大連化物所等肝癌代謝組學研究取得進展
近日，中科院大連化學物理研究所許國旺研究員領導的高分辨分離分析及代謝組學研究團隊(1808組)與上海東方肝膽醫院王紅陽院士課題組合作，將基于液相色譜-質譜用于肝癌組織非靶標代謝組學研究并取得了重要進展，相關研究成果已經在線發表在Cancer Research雜志上。 原發性肝癌是全球最常見的惡性腫瘤之一，具有高發病率和死亡率。由于肝癌進展迅速和早期轉移等特征，在臨床上早診困難，治療預后效果差。深入了解肝癌的發病機理對制定治療方案，改善治療效果，降低肝癌發病率和死亡率都有重要的意義。組織代謝組學方法是研究肝癌代謝異常的有力工具，可為肝癌發病機理的闡明和新型診斷標志物的發現提供依據。 研究者基于超高效液相色譜-高分辨質譜分析平臺，對50例肝癌患者的癌組織、癌旁近端組織和遠端組織進行了非靶標代謝譜分析，結合多變量數據處理方法和生物信息學技術，從整體層面闡明了肝癌微環境的代謝紊亂狀況。研究結果表明，肝癌患者出現了大量......閱讀全文
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料：SIMCA - P 多變量統計軟件 ?? 試劑、試劑盒：[ 1H ] - NMR 抽提劑 ? ? ?儀器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?NMR 管 ? ?
代謝組學全流程解決方案
賽默飛基于其超高分辨的靜電場軌道阱（Orbitrap）質譜平臺結合其功能強大的軟件平臺，提供代謝組學全流程解決方案。該方案不僅覆蓋從極性代謝物到非極性代謝物的全面檢測、峰提取與定量、統計學分析與可視化作圖、代謝產物的全面鑒定、代謝通路分析等全流程的要求，而且還整合了從非靶標生物標記物發現到靶標生物標
臨床代謝組學研究常見問題
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。Q：如何設置驗證集和測試集？A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這幾個數據集概念，通常
質譜儀在代謝組學和代謝研究中有著杰出表現
質譜儀以離子源、質量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過多的能量會進一步碎裂成較小質量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場作用下獲取具有相同能量的平均動能而進入質量分析器。質量分析器是將同時進入其中的不同質量的離子，按質荷比m/e大小分
【JOAT劉虎威編者按】專題：代謝組學和脂質組學
劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編。 近日，劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編進行了約稿審稿工作，并撰寫了題為“專題：代謝組學和脂質組學”的編者按。 代謝
AFADESI空間代謝組學高級研修班
為做好AFADESI空間代謝組學技術服務工作，由中國科學院高能物理研究所測試中心和中國科學院-香港大學金屬組學與健康和環境聯合實驗室共同承辦的“AFADESI空間代謝組學高級研修班”將于2023年4月26日-4月27日在京召開。在這里，我們將竭誠為您提供豐富的前沿應用信息和與專家零距離交流的平臺
代謝組學：一項艱巨的任務
學生化的孩子真是傷不起。糖代謝、脂代謝、核酸代謝，一系列代謝通路，一大堆代謝產物，簡直讓人頭暈眼花。然而，這又不能跳過。畢竟，DNA編碼蛋白質，而蛋白質在小分子上發揮其魔力。但很多時候，科學界對這些分子一無所知。 “如果你測定一滴血中的小分子，大約60% 所檢測到的峰都無法與任何代謝物相匹配，
島津非靶向代謝組學解決方案
?????本文內容非商業廣告，僅供專業人士參考。關于島津? ? ? 島津企業管理（中國）有限公司是（株）島津制作所于1999年100%出資，在中國設立的現地法人公司，在中國全境擁有13個分公司，事業規模不斷擴大。其下設有北京、上海、廣州、沈陽、成都分析中心，并擁有覆蓋全國30個省的銷售代理 ????
