為危及生命的嚴重真菌感染。由于多個臟器受累，臨床表現多種多樣。
（1）念珠菌血癥 單次或多次血培養念珠菌陽性，但無器官受累的證據。多見于粒細胞缺乏者或其他高危患者，最常見的臨床表現為發熱，常可超過38℃。偶有寒戰和血壓降低。
（2）急性播散性念珠菌病 表現為持續發熱，廣譜抗菌藥治療無效。依累及部位不同可表現為腦膜炎、腦膿腫、腦炎、心肌炎、心內膜炎、骨髓炎、關節炎、肌炎（肌壓痛）等。30%非粒細胞缺乏者出現眼內炎，表現為視力模糊、眼疼痛。眼科檢查可見視網膜炎、脈絡膜炎、玻璃體膿腫甚至前房膿腫等，單側或雙側，可導致失明。累及皮膚，有邊緣清楚的痛性紅色丘疹，伴壞死性焦痂，還可有深部膿腫、壞疽性深膿皰樣損害、蜂窩織炎、結節等，血小板減少者可有紫癜。
（3）慢性播散性念珠菌病 又稱肝脾念珠菌病，當白血病患者經治療緩解，白細胞數恢復正常而體重持續下降時，則應高度懷疑本病。常同時累及其他器官，患者肝脾腫大，自覺腹痛，血堿性磷酸酶可明顯升高，其余肝功能試驗正常或輕度異常。