Ecl 顯色原理：魯米諾在免疫測定中既可用作標記物，也可用作過氧化物酶的底物。在Ecl底物中，含有H2O2和魯米諾，在HRP（辣根過氧化物酶）的作用下，發出熒光來。
試驗步驟：
1）將兩種顯色底物1：1等體積混合（一般各1ml/membrane）。
2）將混合物覆蓋在膜表面，1-2分鐘，搖晃使均勻。
3）用保鮮膜把膜包起來，放入夾板中。
4）在暗室中將X光片，覆蓋在膜的上面，夾好夾子，曝光1min。
5）顯影、定影。
6）根據結果調整曝光時間和曝光區域，得到最佳結果。
注意：熒光在一段時間后會越來越弱。
記得全程手套操作，一則避免手印污染影響結果，二則保護自己（未交聯的丙烯酰胺、甲醛等等雖不立即致命但都會慢慢毒害你的身體）
1. 如果WB前沒有可參考的資料--比如不知道是否有表達，比如抗體少還要摸條件（稀釋度），可以用剪膜剩下的邊角料來先做幾組點雜交摸條件，省點時間省點試劑；
2. 去掉積層膠后，預染的Marker可用以識別膠上下方向和膜的正反面（預染Marker如果照著說明書用量，有可能在電泳時看不到條帶，但轉膜時有濃縮效應而且背景白就可以看到了。如果要電泳能看到就要參考電泳的那個用量，或者多加1-2倍的量）；如果目標蛋白小，指示劑也可以指示方向，但是如果蛋白大，指示劑已經跑出去了，就要留意分清膠上下方向，切個小角是常用的方法。膜和濾紙一起裁最好（不過濾紙上下疊多了膜不好剪，硝纖膜容易裂，用利刀+尺子+墊厚報紙劃比較容易）盡量和膠一樣大小，膠用純水沖洗一下后用電泳緩沖液平衡過再量。我自己通常剪的時候會故意長寬各比膠少1mm，保證膜和膠不會碰到對方背后的濾紙就好。
3. 對于特別小的蛋白，tricine SDS-PAGE電泳有助于提高蛋白大小在1KD-20KD間的分辨率，不用甘氨酸，丙烯酰胺的濃度也不用太高（可參考2004年中國生物工程雜志上有一篇文章（有效分離1kD小肽的Tricine-SDS-PAGE方法）
4. 轉膜前膠要在轉移緩沖液里平衡一下防止膠變形，也有助于進一步去掉可能有礙轉膜的雜質。還有人在這一步浸泡幫助蛋白復性，可以直接在膠上檢測蛋白活性。
5. 膜漂在水面（或者甲醇液面）讓液體從下通過膜上的孔滲上來以趕走膜內空氣，膜徹底浸潤后顏色會變深一點，任何白點或者斑都是沒有完全浸潤的標志，會影響轉膜的。最后浸沒入緩沖液里平衡。甲醇處理PVDF不要超過15秒。以后的步驟中不要讓膜干涸了。
6. 電轉移緩沖液通常用Tris glycine系統，如果是轉膜后有部分樣品要蛋白測序，最好用CAPS緩沖液，減少甘氨酸對測序的污染。
7. 半干電轉移（Semi-Dry）用經過緩沖液飽和的濾紙代替傳統轉移槽，非常節約試劑，而且效果也好。由于不用“泡”在緩沖液中，半干轉不單可用均一緩沖體系，也可以做非均一轉移緩沖體系。半干轉可以在30分鐘內完成轉膜（每平方厘米電流2.5-3.5mA，恒流，冷庫。如果電流要求小可以延長到60-90分鐘，但要防止過熱。如果有那種溫度貼，可以貼上參考溫度），即使205KD這么大的蛋白轉膜效率也高達80%。各種大小的蛋白的轉移效率都OK。半干轉可以上下層疊2塊膠+膜一起轉（面積還是按照單個計算），只要控制好單位面積的電流強度，防止過熱就好了。
8. 有人覺得轉膜加SDS有助于大分子蛋白轉膜，我個人持保留意見，因為SDS等去垢劑影響硝纖膜和蛋白的結合，反而不好。
9. 如果只做Western Blot，膜可以用麗春紅S染色并在脫色前照相，對后面的免疫反應影響不大。不要用考馬斯亮藍或者氨基黑染色膜以免影響結果。如果有預染Marker需要用針或者筆扎眼記錄條帶位置，以免后面會洗掉而無法判斷結果。預染Marker也有助于判斷轉膜的效率和情況，如果比目標分子大的Marker都已經轉過去了，那就OK了。
10. 有人說在中性條件下電泳有助于蛋白測序，如果要蛋白測序需要提前一天倒膠，并說預電泳6小時（有還原劑如Glycolate）后再倒積層膠。除了要做HPLC分析應該用麗春紅S而不要用考馬斯亮藍或者氨基黑染色，其他的比如測序或者PTH都可以選靈敏度高些的考馬斯亮藍或者氨基黑。
11. 轉印后的PVDF膜在含20%甲醇溶液中在白透射光照下不用染色也依稀可以看到透明的蛋白條帶，有時這種快速的方法可以不用染色識別條帶，避免染色膜影響后繼實驗。
轉膜后的封閉注意：
12. 轉膜后，膜上其他的空白位置需要用封閉液封閉。Western的靈敏度某種程度上受限于封閉做的好不好。脫脂奶是最常用的經濟配方，用這種封閉劑由于里面可能有痕量的生物素和堿性磷酸酶，可能造成背景污染而不適合生物素-親和素的檢測方法，脫脂奶也不適合堿性磷酸酶檢測（AP）方法。如果采用堿性磷酸酶檢測系統，封閉劑最好用6%酪蛋白+1%聚乙烯吡咯烷酮+10mmol/L EDTA磷酸緩沖鹽加熱65度1小時確保堿性磷酸酶失活（可以加0.05%疊氮化鈉，新鮮最好）。
經濟的脫脂奶配方和AP兼容得不太好，再加上HRP的底物選擇范圍也更寬，現在HRP是越來越普遍的選擇。但是疊氮鈉(NaN3)對辣根過氮化物酶(HRP)有滅活作用，如果用HRP檢測系統則封閉液不要加疊氮化鈉為好。切記：封閉時間和封閉劑的量都要足夠。
13. 如果選用AP作為顯色方法，封閉時就要選擇Tris緩沖體系，不要用PBS，因為PBS干擾AP。