植物的病菌形態是復雜的，而且少數的病原菌會受環境等條件的影響。近20年來,現代分子生物學技術在植物病原菌的研究上取得了突破性進展,一些分類地位不明確、親緣關系不清楚的物種通過該技術得到了驗證,為不同病原菌的分類、鑒定和診斷提供了更豐富、更可靠的手段。植物病害快速診斷儀能夠快速的對相關病菌進行有效的測定研究，為防治提供幫助。
近年來,隨著分子生物學技術在生物系統發育研究等領域的廣泛應用,以PCR為基礎的各種分子生物學技術在植物病原菌檢測鑒定方面的應用研究報道日益增多。
在植物病原真菌的研究應用上,利用PCR-RFLP方法對捕食線蟲真菌節叢孢屬進行了系統發育研究,基本體現了屬內不同種間的親緣關系,從分子水平證明了節叢孢屬形態分類上的合理性,同時對該屬屬征的擴大提出疑義;采用PCR擴增了棉花疫病菌、辣椒疫病菌核糖體基因的ITS區域,并對產物進行了克隆和序列比較;Cooke等測定了16種疫霉菌核糖體基因的ITS序列,發現不同疫霉種間變異豐富,而同種的不同菌株間則序列高度保守,并根據ITS的序列分 析,提出了疫霉屬卵菌的系統發育趨勢。
總之,通過植物病害快速診斷儀對核糖體基因ITS區在各種植物病害診斷中的應用愈來愈廣泛,根據rDNAITS的序列差異鑒定各種植物病原菌,為植物病害的早期、快速診斷提供可靠的依據,為今后進行分類鑒定,分子流行病學調查等更深入的研究工作奠定基礎,同時對植物病害的防治具有重要的意義,還可進一步進行作物病害抗源鑒定,輔助作物抗病育種。