①無需進行酶的分離和純化，減少酶的活力損失，同時大大降低了成本；
②可進行多酶反應，且不需添加輔助因子，固定化細胞不僅可以作為單一的酶發揮作用，而且可以利用菌體中所含的復合酶系完成一系列的催化反應，對于這種多酶系統，輔助因子再生容易；
③對于活細胞來說，保持了酶的原始狀態，酶的穩定性更高，對污染的抵抗力更強；
④細胞生長停滯時間短，細胞多，反應快等等。正是由于固定化細胞的這些無可比擬的優勢，盡管其出現遠遠晚于固定化酶，但其應用范圍比固定化酶更為廣泛。
