離子交換鍵合相是在化學鍵合的有機硅烷分子中引入離子交換基團而制成的固定相，離子交換鍵合相色譜儀是以離子交換鍵合相作固定相的液相色譜儀。
一、分離機制：
離子交換鍵合相色譜中，樣品離子和固定相基團之間存在相互作用，不同樣品離子的作用大小不同。在樣品離子隨流動相通過色譜柱的過程中，流動相中的離子與樣品中的待測離子發生可逆交換，作用力強的樣品離子保留時間比作用力弱的離子長，zui終不同的樣品離子依次流出色譜柱并分別到達檢測器被檢測，以保留時間進行定性，以峰高或峰面積進行定量，從而實現樣品離子的分離和測定。
二、固定相：
1、離子交換容量：
離子交換容量是指單位質量的離子交換劑能與其它離子發生交換的量。
離子交換容量與固定相的表面積有關。
離子交換容量越大，負載能力越大，k值越大。
2、固定相類型：
（1）按引入電荷基團的性質可分為：
1）陽離子交換劑：
如磺酸基（－SO3H）和羧酸基（－COOH）。
強陽離子交換劑：pH＞3完全離解。
弱陽離子交換劑：pH＜4不離解，pH＞8完全離解，pH = 4～8部分離解。
2）陰離子交換劑：
如季氨基（－R4N+）和氨基（－NH2）。
強陰離子交換劑：pH＜9完全離解。
弱陰離子交換劑：pH＞8不離解，pH＜6完全離解。
（2）按基質可分為：
基質有表面多孔型（薄殼型）硅膠或全多孔微粒型硅膠。
1）全多孔微粒型固定相：
優點是表面積大，樣品容量大（mg/g）。
2）表面多孔型（薄殼型）固定相：
優點是傳質快，滲透性好。
缺點是表面積較小，樣品容量小（＜0.1mg/g）。
三、流動相：
1、組成：
多為一定pH值的緩沖液，有機成分作改性劑。
2、溶質保留機理：
兼有離子交換和吸附雙重機理。
3、影響溶質保留值的因素：
（1）流動相的pH值：
1）弱酸和弱堿的保留值與洗脫液的pH值有關。
解離并參加離子交換而被分離。
不解離，不參加離子交換，以分子形式幾乎無保留地通過色譜柱。
流動相的pH值選擇應適中，zui好選擇在被分離的酸或堿的pka或pkb附近，使其解離適中，達到zui佳分離。
采用不同pH值的緩沖液進行梯度洗脫，可提高分離度。例如陰離子交換，pH值降低，酸性弱的組分先洗脫出，酸性強的組分后洗脫出。
2）陰離子交換劑分離有機酸的保留規律：
在用強陰離子交換鍵合相分離酸性藥物時，pH值增大，藥物解離度增大，k值增大，保留時間增加。
pH值越小，酸的解離被抑制，保留越小。
pH值越大，酸的解離程度越大，保留越強。
3）陽離子交換劑分離有機堿的保留規律：
在用強陽離子交換鍵合相分離堿性藥物時，pH值增大，游離堿增加，k值減小，保留時間縮短。
pH值高，堿以分子形式存在，保留值很小。
pH值低，堿以質子化形式存在，保留值較大。
（2）流動相的離子強度：
流動相的離子強度（緩沖鹽濃度）增加，k減小。原因是離子交換平衡的移動。
（3）有機改性劑：
如果洗脫液中加入極性有機組分（如乙醇），則抑制離子交換，產生按分配機理進行的分離。