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    BMCBiology:含Cas酶的新型轉座子

    轉座子是一種可移動的遺傳元件,能夠在基因組的不同位點之間跳躍,這種DNA片段廣泛存在于自然界的各種生物中。近日,科學家們在細菌和古生菌中發現了一類新型的轉座子,這種轉座子不僅含有Cas內切酶的編碼基因,還依賴這種酶整合到新的基因組區域。 細菌一直在與病毒或入侵核酸(質粒)進行斗爭,為此它們演化出了多種防御機制。CRISPR/Cas適應性免疫系統就是其中之一。在CRISPR和Cas的幫助下,細菌可以經由小RNA分子的引導,靶標和沉默入侵者遺傳信息的關鍵部分。 現在,CRISPR與Cas9的組合已經成為了一個通用工具,被用來對真核生物進行位點特異性的基因組編輯。這種新興的基因組編輯工具,引起了人們極大的研究熱情。 在這項新研究中,法國巴斯德研究所和美國國家生物技術信息中心的研究人員,比較了幾種古生菌和細菌的基因組序列。他們發現,這些基因組編碼Cas1蛋白的區域,表現出了可移動遺傳元件的特征。 “Cas1持續出現在這些轉座......閱讀全文

    Science重要成果:人類癌癥反轉錄轉座子圖譜

      在人類基因組中,稱為反轉錄轉座子(retrotransposon)的小DNA元件通過自我復制和重新插入到基因組的多個位點從而具有造成突變性破壞的潛力。正常的成人細胞通過抑制機制阻止這些元件四處跳躍,然而根據發表在6月28日《科學》(Science)雜志上的一篇研究報道,這些機制在某些癌癥中可能發

    關于反轉錄轉座子的基本信息介紹

      反轉座作用出現在真核生物,包括能自由地感染宿主細胞的反轉錄病毒,以及通過以RNA為中介進行轉座的DNA序列。除反轉錄病毒外,反轉錄轉座子可以分成兩類:一類是病毒超家族(viral superfamily),這類反轉錄轉座子編碼反轉錄酶或整合酶(integrases),能自主地進行轉錄,其轉座的機

    關于反轉錄轉座子的基本信息介紹

      反轉錄轉座子(retrotransposon或retroposon)指通過RNA為中介,反轉錄成DNA后進行轉座的可動元件。這樣的轉座過程稱為反轉座作用(retrotrans—position)。  反轉座作用出現在真核生物,包括能自由地感染宿主細胞的反轉錄病毒,以及通過以RNA為中介進行轉座的

    Nature子刊:轉座子系統助力腫瘤研究

      明尼蘇達大學共濟會癌癥中心的研究人員,開發了惡性外周神經鞘腫瘤MPNST的小鼠模型,并在其中鑒定了引發這類癌癥的新基因和通路,文章于本周發表在Nature旗下的Nature Genetics雜志上。   David Largaespada教授領導的研究人員,為了鑒定促進MPNST發展的遺傳

    PNAS:衰老過程的罪魁禍首――轉座子

    多年來,科學家們一直在研究遺傳因素對衰老的貢獻,但是成果甚少。最近,一項新的研究闡明了轉座子在加速衰老過程中的作用。在過去的十年中,科學家們已經開始認識到非編碼序列在我們基因組中所起的重要生物作用。一種特別“狡猾”的非編碼元件――高度重復的轉座子,能將自己插入到我們基因組中任何可訪問的部分,從而有可

    Cell:永不停息的基因戰爭

      我們的細胞中進行著激烈的基因戰爭,入侵的外源DNA頻頻試圖破壞人類的基因藍圖。現在,加州大學舊金山分校UCSF的研究人員發現了,細胞保護自身基因抵抗入侵者的新分子機制。   這一機制負責識別和靶標外源DNA,被研究人員稱為SCANR。UCSF的研究人員是在酵母中發現SCANR機制的,由于酵母與

    X射線輻照在候選放射抗性基因的作用

    用轉座子進行全面的基因篩選是系統鑒定抗性基因的新方法。本研究旨在利用該技術鑒定食管鱗狀細胞癌中的候選放射抗性基因。轉座子是一種堿基序列,可以隨機轉換到基因組中的另一個位置。通過在轉座子中插入巨細胞病毒啟動子作為轉錄激活因子,新位置的下列基因變得過表達,位于轉座子插入位點的基因被下調。因此,可以獲得使

    轉座子插入是白菜馴化表型變異的重要來源

      近日,《植物生物技術雜志》(Plant Biotechnology Journal)在線發表了中國農業科學院蔬菜花卉研究所王曉武團隊完成的研究論文。這是王曉武團隊在前期白菜泛基因組研究基礎上,進一步挖掘白菜基因組變異獲得的研究成果。  王曉武介紹,轉座子序列廣泛存在于植物基因組中,在作物馴化中發

