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    發布時間:2014-08-20 15:16 原文鏈接: 華東師大等Cell子刊發表干細胞新成果

      最近,華東師范大學、美國國立衛生研究院、賓州州立大學醫學院和加州大學洛杉磯分校等處的研究人員在Cell期刊旗下的《Stem Cell Reports》雜志在線發表了一項最新研究成果“Transcriptional Repression by the BRG1-SWI/SNF Complex Affects the Pluripotency of Human Embryonic Stem Cells”,該研究對轉錄抑制影響hESCs自我更新和分化的分子機制,提供了有價值的見解。

      本研究通訊作者為華東師范大學生命醫學研究所博士生導師王媛,其1993年獲山東醫科大學醫學學士學位,1996年獲中國預防醫學科學院醫學碩士學位,2002年獲美國波士頓大學分子與細胞生物學及生化學博士學位,2002年到2008年先后在美國麻省理工大學、哈佛大學醫學院及國立環境衛生研究院做博士后研究。主要致力于胚胎干細胞表觀遺傳學以及胚胎器官發育機制的研究,已在國際核心期刊發表論文10余篇,包括Nature,PNAS,Blood等一流期刊,其研究論文他引達200多次。2008年受聘為華東師范大學教授。2009年3月回華東師范大學生命醫學研究所擔任生物醫學教授、博士生導師,并成立了干細胞生物學實驗室。回國9個月后已主持干細胞生物學領域973重大發展研究計劃子課題1項,國家自然科學基金面上項目1項,并獲上海市教委科研創新項目資助。

      胚胎干細胞(ESCs)最初來源于內細胞團。它們是多能性細胞,能夠自我更新并分化成多種類型的細胞。小鼠ESCs(mESCs)具有一個獨特的染色質總體結構,特點是高動力性的可塑性和二價結構域,由譜系特異性基因啟動子區域中的活性H3K4me3和抑制H3K27me3標記。在人類ESCs(hESCs)中,H3K4me1、H3K27ac和p300標記的染色質位點,最近被確定為可驅動基因表達的活性增強子。從自我更新到分化的轉換,需要多個表觀遺傳學因子的參與,包括染色質調節、非編碼RNA和組蛋白修飾。

      其中一個因子——SWI/SNF,是一個大的染色質重構復合物,僅僅包含BRG1或BRM作為催化ATP酶亞基,可驅動DNA核小體結構的改變,從而調節基因轉錄。先前的研究表明,刪除BRG1或SWI/SNF復合體的核心亞基,例如BAF155和BAF47,可引起圍植入殺傷力,表明SWI/SNF復合物是體外保持全能性所必需的。

      此外,SWI/SNF組件不足也影響各種類型細胞的發展潛力(例如神經元細胞、造血干細胞和生殖細胞),支持這一概念:SWI/SNF復合物在組織發育過程中起著重要的作用。最近,一系列的研究報告表明,SWI/SNF復合物也在mESCs的全能性中起著很重要的作用。BRG1、BAF155或 BAF250a/b不足會使ESCs增殖并分化成三個胚層的能力受損。染色質免疫沉淀結合DNA測序(ChIP-seq)表明,BRG1與核心多能性因子(OCT4和SOX2)在靶基因的大量位點上共定位,以調控它們的規格。此外,BRG1還可以通過改變H3K27me3水平,反對polycomb (PcG)功能,從而加強mESCs中的LIF/STAT3信號。

      哺乳動物的SWI/SNF復合物包含15個核心亞基,稱為BRG1-或BRM相關因子(BAFs)。已知BAF組件的不同裝配與它們的組織特異性功能有關。例如,BAF60c,而不是BAF60b蛋白,在胚胎心臟中選擇性地表達,其不足可導致有缺陷的心臟發育和交配后10-11天的胚胎致死率。在 mESCs中,BRG1 (而非BRM)和BAF155 (而非BAF170)富含BAF60a,來形成所謂的“esBAF”復合物。無論是BRG1還是BAF155不足,都會導致mESCs多能性的喪失,這種喪失不能由BAF170過表達得以緩解。因此,BAF的特定組成,對于其在mESCs中的功能至關重要。

      雖然hESCs和mESCs具有許多共同的核心多能性相關轉錄因子和細胞特征,但hESCs在其克隆形態、細胞增倍時間、對信號分子的反應和自我更新所需的培養條件上,仍然存在差異。這可能部分歸因于不同的發展階段,也可能由于一種固有的人鼠分歧。到目前為止,只有少數基因已被確定為在hESCs和 mESCs中共有高度保守的作用。SWI/SNF復合物在hESCs中所發揮的確切作用尚不清楚。因此,這項研究試圖探究SWI/SNF復合物在hESC 多能性中的功能相關性。

      結果表明,敲除BRG1或 BAF170,而不是BAF155,會導致hESCs多能性的喪失和失調的譜系規格。全基因組陣列顯示,BRG1不足會引起一般的基因表達上調,表明BRG1在hESCs的轉錄調控中起抑制作用。

      進一步的分析表明,BRG1敲除后,譜系特異性基因的H3K27ac水平顯著升高,突出顯示了H3K27ac可作為一個重要的標記,來區分hESCs中活性基因位點和抑制性基因位點。因此,這項研究對轉錄抑制影響hESCs自我更新和分化的分子機制,提供了有價值的見解。

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