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    發布時間:2013-11-12 10:42 原文鏈接: 研究稱“罕見突變”對銀屑病影響或有限

      近日,安徽醫科大學、深圳華大基因研究院等單位的研究人員對21309名中國銀屑病患者和對照的目標區域基因測序研究確認,“罕見突變”對銀屑病的影響可能很有限。相關研究成果已在最新一期的《自然—遺傳學》雜志上發表。

      銀屑病俗稱“牛皮癬”,是一種常見的慢性炎癥性皮膚病。此前,主流學說普遍認為,在人群中頻率較低的罕見突變與復雜性遺傳疾病的發生關系密切。

      科研人員對781位銀屑病患者以及676位健康對照者的樣本進行了外顯子測序,希望發現更多遺傳因素的證據。他們用數據分析的方法,檢測到518308 個單核苷酸變異(SNVs),其中,20.62%的SNVs是非同義突變,68.13%是罕見突變(<1%的等位基因頻率)。考慮到外顯子研究階段樣本量有限,研究者們在第二階段又進一步對9946位銀屑病患者和9906位健康對照者的樣本進行了靶向測序研究。他們共分析了1326個靶向基因,包括 622個與免疫調節相關的基因,發現了82387個非同義突變的SNVs,其中罕見突變所占比例高達97.07%。

      經進一步分析,科研人員在IL23R和GJB2這兩個基因上檢測到與全基因組關聯分析(GWAS)信號獨立的低頻(1%~5%的等位基因頻率)錯義突變關聯信號;在 LCE3D、ERAP1、CARD14 和ZNF816A這幾個基因中,檢測到5個可能是致病突變的常見錯義突變與銀屑病的發生顯著關聯。

      此外,研究者們還認為,在FUT2 和TARBP1這兩個基因上發現的罕見錯義突變可能也與銀屑病的發生有關,但其關聯沒有達到全基因組顯著水平。在以基因為單位的檢驗中,也沒有發現罕見突變在對照和患者中的分布有明顯差異。此結果顯示,目標區域編碼區的低頻和罕見非同義突變對銀屑病的發生可能影響有限。

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