Nature:一種用于測序非模式物種的新方法
被子植物(即開花植物)是主要的作物植物,并且在碳匯中具有至關重要的作用。因此,對它們的起源進行分析,將為我們提供關于這些作用起源的重要線索。之前的證據強烈暗示,無油樟科是所有其他現存開花植物的姊妹種系的單一生物物種。在3篇最近的文章中,無油樟基因組研究團隊和其他作者發布了一種新方法,用于測序非模式物種,例如無油樟現有的基因組,同時提供了證據,表明令人驚訝的大量水平基因轉移事件為其線粒體基因組做出了貢獻。 Chamala等人描述了一種針對具有大型以及復雜基因組的非模式物種的新的測序和組裝流水線策略。他們首先利用一種Illumina和 Sanger公司的細菌人工染色體末端組合制造了一種全基因組。他們隨后利用原位雜交中的熒光反應評估了裝配的準確性,這是之前以這種方式未曾探索過的一種技術。最終,為了進一步改進裝配的接觸性,他們完成了全基因組繪圖(正式名稱為光學映射),這使得基因組片段的限制性內切酶的順序成為可能,即關閉了組......閱讀全文
植物線粒體制備及其亞結構分級分離實驗
實驗材料黃化苗 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?試劑、試劑盒勻漿緩沖液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?清洗緩沖液 ?
國家基因庫研發線粒體基因組重要新應用
繼啟動萬種動物線粒體基因組計劃(MT10K, https://www.mt10k.org)之后,深圳國家基因庫成功研發出一套應用線粒體基因組監測生物多樣性的宏線粒體基因組重測序方法(mitochondrial metagenomics,以下簡稱“全線粒體混合多樣性分析法”)。此方法高效、準確且可
植物轉基因技術
1)農桿菌介導轉化法 將外植體放入含有外源基因的農桿菌(Agrobacteriumtume/ociens)菌液中浸泡,然后轉入共培養基,再轉入篩選培養基誘導抗性愈傷組織和抗性芽,生根后的抗性植株移栽至營養缽生長。(2)基因槍法 又稱微彈轟擊法。其基本原理是將外源DNA黏附在微小的金粒或鎢粒表面,然后
植物雌雄-基因可辨
大多數人不知道的一點是,我們在超市里購買的黃瓜是純粹的“女性”——它們由精心雜交培育的、只生產雌花的植株生長而來。長久以來,農民們都知道“女性”因素對于農作物成功的重要性:雌花比例越高,種子和果實的產量越大。最近,科學家揭示了植物性別決定的分子基礎。 在《科學》上發表的一篇文章中,以色列巴伊
植物基因轉化技術
相關知識植物基因轉化技術是指將外源基因導入植物細胞或組織,獲得轉基因植物的技術。植物基因轉化技術總體上可分為兩大類:1 以生物體為介導的基因轉移法;2 DNA直接導入法。前者如農桿菌介導法,植物病毒介導法;后者如基因槍法、電擊法、聚乙二醇法、脂質體法及花粉管通道法。其中應用最廣的是根癌農桿菌介導法。
PNAS:為什么線粒體保留自身基因組
這聽起來像科幻小說,認為人體內的每一個細胞都是由一個具有基因組的微小細胞器所占據,我們與其存在共 生關系。但是在現實中,真核生物的生命依賴于線粒體,它以三磷酸腺苷的形式給細胞提供能量(ATP)。幾 千年來,線粒體的基因組是在最小基因含量的選擇下進化的,但是研究者們一直無法確定“為什么有些線粒體基
線粒體或能改變機體的代謝和基因表達!
