根據結石發生的部位不同，可分為以下幾類：
1、消化系統結石
消化系統結石包括膽石病（指發生在膽管和膽囊的結石）、胃腸結石等。其中，膽石病更為常見，根據病變部位的不同，又可分為以下三類：
（1）膽囊結石
主要為膽固醇結石或以膽固醇為主的混合性結石和黑色素結石。
（2）肝外膽管結石
又可分為原發性和繼發性兩類。原發性結石多為棕色膽色素類結石。繼發性結石主要為膽囊結石排進膽管并停留在膽管內所形成，故多為膽固醇類結石或黑色素結石。
（3）肝內膽管結石
又稱肝膽管結石，是我國常見而難治的膽道疾病。
2、泌尿、生殖系統結石
（1）尿路結石（又稱尿石癥）
①上尿路結石：包括腎結石、輸尿管結石。
②下尿路結石：包括膀胱結石、尿道結石。
（2）男性生殖系統結石
①前列腺結石：由前列腺液中的鈣鹽和磷酸鎂鈣化形成。
②精囊結石：在臨床上較為罕見，常發生于40歲以上男性，以血精、陰莖勃起時疼痛及射精時會陰部不適、精液中有結石為主要特征[1]。
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