人淋巴毒素和腫瘤壞死因子α基因是緊密連鎖的兩個單拷貝基因，位于第六號染色體6p23一6q12之間。Carrol等人證實這兩個基因位于主要組織相容性復合體(major histocompatibility complex，MHC)基因簇中，在補體C2與HLA-B位點之間，兩者相距僅1.1kb。小鼠的這兩個基因被定位于第17號染色體，而且也與小鼠MHC緊密連鎖。人LT基因全長3037bp，TNF-α基因全長3634bp，它們都是由3個內含子和4個外顯子組成。LT的信號肽由34個氨基酸組成，成熟蛋白質含有171個氨基酸；TNF-a的信號肽有76個氨基酸，成熟蛋白有157個氨基酸。 [4]
與TNF-α相似，淋巴毒素也有膜結合和可溶性兩種形式：分泌到細胞外的可溶性形式稱為Llb(即基因工程領域通常所說的淋巴毒素)；膜結合的淋巴毒素以LTα和LTβ的亞單位結合形成的復合物形式分布在細胞膜上，LTβ是一種33KD的膜蛋白分子，能提供位點和LTα結合。