膽囊管綜合癥的突出癥狀為疼痛，可位于膽囊部位或上腹部，偶爾可放射到背部。脂肪餐后可誘發明顯疼痛，因此有些患者食量銳減，體重減輕。有時嚴重疼痛呈陣發性發作，與膽絞痛無法區分。有些患者睡眠中可痛醒，疼痛持續數小時。硝酸甘油或抗膽堿能藥物有可能緩解疼痛，但效果不能完全肯定，且顯效時間也很短。有時可有膽囊區壓痛，但很少能觸及到擴大的膽囊。
