種子單粒粉碎器和種子研磨儀雖然都是樣品粉碎設備，但在功能、應用方面還是有所區別的。
種子單粒粉碎器一次只能粉碎單粒種子，主要用作種子蛋白電泳測純樣品的粉碎。
該儀器功能特點有：1、適用于種子蛋白電泳測純樣品的粉碎，也可用于水分測定時樣品的無水分損失粉碎；2、可粉碎小麥、玉米、棉花、豆類等農作物單粒種子；3、可適用于高水分、高含油的種子粉碎，不混樣，操作輕松快。
而種子研磨儀則是通過碳化鎢小球或不銹鋼小珠在樣品管內來回震蕩實現樣本的粉碎、混合、均化以及細胞破碎等，可以對硬性、軟性、彈性等樣品進行快速的粉碎和均相化處理，符合理化分析實驗室的要求，配置不同體積、不同材料的研磨罐，可以進行干磨、濕磨及冷凍研磨，也可以進行細胞破碎和DNA/RNA提取，在農業、生物醫藥、食品、地質、化工、環境、質檢、高校等各行各業都有廣泛的應用。
所以，種子單粒粉碎器和種子研磨儀的區別還是比較明顯的，不僅是在外觀上，在性能、特點、應用方面都有區別，它們在各自的領域都能發揮出各自的優勢。