如果媽媽在懷孕期間感染病毒,接觸過射線或吃過一些有損胎兒發育的藥物,就可能會增加卵圓孔不閉合的機會。卵圓孔未閉與不明原因腦栓塞、潛水減壓病、偏頭痛等疾病的關系密切,因此一些學者認為,對于具有不明原因腦栓塞病史者、潛水員、航天員及頑固性偏頭痛者合并卵圓孔未閉時應該進行修補治療。