一．急性病人應臥床休息，發熱者需補液，給予祛痰鎮咳藥物，必要時可用胰蛋白酶和生理鹽水霧化吸入稀釋痰液以利喀出，胸痛劇烈時可用止痛劑。
二．肺阿米巴病的藥物治療：
甲硝唑（滅滴靈）0.4～0.8g, 3次/d服，5～10d為一療程，必要時可重復使用。重癥者應靜脈給藥；首次15mg/kg以后為7.5mg/kg每6小時一次，溶解于5%葡萄糖250ml靜脈滴入，療程7～10d. 也可選用 安特酰胺（Entamidum）0.5g, 3次/d服, 10d一療程。甲硝磺酰咪唑2g, 1次/d服，3d一療程。
三．肺阿米巴病的胸腔積液或膿胸：應穿刺抽液(膿)或必式引流排膿，也可用甲硝唑0.5g胸腔內注射局部治療。
四．肺阿米巴病的其他治療：肺膿腫痰量多者應順位引流排痰。合并細菌感染時須加用抗菌素。如有下列情況(1)內科治療無效；(2)慢性纖維病變；(3)形成支氣管胸膜瘺，可用手術治療。