臨床代謝組學研究常見問題（一）
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。 Q：如何設置驗證集和測試集？ A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這
代謝組學常使用的數據庫
代謝組主要是對小分子代謝物（一般50-1500 Da）進行高通量定性和定量分析，代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據，方便后續的代謝組學數據分析，揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD
綜述：代謝組學在疾病中的應用
代謝組學經歷了迅猛的技術演化在過去二十年。尤其是廣泛靶向代謝組學技術的新起，實現一次性檢測堅定上千種物質，同時能夠定量。整合了非靶向和靶向代謝物檢測技術的優點，創造性實現了高通量、高靈敏度靶向代謝物檢測，為定性、定量檢測大批量、低豐度代謝物提供了高效的方法。 應用代謝組學的定義事件的預測生
臨床代謝組學研究常見問題（一）
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。 Q：如何設置驗證集和測試集？ A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這
利用精確血漿代謝組學方法揭示衰老相關代謝特征
過去二十年里，代謝（脂質）組學研究得到了迅速發展。液相色譜與高分辨質譜聯用（LC-HRMS）技術是目前內源性代謝物最常用的手段，然而困擾LC-HRMS技術的分析精度和結構鑒定的瓶頸問題仍然存在。尤其是血漿樣本，其組分化學性質各異，同時復雜的基質會顯著減低代謝物定性與定量結果的準確性，導致生物學信
Cell提出一個新“組學”：蛋白質代謝小分子互動組學
科學家們提出了一個新的“組學”——一個處理蛋白質和小分子之間相互作用的互動組學（protein-metabolite interactomics）。此前系統生物學家專注于基因組學或蛋白質組學，現在他們日益發現了蛋白質-代謝小分子之間相互作用的重要性。 基因組學針對的是生物體基因的系統分析，而蛋
非靶向代謝組學中鑒定代謝產物適宜選用哪些分析方法
據相關科技要聞解讀表明非靶向代謝組學已逐步成為研究生命活動的重要基礎。它可高清呈現代謝產物的變化規律以及代謝種類，特別是那些評價高的非靶向代謝組學更是揭開了研究集體生命活動發生和發展的本質，現在就非靶向代謝組學中鑒定代謝產物更適宜選用哪些分析方法作簡要闡述：1.主成分分析（PCA）非靶向代謝組學中鑒
Agilent與Stemina－宣布代謝組學領域的合作
Agilent與Stemina 生物標記物發現公司宣布共同促進 Stemina 的代謝組學研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷倫科技公司(紐約證交所：A)與 Stemina 生物標記物發現公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，兩家公司
LCMS8060助力廣泛靶向代謝組學研究
mGWAS (metabolome ?Genome-Wide Association ?Study)指基于代謝組學的全基因組關聯分析，是將代謝組數據作為表型，與基因型數據進行關聯分析的一種方法。由于代謝組數據對表型鑒定更為精細，因此關聯分析的精度比傳統GWAS分析更高。?海南大學和華中農業大學的羅杰
代謝組學的優勢、應用及研究內容介紹
我們知道細胞內的生命活動由眾多基因、蛋白質、以及小分子代謝產物來共同承擔，而上游的（核酸、蛋白質等）大分子的功能性變化最終會體現于代謝層面，如神經遞質的變化、激素調控、受體作用效應、細胞信號釋放、能量傳遞和細胞間通訊等，所以代謝組處于基因調控網絡和蛋白質作用網絡的下游，所提供的是生物學的終端信息
代謝組學的優勢、應用及研究內容介紹
我們知道細胞內的生命活動由眾多基因、蛋白質、以及小分子代謝產物來共同承擔，而上游的（核酸、蛋白質等）大分子的功能性變化最終會體現于代謝層面，如神經遞質的變化、激素調控、受體作用效應、細胞信號釋放、能量傳遞和細胞間通訊等，所以代謝組處于基因調控網絡和蛋白質作用網絡的下游，所提供的是生物學的終端信息
Science：逆轉傳統認知，代謝組學揭示重要機制
