影響預后的因素有：
1.腫瘤的分期(Enneking分期) 軟組織肉瘤最常轉移到肺部，淋巴轉移及骨轉移相對少見，標準的分期檢查包括：淋巴結的體檢、X線胸片、胸部CT、全身骨掃描等；無轉移表現的病人預后較轉移者要好得多。
2.組織學分級 高度病變預后比低度病變者差。橫紋肌肉瘤預后最佳，惡性纖維組織細胞瘤預后最差。
3.腫瘤大小 雖然小病變(＜5cm)很少是惡性，即使是惡性，其預后要好于較大的腫瘤。腫瘤大小的界定是人為規定的，小腫瘤一般認為其最大直徑應＜5cm。
4.病變的深度 淺表(皮下)的軟組織肉瘤預后較深部(肌筋膜以下)腫瘤好。