(一)不孕：子宮內膜異位患者常伴有不孕。根據資料報道，子宮內膜移位引起的原發性不孕占41.5～43.3%，繼發性不孕占46.6～47.3%。盆腔內膜異位癥常可引起輸卵管周圍粘連影響卵母細胞撿拾或導致管腔堵塞;或因卵巢病變影響排卵的正常進行而造成不孕。
(二)月經過多：內在性子宮內膜異位癥，月經量往往增多，經期延長。可能由于內膜增多所致，但多伴有卵巢功能失調。
(三)痛經：為一常見而突出的癥狀，多為繼發性，即自發生內膜異位開始，患者訴說以往月經來潮時并無疼痛，而從某一個時期開始出現痛經。可發生在月經前，月經時及月經后。有的痛經較重難忍，需要臥床休息或用藥物止痛。疼痛常隨著月經周期而加重。
(四)性交疼痛：發生于子宮直腸窩、陰道直腸隔的子宮內膜異位癥，使周圍組織腫脹而影響性生活，月經前期性感不快加重。
(五)大便墜脹：一般發生在月經前期或月經后，患者感到糞便通過直腸時疼痛難忍，而其他時間并無此感覺。子宮內膜異位病變圍繞直腸形成狹窄者有里急后重及梗阻癥狀，故與癌瘤相似。
(六)膀胱癥狀：多見于子宮內膜異位至膀胱者，有周期性尿頻、尿痛癥狀;侵犯膀胱粘膜時，則可發生周期性血尿。