測試環境的影響主要包括測試所處場地的環境和測試過程中使用的器皿環境。場地環境中的溫度、濕度等條件現場和實驗室一般差別不大，同時要求監測環境中無氨或者銨鹽，一般實驗室可以滿足無氨的條件，但是對于污水處理廠自動監測站房不容易得到保證，尤其是污水處理進口，空氣中氨濃度較高，測量過程中樣品存在吸收或者釋放氨的情況，對測量數據產生一定影響。同時現場在線監測設備使用的零樣和試劑瓶存在與空氣的交換，容易對試劑形成污染，影響測量數據。
實驗室進行測試時，總氮測量使用的器皿需要專用于總氮測量，不能與其他實驗所用器皿混用，防止器皿污染形成測量誤差。在線監測在測量時需實現自動對試劑的計量和添加，長時間使用時，管路、閥門、計量消解單元內壁形成試劑附著殘留，水樣中含有泥沙時對管壁造成磨損，對試劑的計量形成誤差，殘留試劑污染樣品，造成測量數據的偏差。