大約15億年前,微小的訪客來到細胞中生活,隨后這些細胞進化成為植物和動物生命(包括人類),這些訪客就是線粒體,其是一種小型的細胞器,能夠產生細胞生存所需要的大約90%的化學能量,從進化學的角度來講,人類、動物和植物實際上是兩種有機體的完美結合。線粒體擁有自身的DNA,人類細胞的線粒體有13個基因
英國議會批準“三親線粒體”基因療法
當地時間2月3日,英國下議院以壓倒性多數通過決議,允許英國研究人員繼續開展一種可以防止某些類型遺傳疾病的新生育療法。這種被稱為線粒體DNA替代療法的技術,能讓線粒體基因中攜帶致病突變的女性產下基因上相關但沒有線粒體疾病的孩子。 該項舉措一直頗具爭議,尤其是因為它會改變胚胎DNA,而且這種方式
關于線粒體基因組的大小的介紹
已知的是哺乳動物的線粒體基因組最小,果蠅和蛙的稍大,酵母的更大,而植物的線粒體基因組最大。人、小鼠和牛的線粒體基因組全序列已經測定,都是16.5 kb左右。每個細胞里有成千上萬份線粒體基因組DNA拷貝。果蠅和蛙的細胞里有多少個線粒體以及每個線粒體有多少份DNA拷貝,還沒有準確的數字。估計線粒體D
植物線粒體制備及其亞結構分級分離實驗(二)
3.5 純度鑒定可以通過各種細胞器標志性酶的活性來確定線粒體的污染程度。過氧化物酶體可以鑒定過氧化氫酶、羥基丙酮酸還原酶或者乙二醇氧化酶的活性;葉綠體可以用葉綠素含量,白色體可以用類胡蘿卜素的含量或堿性焦磷酸酶的活性;乙二醛循環體可以用異檸檬酸裂解酶的活性;內質網可以用對抗霉素 A 不敏感的細胞
植物線粒體制備及其亞結構分級分離實驗(一)
實驗材料?黃化苗試劑、試劑盒?勻漿緩沖液清洗緩沖液Percoll 梯度溶液儀器、耗材?分光光度計實驗步驟 在選好植物材料和勻漿緩沖液后,接下來關鍵的因素包括勻漿方法、緩沖液的 pH、使用的緩沖液與植物組織之間的比例、研磨時間及溫度等(見注釋 5) 。3.1 勻漿根據植物組織的不同可以采取不同的勻漿方
線粒體基質的線粒體結構
線粒體基質 線粒體基質是線粒體中由線粒體內膜包裹的內部空間,其中含有參與三羧酸循環、脂肪酸氧化、氨基酸降解等生化反應的酶等眾多蛋白質,所以較細胞質基質黏稠。蘋果酸脫氫酶是線粒體基質的標志酶。線粒體基質中一般還含有線粒體自身的DNA(即線粒體DNA)、RNA和核糖體(即線粒體核糖體)。 線粒體
基因槍活體植物基因轉染
本實驗所用基因傳遞系統(基因槍)原理:低壓基因遞送系統(GDS-80 基因槍 U.S. Patent Number: 6,436,709 B1),根據火箭噴嘴原理和空氣動力學原理設計,是用于傳遞生物微粒進入靶細胞的一種新型系統。如圖1中所示,當左側出現輸入氣體壓力時(如:氦氣),兩個腔室之間將形成巨
關于線粒體腦肌病的基因治療介紹
基因治療策略包括降低突變型mtDNA/野生型mtDNA的比例、使用錯位表達及異質表達、輸入其他同源性基因以及利用限制性內切酶修復突變型mtDNA等。如用人胞質體(含正常線粒體無細胞核的細胞)對缺陷細胞(含缺陷mtRNA,呼吸鏈功能減退的細胞)進行基因補救治療,能成功地使缺陷細胞呼吸鏈功能恢復正常
線粒體全基因組測定揭示家雞馴化史
為探討家雞的馴化歷史,中科院昆明動物研究所的研究人員發現了家雞較為清晰的母系遺傳背景信息。該研究成果日前在線發表于國際期刊《遺傳》。 據介紹,從肉蛋供應到供人娛樂,家雞在人類生產生活中扮演著重要角色。在被馴化之后,家雞跟隨人類擴散到世界各地,成為飼養最為廣泛的家禽。而家雞的馴化問題,自達爾
Nature子刊:基因改造線粒體-延長壽命
線粒體(mitochondrion),是細胞的“能量工廠”,線粒體內有一套獨立于細胞核的遺傳物質——線粒體DNA(mtDNA)。由于線粒體在能量穩態中的重要作用,因此,線粒體障礙會導致多種疾病發生,包括發育障礙、神經肌肉疾病、代謝疾病、癌癥進展等等。 此外,線粒體功能障礙在衰老過程中也發揮著重
葉綠體和線粒體基因組變異檢測獲突破
近日,《公共科學圖書館―綜合》發表了中國農業科學院油料作物研究所博士后曾長立與合作導師伍曉明研究建立的能高通量檢測葉綠體和線粒體基因組遺傳變異的新方法。 據曾長立介紹,葉綠體和線粒體基因組作為植物細胞質基因組,對光合作用、呼吸作用等重要生命過程具有重要意義。 研究葉綠體和線粒體基因組
科學家首次用TALENs技術編輯線粒體基因
美國的研究人員開發出一種新方法來清除線粒體內的突變DNA,從而有望治療多種線粒體病。據介紹,這也是TALENs技術首次用于線粒體基因的編輯。這項研究成果于8月4日在線發表在《Nature Medicine》上。 線粒體病通常是由突變的線粒體DNA(mtDNA)引起的,在大部分情況下它與
廣州健康院發現線粒體基因編碼第14個蛋白質的“線粒體約定”新模式
