1.化驗檢查
尿糖和血糖可增高，葡萄糖耐量下降，有助于確立胰腺病變。
2.X線檢查
腹平片可見囊壁鈣化影，其形態為圓形或月牙狀。
上消化道鋇餐檢查，一般無特異性診斷價值，但是，如果有十二指腸環擴大、胃或橫結腸有移位者，可幫助推測腫塊的部位和大小。
靜脈腎盂造影通過左腎的推移方向和壓迫程度，可以了解腫塊的部位、大小和生長方向。
3.B超檢查
可以顯示腫瘤的部位、大小及其與周圍器官之間的關系，有助于明確胰腺腫塊的囊、實性，囊腔的大小和多寡，囊內容物、囊壁及其間隔等結構和形態的特征。
4.腹部CT
可以較清楚地顯示腹部包塊的部位、大小與周圍臟器之間的關系；CT可顯示囊腫為孤立性或者多房性，后者常是胰腺囊腺瘤或囊腺癌的征象；CT還能提示癌腫有無肝臟或腹腔淋巴結轉移。
5.選擇性腹腔動脈或腸系膜上動脈造影
可以確定腫瘤的形態、大小和所在器官。由于胰腺囊腔癌具有較豐富的血液供應，可與無血運的胰腺假性囊腫以及血運不豐富的胰腺癌相區別。
6.逆行膽胰管造影（ERCP）檢查
在診斷困難時，應用ERCP檢查有助于排除慢性胰腺炎、胰腺假性囊腫和導管內癌，但是對囊腺癌與囊腺瘤的鑒別無很大幫助。約有70%的胰腺假性囊腫胰管與囊腫相通；胰腺癌可表現為胰腺導管狹窄或梗阻。
7.經皮胰腺囊腫細針穿刺抽液檢查
通過經皮胰腺囊腫細針穿刺，抽取囊內液體測定淀粉酶、CA19-9以及細胞學檢查，有助于鑒別囊腫的性質。穿刺時可在B超聲和CT下引導，也可以術中直接穿刺抽液。胰腺假性囊腫和潴留性囊腫的囊液淀粉酶含量極高，而囊性腫瘤的淀粉酶多不升高。而胰腺黏液性囊腫（囊腺瘤或囊腺癌）的囊液癌胚抗原值明顯高于假性囊腫和漿液性囊腫者。由于癌胚抗原來源于能分泌黏液的柱狀上皮，無論囊腺瘤還是囊腺癌，都能產生大量的癌胚抗原，故對鑒別良、惡性腫瘤沒有幫助。
最近，有報道測定囊腫內容物的CA15-3蛋白表達可以鑒別良、惡性胰腺黏液性囊性腫瘤。