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    近日,《植物生物技術雜志》(Plant Biotechnology Journal)在線發表了中國農業科學院蔬菜花卉研究所王曉武團隊完成的研究論文。這是王曉武團隊在前期白菜泛基因組研究基礎上,進一步挖掘白菜基因組變異獲得的研究成果。 王曉武介紹,轉座子序列廣泛存在

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    Gene-Dev:研究發現抗癌基因有助于控制“跳躍”基因

      所有腫瘤中約有一半具有基因p53的突變,通常負責抵御癌癥。現在,UT西南大學的科學家發現了p53在對抗腫瘤中的新作用:防止逆轉座子或“跳躍基因”在人類基因組中跳躍。研究小組發現,在p53缺失或突變的細胞中,逆轉座子的移動與擴增比平時更為常見。這一發現可能會導致檢測或治療具有p53突變的癌癥的新方

    我國創建世界上最大轉座子插入資源庫

       不知你有沒有注意到,從菜市場買回來的玉米,有的是黃燦燦的,有的卻像個大花臉,中間夾雜著紫色、白色的玉米粒?  其實,這是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活躍的轉座子,它們就像一支“小畫筆”,跳到哪個基因上,就會抹去那里本來的“顏色”。因此導致籽粒顏色變化有一部分是轉座子運動產生的。  轉座

    X射線輻照在候選放射抗性基因下面的作用有哪些?

      本研究旨在利用該技術鑒定食管鱗狀細胞癌中的候選放射抗性基因。   轉座子是一種堿基序列,可以隨機轉換到基因組中的另一個位置。通過在轉座子中插入巨細胞病毒啟動子作為轉錄激活因子,新位置的下列基因變得過表達,位于轉座子插入位點的基因被下調。因此,可以獲得使用轉座子方法具有差異過表達或下調基因的各

    轉座子活動與染色質高級結構進化奧秘

      近日,華中農業大學棉花遺傳改良團隊發表相關研究論文,首次公布了棉屬中比四倍體棉花基因組更大的K2基因組,并對A2基因組和D5基因組進行了升級,發現基因組特異的轉座子擴增導致了基因組擴張,通過比較三維基因組研究揭示了年輕的轉座子擴增伴隨著棉屬特異的染色質高級結構形成。  棉花(Gossypium)

    研究發現水稻轉座子受馴化選擇和抗病抗逆中的調節功能

      6月19日,Molecular Plant 雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所何祖華研究組題為Elimination of a retrotransposon for quenching genome instability in modern rice 的研究

    表觀遺傳調控水稻重要農藝性狀研究獲進展

      轉座子(transposon)是一段自身能夠插入到基因組上的DNA片段,上世紀40年代,芭芭拉·麥克林托克(Barbara McClintock)首先在玉米中發現了轉座子。從簡單的細菌到復雜的人類,轉座子廣泛存在。轉座子隨機插入到重要基因中,會引發疾病、癌癥和其他生理缺陷。DNA甲基化、組蛋

    美科學家發現自私DNA-在進化中起重要作用

      自然界中的基因有千萬種,哪類基因最為常見和最為豐富?由美國南佛羅里達州立大學、圣迭戈州立大學和芝加哥大學科學家組成的研究小組在對大量基因組進行成功解碼后找到了答案,那就是有“自私DNA(脫氧核糖核酸)”之稱的轉座子。轉座子基因的豐度和廣度表明,它們在進化和生物多樣性的保持中發揮了至關重要的作用。

    研究者首次發現“馴化”的水稻“外來DNA”

      轉座子是一種可以改變自身基因組位置的DNA序列,其通過轉座事件改變細胞遺傳特性和基因組大小。轉座子通常被認為是外來DNA,“寄生”于宿主基因組中,但它們也可以在基因組中被“馴化”,并進化出有益于宿主的新功能。迄今為止,大多數馴化轉座子都在哺乳動物中發現,只有少數轉座子馴化在植物中被報道。在農作物

    Cell子刊:生殖細胞的piRNA通路大名單

      轉座子廣泛存在于生物的基因組中,能夠自我復制,并隨機插入到染色體上,因此又被稱為跳躍基因。轉座子在生殖細胞中特別危險,可能導致不孕或對后代發育產生嚴重影響。在進化過程中,復雜生物形成了一套生殖細胞基因組的防御機制,這一機制被稱為piRNA通路。   冷泉港實驗室(CSHL)Gregory

    我國科研人員在DNA轉座子研究領域取得新突破

    DNA轉座子是存在于染色體DNA上可自主復制和位移的基本單位,是基因組中一段可移動的DNA序列,可以通過切割、重新整合等一系列過程從基因組的一個位置“跳躍”到另一個位置,對于生命科學研究具有非常重要的意義。中國科學院動物研究所科研團隊基于自然界豐富的動物遺傳資源開展了迄今為止最大規模的DNA轉座子活

