細菌具備幾乎所有目前所知的耐藥機制，可對除萬古霉素和去甲萬古霉素以外的所有抗菌藥物發生耐藥。