按蛋白酶水解蛋白質的方式可分為以下幾種。
(1)切開蛋白質分子內部肽鍵,生成相對分子質量較小的多肽類,這類酶一般叫內肽酶;
(2)切開蛋白質或多肽分子氨基或羧基末端的肽鍵,而游離出氨基酸,這類酶叫外肽酶。作用于氨基末端的稱為氨肽酶,作用于羧基末端的稱為羧肽酶;
(3)水解蛋白質或多肽的脂鍵;(4)水解蛋白質或多肽的酰氨鍵。
