腸內細菌（enteric bacteria）是經常存在于腸內的細菌的總稱。用植物相的觀點看它是腸內區系，因而也可稱作腸內細菌群。
從分類學來看它是屬于腸內細菌科的細菌，為革蘭氏陰性短桿菌；一般不運動，運動時是借助于周毛。一般在簡單成分的培養基上即可生長。為兼性好氧細菌。在無氧條件下發酵乳糖和葡萄糖形成乳酸、乙酸、甲酸、琥珀酸等（混合有機酸）、乙醇、2，3-丁二醇等醇類，以及二氧化碳和氫。