    中國醫學科學院最新文章:關鍵逆轉錄轉座子與癌癥

      LINE-1是現今人體內存在的唯一具有自主轉座活性的轉座子,約有 500 000個拷貝,占人類基因組總量的17%。LINE-1是通過轉錄和逆轉錄在內的轉座過程產生新的DNA拷貝,并使新產生的DNA拷貝插入基因組的不同位 置。LINE-1轉座會影響基因組中其他基因的表達或調控,因而會對基因組的穩定

    Nature:科學家發現能夠“馴化”人類基因組的特殊蛋白

      近日,一項刊登在國際雜志Nature上的研究報告中,來自洛桑聯邦理工大學的研究人員對一個龐大且神秘的人類蛋白質家族進行了一項基因組和進化研究,從而發現這些蛋白質或許能夠調節人類基因組中數百萬個轉座子元件,相關研究也揭示了一個大型的物種特異性基因調節網絡,該基因調節網絡或許會影響人類機體生物學機制

    基因組中“暗物質”關鍵調控機制

       中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院陳捷凱課題組與南方科技大學Andrew P. Hutchins課題組合作,以小鼠胚胎干細胞為模型,揭示了基因組中轉座元件的關鍵表觀遺傳調控機制,相關成果以Transposable elements are regulated by context-specif

    關于轉座重組的轉座效應介紹

      DNA轉座可以影響轉座位點基因的功能和活性:  ①轉座位點位于編碼序列內,轉座子插入導致基因突變。  ②轉座位點位于調控序列內,轉座子插入影響基因表達。  ③在轉座位點插入轉座子基因,賦予新表型,例如抗藥性。  ④鏈內復制轉座后,轉座子拷貝之間發生位點特異性重組,導致缺失或倒位。

    Nature子刊:華中農大發現轉座子可抑制mRNA翻譯

      來自華中農業大學生命科學學院,作物遺傳改良國家重點實驗室的研究人員發現水稻中的一類DNA轉座子具有翻譯抑制功能,這揭示了微小反向重復轉座元件的新功能,對研究其他重復序列的功能提供了借鑒意義,同時也拓寬了對于轉座子的認識。  這一研究成果公布在3月3日的Nature Communications雜

    Science:跳躍基因如何找到目標?

      為了了解轉座子如何形成基因組,極其重要的是,要發現它們定向整合(targeted integration)背后的機制。最近,來自法國國家健康與醫學研究院病理學實驗室的研究人員,與法國CEA-Saclay和美國一個實驗室合作,確定了兩種蛋白質之間的相互作用,是一個轉座子整合到酵母基因組中一個特定區

    中科院PNAS表觀遺傳研究新進展

      近日來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所的研究人員在組蛋白H3K4去甲基化酶研究中取得重要進展,證實水稻中的H3K4特異性去甲基酶JMJ703參與控制了轉座子活性,相關研究論文于1月14日在線發表在《美國科學院院刊》(PNAS)雜志上。   領導這一研究的是中國科學院遺傳發育所基因組生物學研究

    轉座子-Tol2-的轉座機制與轉座優勢詳述(一)

    Tol2轉座子提及轉基因,大家首先映入腦海的是什么呢?轉基因大豆?玉米?食用油?(對于那些一個都想不到的孩紙們,小編我只想哭暈在廁所)名詞很熟悉,各大超市隨處可見,可何為轉基因,如何得到轉基因產品?今天小編簡單來跟大家聊一聊。所謂轉基因,顧名思義,就是外源基因整合進入宿主基因組,目前哺乳動物系統最常

    PGBD1基因的結構特點和主要作用

    在不同的動物中發現的豬瘟蛋白家族是與飛蛾典型的豬瘟轉座子(trichoplusia ni)的轉座子相關的轉座子。這個家族還包括一些基因組中的基因,包括人類,這些基因似乎是從豬的轉座子中獲得的。該基因屬于豬瘟轉座因子衍生(pgbd)基因的亞家族。PGBD蛋白似乎是新的,與其他轉座酶或其他已知蛋白家族沒

    中國醫學科學院最新文章:關鍵逆轉錄轉座子與癌癥

      “核心刊物”欄目創辦于2002年,主旨在于向國內專業人士展示科研核心刊物,以及生命科學領域雜志每期重點內容,為讀者呈現精彩紛呈的國內科研動向,和重大科研進展。目前包括《遺傳》、《中國生物工程雜志》、《科學通報》等重點期刊,也歡迎生物類期刊聯系合作(聯系郵箱:journal@ebiotrade.c

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