趙可吉博士Nature發布重要測序技術

　　DNase I超敏感位點（DHS）是對DNaseⅠ高度敏感的活性染色質區域。哺乳動物細胞的DHS定位，能夠提供轉錄調控元件和染色質狀態的重要信息，一直是科學家們的研究熱點。DNase測序（DNase-seq）是進行全基因組DHS分析的常用方法，不過DNase-seq需要數百萬細胞，大大限制了該技術的應用范圍。

　　美國NIH的研究團隊為此開發了在單細胞中檢測全基因組DHS的超靈敏策略，并將其命名為單細胞DNase測序（scDNase-seq）。這一成果發表在十一月二十五日的Nature雜志上，文章的通訊作者是NIH旗下心臟、肺和血液研究所的趙可吉博士。趙可吉博士1980年畢業于昌濰師范學院，1985年獲得東北師范大學碩士學位，1996年獲得日內瓦大學博士學位。在斯坦福大學接受博士后訓練后在NIH任研究員，2007年至今任高級研究員。曾在Cell、Nature、PNAS等權威雜志發表多篇研究性文章。

　　研究顯示，細胞之間的DHS模式是高度重復的。高表達的基因啟動子和增強子往往與活性組蛋白修飾有關，表現為組成性DHS。而組蛋白修飾較少的染色質區域表現為高度多樣化的DHS。進一步研究表明，單細胞DHS可以預測調控細胞特異性基因表達程序的增強子，細胞間的DHS多樣性預示著基因表達差異。

　　研究人員還用scDNase-seq研究了來自甲狀腺癌FFPE樣本的腫瘤細胞和正常細胞，鑒定了數千個腫瘤特異性DHS。他們發現，許多腫瘤特異性DHS與癌癥發展的關鍵啟動子和增強子有關。DHS分析揭示了甲狀腺濾泡狀癌中的重要突變，該突變會影響腫瘤抑制蛋白p53的結合，使其靶基因TXNL1的表達量減少。

　　這項研究向人們展示了在單細胞中檢測DHS的可靠方法，大大拓展了DHS分析在基礎研究和轉化研究中的應用。這樣的技術將為人們提供個性化醫療的關鍵信息。