5月3日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院劉興國課題組在《細胞-代謝》(Cell Metabolism)上發表了題為A novel protein CYTB-187AA encoded by the mitochondrial gene CYTB modulates mammalian early
植物基因轉化常用方法
一. 植物遺傳轉化的方法 植物遺傳轉化技術可分為兩大類:一類是直接基因轉移技術,包括基因槍法、原生質體法、脂質體法、花粉管通道法、電激轉化法、PEG介導轉化方法等,其中基因槍轉化法是代表。另一類是生物介導的轉化方法,主要有農桿菌介導和病毒介導兩種轉化方法,其中農桿菌介導的轉化方法操作簡便、成本低、轉
植物基因轉化常用方法
一 植物遺傳轉化的方法 植物遺傳轉化技術可分為兩大類:一類是直接基因轉移技術,包括基因槍法、原生質體法、脂質體法、花粉管通道法、電激轉化法、PEG介導轉化方法等,其中基因槍轉化法是代表。另一類是生物介導的轉化方法,主要有農桿菌介導和病毒介導兩種轉化方法,其中農桿菌介導的轉化方法操作簡便、成本低、轉
轉基因植物中的篩選基因
基因工程(DNA重組技術)是在離體條件下對不同生物的遺傳物質(DNA)進行人為“加工”,并按照人們的意愿重新組合,以改變生物的性狀和功能,然后再通過適當的載體將重組DNA轉入生物體或細胞內,并使其在生物體內或細胞中表達,從而獲得新的生物機能。這種利用基因工程技術獲得的植物一般稱為“基因工程植物”。自
通用型植物線粒體DNA萃取試劑盒產品說明書
通用型植物線粒體DNA萃取試劑盒產品說明書(中文版) 主要用途 通用型植物線粒體DNA萃取試劑是一種旨在通過物理或化學破膜及離心處理方法,從植物細胞或組織中分離出完整而純化的線粒體細胞器,然后進一步生物酶處理以獲得高質量的線粒體DNA的權威而經典的技術方法。該技術經過精心研制
通用型植物線粒體DNA萃取試劑盒使用說明(二)
植物細胞或原生質體線粒體DNA分離(物理法) 實驗開始前,將試劑盒里的凈化液(Reagent C)凍融,然后移出1毫升凈化液(Reagent C)和4毫升的裂解液(Reagent B)到15毫升錐形離心管里,混勻后,標記為裂解工作液,置入冰槽里備用。然后進行下列操作。 準備5 X 107植物細胞或原
通用型植物線粒體DNA萃取試劑盒使用說明(一)
主要用途 通用型植物線粒體DNA萃取試劑是一種旨在通過物理或化學破膜及離心處理方法,從植物細胞或組織中分離出完整而純化的線粒體細胞器,然后進一步生物酶處理以獲得高質量的線粒體DNA的權威而經典的技術方法。該技術經過精心研制、成功實驗證明的。適合于各種新鮮植物組織,包括葉片(leaf)、谷粒(grai
相分離調控線粒體基因組空間秩序的模型
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員劉興國團隊聯合清華大學、南方科技大學、北京大學、香港中文大學等科研人員,研究發現線粒體基因組與其結合蛋白,利用生物分子最基礎的自發聚集的相分離性質,調控線粒體類核的組裝以及轉錄的復雜過程,構建了首個相分離調控線粒體基因組結構與功能的模型。相關研究10月28日在
英國利茲大學:發現與線粒體肌病相關的基因
英國利茲大學近日發布新聞公報稱,該校研究人員與倫敦大學學院以及荷蘭、意大利同行合作研究發現,MICU1基因突變與一種特定的大腦與肌肉疾病——線粒體肌病有密切關聯。這是研究人員首次明確線粒體肌病與基因缺陷的直接聯系,為了解這一疾病的遺傳病因提供了寶貴線索,對未來新療法的開發具有重要意義。 線粒體
壽命受母系遺傳影響更大-線粒體基因影響后代壽命
英國新一期《自然》雜志刊登一項最新研究稱,壽命受母系遺傳影響更大,因為線粒體中的一些基因變異會影響后代壽命,而線粒體基因組只屬于母系遺傳。 這項研究由德國馬克斯·普朗克研究所和瑞典卡羅琳醫學院研究人員共同完成。他們通過動物實驗發現,如果在雌性實驗鼠的線粒體DNA中誘發一些特定的基
細胞質雄性不育與線粒體基因組
根據研究,線粒體基因組的變異重組與 CMS 的關系最為密切。通過對不同材料的 CMS 系和保持系線粒體 DNA 的 RFLP、RAPD、AFLP 等多態性分析表明,CMS 系和保持系在線粒體基因組結構上具有顯著差異。這可能與植物線粒體基因組自身的特點有關。與動物和真菌的線粒體基因組比起來,植物線粒體
北京基因組所揭示線粒體基因組氧化損傷修復分子機制
線粒體是真核生物細胞主要的能量代謝場所,其中呼吸鏈氧化磷酸化過程伴隨有高水平的氧自由基(ROS)的產生。線粒體基因組缺乏組蛋白結合保護,所以容易受到ROS攻擊而發生損傷,其突變的累積已證實與多種人類疾病(如神經退行性病變、糖尿病、心血管疾病和癌癥等)的發生密切相關。有關核基因組DNA損傷修復分子