腰椎穿刺成功后立即測定腦脊液壓力，然后留取腦脊液標本于3個無菌試管中，每個試管1～2ml。第一管作病原生物學檢驗，第二管作化學和免疫學檢驗，第三管作理學和細胞學檢驗。標本采集后應立即送檢，并于1h內檢驗完畢。
因標本放置過久，可造成細胞破壞、葡萄糖等物質分解、細菌溶解等，影響檢驗結果。腦脊液標本應盡量避免凝固或混入血液，若混入血液應注明，進行細胞計數時應做校正。
