對無癥狀的雜合子患者不須作預防性拍療，但應避免由于外傷、手術及口服避孕藥誘發的血栓形成。有急性血栓形成者，可采用肝素治療。采用口服抗凝劑可能引起繼發性高凝及血栓形成危險，華法林治療中應防止發生出血性皮膚壞死。因此，無論是純合了型或雜合子型蛋白C缺陷者中，在抗凝治療前2d，應輸注蛋白C濃縮劑、新鮮血漿、凝血酶原復合物或因子Ⅺ濃縮劑以提高血漿蛋白C濃度。純合子患者除用雙香豆素預防外，一旦癥狀出現，必須給予替代治療。劑量決定于原有蛋白C的水平，蛋白C濃縮劑以39U/kg靜滴，每18h2次，可使蛋白C活性達到50%。一次輸注0.45U/kg的蛋白C濃縮劑可使血漿中蛋白C活性增高1%，有血栓形成者除上述治療外，應采用溶栓治療。獲得性者治療采用新鮮冷凍血漿和蛋白C濃縮劑，適當應用抗凝劑，用雙香豆素類藥物應小量開始，或先用肝素。