氟胞嘧啶的劑量取決于患者的體重和病情。
對于成人，通常的劑量為：
口服時，一次1.0～1.5g，一日4次，為避免或減少惡心、嘔吐，一次服藥時間應持續15分鐘。
靜脈滴注時，一日0.1～0.15g/kg，分2～3次給藥，滴注速度4～10ml/min。
對于特殊人群，如腎功能損害者，尤其是與兩性霉素B或其他腎毒性藥物同用時，需要慎用。腎功能減退者需減量用藥，并根據血藥濃度測定結果調整劑量。腎功能減退者需監測血藥濃度，峰濃度以40～60mg/L為宜，不宜超過80mg/L。
