1、肝臟本身的疾患，特別是各型病毒性肝炎、肝硬變、肝膿腫、肝結核、肝癌、脂肪肝、肝竇狀核變性均可引起不同程度的轉氨酶增高。除肝臟外，體內其它臟器組織如心、腎、肺、腦、睪丸、肌肉也都含有此酶。因此當心肌炎、腎盂腎炎、大葉性肺炎、肺結核、乙型腦炎、多發性肌炎、急性敗血癥、腸傷寒、流腦、瘧疾、膽囊炎、鉤端螺旋體病、流感、麻疹、血吸蟲病、擠壓綜合征等亦均可見血中轉氨酶增高。
2、因為轉氨酶是從膽管排出的，如果有膽管、膽囊及胰腺疾患，膽管梗阻，也可使轉氨酶增高。臨床常見的有膽囊炎、膽管蛔蟲、肝膽管細石、膽囊及膽管腫瘤、壺腹周圍癌、先天性膽管擴張癥、急慢性胰腺炎、胰頭癌及出血壞死性胰腺炎。藥源性或中毒性肝損害,以及藥物過敏都可引起轉氨酶增高，并常伴淤膽性黃疸和肝細胞損傷。臨床有報告在用藥12～48小時即可引起轉氨酶增高，4～10日可達高峰，及時停藥者多在3周內恢復正常。其它內科疾病，如患系統性紅斑狼瘡、甲狀腺功能亢進、糖尿病、惡性網狀細胞病、心力衰竭、風濕熱、消化性潰瘍、急慢性胃腸炎及尿毒癥等均可發生轉轉氨酶增高。正常妊娠、妊娠中毒癥、妊娠急性脂肪肝等也是轉氨酶增高的常見原因。另外，劇烈運動后亦可引起轉氨酶增高。
運動后乳酸含量增加，在體內積聚，乳酸代謝使機體相對缺氧及低血糖，造成肝細胞膜通透性增加，引起轉氨酶增高。此變化對于急性肝炎的診斷，慢性肝病的活動有十分重要的意義。正常值通過為40單位/升，由于檢測方法不同，各醫院的正常值可有一定差異，該酶活性的升高，可達數百至數千單位，和肝細胞受損的范圍可能有一定的關系。因為歷來病毒性肝炎的診斷總要檢測ALT值，而且ALT的升高在病毒性肝炎的診斷中有非常重要的意義，此外，膽道疾病、酒精性肝損、藥物性肝損、脂肪肝、心源性肝損等諸多疾病累及肝臟時ALT也都可升高。