基因免疫不僅已廣泛地應用于抗病毒、細菌、真菌、寄生蟲等抗感染免疫中，同時也發現在腫瘤免疫及自身免疫性疾病中起重要作用，已成為現代免疫學研究的重點和熱點。
基因免疫本身也從早期的將靶抗原編碼基因置于常規的病毒啟動子、增強子等調控元件的調控下，經肌肉接種免疫的常規基因免疫，發展到具有特異性靶向性、高表達水平、表達可調節性和選擇性誘導某一特定類型免疫應答的新一代基因免疫。
