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    發布時間:2019-09-10 11:56 原文鏈接: 用IPTG誘導啟動子在大腸桿菌中表達克隆化基因實驗

               

    實驗材料

    帶有 lacIq 或 lacIq1 等位基因的適于轉化的大腸桿菌菌株 IPTG 誘導的表達載體

    試劑、試劑盒

    考馬斯亮藍染色溶液或銀染溶液 IPTG SDS 凝膠 加樣緩沖液 SDS-聚丙烯酰胺凝膠 靶基因或 cDNA 片段 LB 瓊脂平板 LB 培養基

    儀器、耗材

    SorvallGSA 轉頭或相當的轉頭 沸水浴 振蕩培養箝

    實驗步驟

    材料

    緩沖液和溶液

    貯存液、緩沖液和試劑的成分參見附錄 1。
    貯存液稀釋至適當濃度。

    考馬斯亮藍染色溶液或銀染溶液
    參見附錄 8。

    IPTG(1mol/L)

    1XSDS 凝膠加樣緩沖液
    不含 DTT 的 1xSDS 凝膠加樣緩沖液室溫保存,1mol/LDTT 貯存液現用現加于上述緩沖液。

    凝膠

    SDS-聚丙烯酰胺凝膠(10%)
    用于分離蛋白的 SDS 聚丙烯酰胺凝膠的制備參考附錄 8。

    核酸和寡核苷酸

    靶基因或 cDNA 片段

    培養基

    含氨芐(50ug/ml) 的 LB 瓊脂平板
    含氨芐(50ug/ml) 的 LB 培養基

    離心機和轉頭

    SorvallGSA 轉頭或相當的轉頭

    特別配備

    沸水浴

    振蕩培養箝

    補充試劑
    本方案步驟 1 需要第 8 章方案 7 中所列試劑。
    本方案步驟 2 需要第 1 章方案 17 或 19 中所列試劑。
    本方案步驟 3 需要第 1 章方案 23~26 中所列試劑。
    本方案步驟 4 需要第 12 章方案 3 中所列試劑。

    載體和細菌菌株

    帶有 lacIq 或 lacIq1 等位基因的適于轉化的大腸桿菌菌株
    帶有 lacIq 等位基因的 IPTG 誘導表達質粒(如 PMAL 和 pGEX) 可以轉化實驗室的任何大腸桿菌菌株 (如 JM101,DH5F‘和 TG1)。詳細內容參見本方案。

    IPTG 誘導的表達載體
    其他載體包括 pGEM-3Z(Promega 公司,見圖 15-4),pGEX-1(Pharmacia 公司),pKK223-3 (Pharmacia 公司), pMEX (U.S.Biochemicals 公司),pTrc99A (Pharmacia 公司)和 pMAL (NewEnglandBiolabs 公司)。
    陽性對照質粒(表達已知大小的 LacZ 融合蛋白的 IPTG 誘導載體)



    方法

    含重組表達載體的大腸桿菌菌株的構建

    1.PCR 修飾或限制性內切酶消化分離 DNA 片段,片段 5'端和 3'端帶有與 IPTG 誘導表達載體對應的限制酶位點。
    大多數 IPTG 誘導表達載體都含有表達外源蛋白所必需的全部控制元件。RCR 修飾表達 cDNA/基因,使結構兩側沒有無關序列。為方便表達,可以根據所用載體和初步結果. 在片段末端加入其他調控序列(參見本方案疑難解析和誘導啟動子表達蛋白的優化)。
    為確定擴增反應沒有引入錯誤突變,應對 PCR 產物進行序列分析。

    2. 含靶 CDNA/基因的 DNA 片段與表達載體連接(第 1 章方案 17 或 19)。

    3. 重組質粒轉化有 lacIq 等位基因的大腸桿菌菌株。如果質粒本身有 lacI 基因,可以使用任何適當的大腸桿菌菌株。將轉化體鋪于含氨芐(50ug/ml) 的 LB 平板,于 37°C 過夜培養。
    空的表達質粒(陰性對照)和陽性對照質粒轉化相間的大腸桿菌菌株。

    4. 通過菌落雜交和/或小量制備質粒的限制酶切分析、寡核苷酸雜交或序列分析篩選帶有插人片段的轉化體(請參見第 12 章方案 3)。

    誘導靶蛋白表達的優化
    許多研究表明細胞生長速率嚴重影響外源蛋白的表達,因此必須對接種細菌量、誘導前細胞生長時間和誘導后細胞密度進行控制。生長過度或過速都會加重細菌合成系統的負擔,導致形成包涵體,

