高效液相色譜法的優缺點如下：
一、優點：分離效率高，選擇性好，檢測靈敏度高，操作自動化，應用范圍廣。與氣相色譜法相比具有的優點：不受試樣的揮發性和熱穩定性限制，應用范圍廣；流動相種類多，可通過流動相的優化達到高的分離效率；一般在啊室溫下分析即可，不需高柱溫。
二、缺點：分析成本高，液相色譜儀價格及日常維護費用貴，分析時間一般比氣相長。
液相色譜和質譜連接，可以增加額外的分析能力，能夠準確鑒定和定量像細胞和組織裂解液，血液，血漿，尿液和口腔液等復雜樣品基質中的微量化合物。
高效液相色譜質譜系統（ABSciex Eksigent LC / MS和LC / MS / MS）提供了一些獨特的優勢。該方法已成為化學、醫學、工業、農學、商檢和法檢等學科領域中重要的分離分析技術應用。
高效液相色譜法：
高效液相色譜法（High Performance Liquid Chromatography \ HPLC）又稱“高壓液相色譜”、“高速液相色譜”、“高分離度液相色譜”、“近代柱色譜”等。
高效液相色譜是色譜法的一個重要分支，以液體為流動相，采用高壓輸液系統，將具有不同極性的單一溶劑或不同比例的混合溶劑、緩沖液等流動相泵入裝有固定相的色譜柱，在柱內各成分被分離后，進入檢測器進行檢測，從而實現對試樣的分析。
