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    發布時間:2021-04-27 16:52 原文鏈接: TEM105編碼基因的克隆與原核表達

    由于一種細菌可同時產生多種β內酰胺酶,因此為了避免多種β內酰胺酶的相互干擾,我們應用肉湯稀釋法對產超廣譜β內酰胺酶( ESBLs )的 4 株肺炎克雷伯菌( Kpn )的 TEM 型編碼基因進行了原核表達。

    一、 材料和方法

    1. 菌株來源和表型鑒定: 4 株臨床菌株 No95 、 No96 、 No102 、 No106 為浙江省臺州第一醫院內科患者痰標本分離的 Kpn 。經抑制劑增強的肉湯稀釋法證實為陽性。

    2. 細菌質粒 DNA 提取與 PCR 擴增:采用堿裂解法提取質粒 DNA 。根據 TEM-1D 編碼基因序列設計的 TEM 引物序列為 5' -TTAGACGTCAGGTGGCACTT -3' ( 76 ~ 95 )和 5' -GGACCGGAGTTACCAATGCT -3' ( 1065 ~ 1084 ),由上海生物工程公司合成。 PCR 反應參數同前。設大腸埃希菌?( Eco ) ATCC25922 、標準產酶 Eco ( TEM-26 )作對照。

    3. PCR 產物的純化、克隆:按照 PCR 產物純化 kit ( QIAgen )的要求,純化目的片斷,取 3μl 與 pGEM-Teasy Vector(Promega) 連接。連接反應液轉化至 EcoDH 5a 感受態細胞,經含氨芐西林( Amp50μg/ml )的麥康凱培養基篩選。挑取白色菌落,接種于含 Amp 的 LB 培養液中, 37 ℃ 培養過夜。經 EcoRI ( Takara )酶切鑒定。

    4. 核苷酸序列測定及分析:以重組菌雙鏈質粒為模板,按 Sanger 雙脫氧末端終止法,于 Pharmacia 公司 ALF 自動測序儀進行雙鏈測序,結果在 GenBank 網上查詢。

    5. 接合試驗:按照 Jacoby 等的方法進行,其中 EcoC600 ( Str r ,即鏈霉素抗性)為質粒接和試驗的受體菌。

    6. 原核表達:分別加入 pET -28c 3 μl 、目的 DNA 3 μl 、 2 × Buffer5μl 和 T4 連接酶 2μl 于 0.5ml 的 Eppendorf 管中, 37 ℃ ,過夜。上述連接產物轉化于 EcoDH 5a 感受態細胞中,用的含卡那霉素 40μg/ml 的麥康凱培養基平板進行篩選。

    7. 表達鑒定:挑取白色菌落置于含 Amp 的 LB ( 50μg/ml )液中, 37 ℃ 振蕩過夜培養。堿裂解法提取質粒,并用 PCR 進行表達鑒定。

    8. 表型鑒定:用 ESBLs 濃度梯度法進行表型鑒定。

    9. 等電點( pI )測定:超聲破碎獲得酶的粗提液。按照 PhastSystem 電泳儀說明書和 Pharmacia Biotech 凝膠要求進行,電泳后,用頭孢硝噻吩染色,標準蛋白用考馬斯亮藍 R-250 染色,用 CurveExpert1.3 軟件計算 pIs 。

    二、 結果

    1. 接和試驗: 4 株臨床菌株結果均為陽性,其相應接合子分別為 C95 、 C96 、 C102 和 C106 。堿裂解法提取質粒,并用 TEM 引物進行 PCR 擴增,結果顯示:臨床菌株和相應接合子的質粒在 1009bp 處均可見到一電泳條帶,與標準菌株( TEM-26 )的擴增片段大小一致,而 C600PCR 擴增結果為陰性。表明這種 TEM 型 β內酰胺酶的基因位于質粒上。

    2. 基因型鑒定:用 TEM 引物對 4 株臨床菌株進行 PCR 擴增,其結果均為陽性,其片段大小近 1009bp ,與標準菌株( TEM-26 )的擴增片段大小一致,而空白對照和 EcoATCC25922 的結果為陰性。這些片段經序列分析,結果顯示: 4 株細菌的序列均為 1009bp ,與廣譜酶 TEM-1 相比較,其序列有 6 個位點的改變,即第 124 位、第 8 位、第 48 位、第 134 位、第 160 位和第 242 位( gga → ggg ),相應的氨基酸只有第 124 位的絲氨酸變為天冬酰胺。我們首次登錄 GenBank ,并被命名為 TEM-105 。

    3. TEM-105 的特性研究:用 ESBLs 濃度梯度法進行鑒定,標準產 TEM-26 菌株的原核表達菌為陽性,而 4 株臨床菌株的 TEM 型基因的原核表達菌均為陰性,表明 TEM-105 為非 ESBLs 。等電聚焦電泳結果顯示該酶的 pI 為 5.4 。

    三、 討論

    本研究的,標準菌株( TEM-26 )經 TEM PCR 擴增后的目的片段,與 pET -28c 連接后,可成功地在 EcoDH 5a 感受態細胞中表達,這表明原核表達用于某種 β內酰胺酶的研究是可靠的。此外,質粒接合試驗證實了其耐藥基因位于質粒上。這表明,盡管由于點突變未引起β內酰胺酶活性部分的空間構象改變,所以未引起酶性質的改變。

    通過對 KpnTEM 型 編碼基因的研究,在世界上首次報道了 TEM-105 ,并證明其為廣譜酶性質。


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