在臨床治療上，由于呼吸生理和重癥監護醫學包括儀器設備的創新，以及重癥監護病房(ICU）組織及管理系統的建立，特別是呼吸支持技術的發展與完善，極大地豐富了重癥患者呼吸衰竭搶救的理論與實踐，降低了病死率。對睡眠狀態的全套臨床生理學監測和無創正壓通氣為睡眠呼吸障礙的診斷和治療提供了全面的技術手段。新一代的各種抗生素（如四代頭孢菌素，新一代喹諾酮類，碳青霉烯類等）對產超廣譜p內酰胺酶（ESBI，s）的陰性桿菌具有更強的治療作用。新型嗯唑烷酮類（如利奈唑胺）及糖肽類（如替考拉寧）抗生素對耐甲氧西林葡萄球菌的療效與萬古霉素相似，副作用更少。新一代的抗真菌藥物（如兩性霉素B脂質體、伏立康唑、卡泊芬凈等），對各類真菌感染療效更佳，副作用更少。
微創技術（如胸腔鏡）的使用可對一些肺功能差的患者施行肺部手術，各種通氣模式的改進可對不同的病因引起的呼吸衰竭進行針對性的治療。由于非創傷性面（鼻）罩通氣的推廣，將能預防一些患者（如慢性阻塞性肺疾病，神經肌肉疾病）發展為呼吸衰竭，并使部分患者避免氣管插管或切開。而肺移植的開展，將成為失代償呼吸功能不全的重要治療手段。