多數腎小球腎炎是免疫介導性炎癥疾病。一般認為，免疫機制是腎小球疾病的始發機制，在此基礎上炎癥介質（如補體、白細胞介素、活性氧等）參與下，最后導致腎小球損傷和產生臨床癥狀。在慢性進展過程中也有非免疫非炎癥機制參與。
腎小球病—免疫反應：
體液免疫主要指循環免疫復合物（CIC）和原位免疫復合物，在腎炎發病機制中作用已得到公認，細胞免疫在某些類型腎炎中的重要作用也得到肯定。
1、體液免疫
可通過下列兩種方式形成腎小球內免疫復合物（IC）。
⑴循環免疫復合物沉積：某些外源性抗原（如致腎炎鏈球菌的某些成分）或內源性抗原（如天然DNA）可刺激機體產生相應抗體，在血循環中形成IC，CIC在某些情況下沉積或為腎小球所捕捉，并激活炎癥介質后導致腎炎產生。一般認為腎小球系膜區和/或內皮下IC常為CIC的發病機制。
⑵原位免疫復合物形成：系指血循環中游離抗體（或抗原）與腎小球固有抗原（如腎小球基底膜抗原或臟層上皮細胞糖蛋白）或已種植于腎小球的外源性抗原（或抗體）相結合，在腎臟局部形成IC，并導致腎炎。一般認為腎小球基底膜上皮細胞側IC主要與原位IC發病機制相關。
2、細胞免疫
微小病變腎病腎小球內無IC證據，但研究顯示病人淋巴細胞在體外培養可釋放血管通透性因子。急進性腎炎早期腎小球內常可發現較多的單核細胞。近年來有動物腎炎模型提供了細胞免疫證據，故細胞免疫在某些類型腎炎發病機制中重要作用得到認可。但細胞免疫可否直接誘發腎炎，長期以來一直尚有某些不同看法。