    5. 對照菌和重組菌分別挑取 1~2 個菌落,接入 lml 含氨芐青霉素(50ug/ml) 的 LB 培養液,適當溫度(20~37°C) 培養過夜。
    大腸桿菌在室溫的生長速度比在 37°C 慢 4 倍,所以~20°C 培養過夜(~16 h) 可能達不到飽和。但低溫時細菌代謝緩慢,不容易形成包涵體。請參見本章前言不溶性蛋白的處理部分。

    6. 取 50ul 過夜培養物接入 5 ml 含氨芐青霉素(50ug/ml) 的 LB 培養液,20~37°C 振蕩培養 2 h 以上,至對數中期(A550=0.5~1.0)。

    7. 吸出 1ml 未經誘導的培養物放在一個微量離心管中,按下面步驟 9 和 10 所述進行處理。

    8. 在剩余培養物中加入 IPTG 至終濃度 1mmol/L,20~37°C 繼續通氣培養(參見下面 IPTG 濃度和誘導溫度的優化)。
    IPTG 的濃度對表達水平影響非常大。1mmol/L 只是一個起點,也是一個比較離的濃度。實驗中, 應在 0.01~5.0 mmol/L 的范圍內改變 IPTG 濃度,尋找最佳使用濃度。對于有些蛋白,必須誘導表達質粒慢轉錄, 才不致于使細菌的生物合成系統過載。
    影響在大腸桿菌中獲得高水平表達的最重要因素可能是生長溫度,通過實驗確定最佳溫度. 是表達外源蛋白的關鍵。雖然在 15~42°C 之間都獲得過成功表達,但表達某一種特定蛋白質的最佳溫度范圍則可能很窄,只有 2~4°C。溫度有時對表達水平起著決定作用,而有時卻對表達水平沒有任何影響,這其中的原因還有待進一步研究,但可能是諸多因素單獨或同時作用的結果。這些因素包括:細菌生長速率、表達產物的胞內折疊、輔基(血紅素、黃素、腺嘌呤二核苷酸、生物素等)的可獲得性、外源蛋白的熱變性、細胞分泌或折疊器的過載、內原蛋白酶或其他裂解酶的活性、細菌 SOS 修復系統的激活等。由于這些不確定因素的存在,理論推斷最佳生長溫度是不可靠的,必須進行反復的實驗。

    9. 在誘導的不同時間(如 1、2、4 和 6 h) 取 1ml 樣品放于微量離心管中,測定 A550, 室溫高速離心 1 min。

    10. 沉淀懸于 100ul 1XSDS 凝膠加樣緩沖液,100°C 加熱 3 min, 室溫高速離心 1 min, 冰上放置,待全部樣品處理完后上樣。

    11. 樣品加熱至室溫,取 40ug 或相當于 0.15OD550 培養物的懸液上樣于 10%SDS 聚丙烯酰胺凝膠。

    12.8~15V/cm 電泳,至溴酚蘭遷移到分離膠底部。

    13. 考馬斯亮藍染色或銀染,或免疫印跡,觀察表達產物條帶(請見附錄 8)。
    37°C 誘導 30 min 的陽性對照,有一條分子質量為 26kDa 的谷胱甘肽轉移酶(GST) 帶,GST 的量在誘導過程中持續升高。誘導一定時間的重組菌應有一條與預計大小一致的帶,誘導動力學和蛋白穩定性可能不同于 GST 對照。

    大量表達靶蛋白

    14. 挑取一個重組大腸桿菌菌落接入 50 ml 含氨芐(50ug/ml) 的 LB 培養液,在 250 ml 搖瓶中于 20~37°C 過夜培養。

    15. 取 5~50 ml 過夜培養物接入 450~500 ml 含氨芐(50 ug/ml) 的 LB 培養液,在 2L 搖瓶中于 20~37°C 振蕩培養過夜,至對數中期(A550=0.5~1.0)。

    16. 以預試驗確定的最佳 IPTG 濃度、最佳時間和最佳溫度誘導表達靶蛋白。

    17. 誘導適當時間后,于 4°C 以 5000 g(5500r/min Sorvall GSA 轉頭)離心 15 min 收集細胞,繼續后面的純化方案:

    ? 如果表達的是 GST 融合蛋白,繼續方案 5

    ? 如果表達的是麥芽糖結合蛋白融合蛋白,繼續方案 6

    ? 如果表達產物帶有組氨酸標簽,繼續方案 7


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