來自Weill Cornell醫學眼的研究人員在新研究證實氨基水楊酸(PAS)一種常用于治療結核病(TB)的藥物，通過在葉酸合成中的一種關鍵酶加工分解成不同的產物，干擾了隨后在這條信號通路中起作用的酶。這一發表在11月1日《科學》(Science)雜志上的研究與從前認為其只與酶結合，而并未參
Agilent與Stemina－宣布代謝組學領域的合作
Agilent與Stemina 生物標記物發現公司宣布共同促進 Stemina 的代謝組學研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷倫科技公司(紐約證交所：A)與 Stemina 生物標記物發現公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，兩家公司
代謝組學在疾病診斷中的應用
代謝組學? （metabolomics）的出現是生命科學研究的必然。在20世紀90年代中期發展起來的代謝組學，是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產物進行定性和定量分析的一門新學科。代謝組作為系統生物學的重要組成部分，在臨床醫學領域具有廣泛的應用前景。 代謝產物是基因表達的最終
當代謝組學技術遇到單細胞測序技術
代謝組的狀態是對遺傳因素、外部環境和治療干預等信息的綜合反映，因此是一個跟蹤和了解上述因素對表型影響的理想研究目標。代謝組可做多種樣品類型、結果富含各種信息、可作為連接其他組學數據與表型之間的橋梁。過去20年，組學研究飛速發展，處于中心法則末端的代謝組學雖然起步較晚但是發展很快。很多組學研究目前已進
代謝組學的優勢、應用及研究內容介紹
我們知道細胞內的生命活動由眾多基因、蛋白質、以及小分子代謝產物來共同承擔，而上游的（核酸、蛋白質等）大分子的功能性變化最終會體現于代謝層面，如神經遞質的變化、激素調控、受體作用效應、細胞信號釋放、能量傳遞和細胞間通訊等，所以代謝組處于基因調控網絡和蛋白質作用網絡的下游，所提供的是生物學的終端信息。如
Cell重磅！揭秘肝癌多維蛋白組學最新成果
2019年10月3日，國際頂尖期刊《cell》(SCI影響因子 36.216)在線發表了復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士團隊、中科院藥物所周虎研究員團隊、中科院生化與細胞所高大明研究員團隊、美國“登月計劃”臨床蛋白質組腫瘤分析協作組(Clinical Proteomic Tumor Analysis
科學家繪制肝癌藥物基因組學“藍圖”
8月1日，國際學術期刊Cancer Cell 在線發表了中國科學院生物化學與細胞生物學研究所惠利健研究組、中國科學院上海營養與健康研究所李亦學研究組、第二軍醫大學附屬東方肝膽外科醫院張海斌研究組以及南京大學醫學院附屬鼓樓醫院施曉雷合作的題為A Pharmacogenomic Landscape
第一屆全國代謝組學及蛋白質組學雙星峰會
繼測序之后，基于質譜技術的代謝組學及蛋白組學于生命科學研究領域發展迅速。應用質譜技術從分子層面對生命體進行動態、精準的檢測，可以了解生命體內代謝與蛋白整體水平的變化，為基礎科學研究提供新方向。 為了貫徹 “兩城一中心”的戰略，江北新區繼基因測序平臺后，又重磅打造了質譜檢測平臺，旨在服務生命
大熊貓乳汁蛋白質組學和代謝組學國際合作獲進展
國家國際科技合作專項項目“大熊貓乳蛋白的分析及人工乳的研制”承擔單位成都大熊貓繁育研究基地聯合英國格拉斯哥大學首次對大熊貓乳汁展開了蛋白質組學和代謝組學研究，取得了階段性進展。雙方研究人員通過非麻醉的方式采集馴化后的大熊貓母乳，連續采集至幼仔出生后180天，并對乳汁進行了蛋白組學和代謝組學的研
J－Proteome－Res:－代謝組學應用于微囊藻毒素代謝研究
微囊藻毒素(MCLR)，作為一種肝毒素，正在威脅著人類的公共衛生安全。在體內，肝臟是MCLR主要攻擊的器官，然而具體代謝變化目前任然未知。近日，中國科學院水生生物研究所謝平等研究人員在與上海敏芯信息科技公司的合作下，通過對灌服MCLR的大鼠模型進行代謝組學的研究，向我們揭示了MCLR擾亂肝臟代謝
告別平均！單細胞代謝組學技術“精準簽發”每個細胞的代謝履歷
在生命科學研究領域，代謝組學致力于剖析生物體代謝物的奧秘。傳統代謝組學研究聚焦群體細胞，忽略了細胞間的代謝異質性，使得單個細胞的獨特特征被群體平均屬性掩蓋，難以滿足精準研究需求。單細胞代謝組學應運而生，它能深入細胞亞群精準分析，挖掘被忽視的關鍵信息。單細胞代謝物濃度極低且代謝物無法擴增，導致對檢