新測序技術揭開病毒突變“王國”
最近，新加坡A*STAR的研究人員，設計出一種測序技術，可在患者體內病毒（如乙型肝炎病毒）迅速變異時，跟蹤所產生的特異病毒變體。這一突破對“進化中的病毒種群的結構”提供了前所未有的視圖，并能有助于開發新藥，防止病毒株對藥物和免疫反應發展出抵抗力。相關研究結果發表在最近的《Genome Biology》。 病毒突變通過每個基因組中的小改變，產生單核苷酸變異（SNV）。在一個病毒基因組上發生的單核苷酸變異集合被稱為單倍型。這些突變在不同宿主之間有所差異，從而產生的病毒基因組拷貝，在不同宿主之間也略有不同。科學家認為，突變的基因組在病毒復制中發揮了一定的作用。 A*STAR 分子和細胞生物學研究所的William Burkholder與其他科學家帶領了這項研究，他指出：“深度測序已經徹底改變了病毒進化研究。然而，它不夠敏感，因此不能發現罕見的SNVs，發現不了同一基因組上發生的突變，或者不能將病毒群體中的突變組織成不同的遺傳群......閱讀全文
基因組所人類基因組突變研究獲進展
序列變異的周期性和與TCR相關聯的突變 基因突變會導致人類疾病的產生，因此研究遺傳變異的產生過程和那些能夠引起疾病的突變對生命科學基礎研究以及人類健康是十分關鍵和重要的。 近日，中國科學院北京基因組研究所于軍研究員帶領其研究團隊，在有關人類基因組中以轉錄為中心的突變研究方面取得新進展
SARS病毒基因組復制機制研究獲突破
近日，武漢大學生命科學學院教授郭德銀領導的研究組以選擇冠狀病毒特有的多個RNA加工酶作為主要研究目標，通過酵母菌系統的功能篩選和體外生物化學分析，發現SARS病毒基因組1b區編碼的一種非結構蛋白nsp14同時具有兩種RNA加工酶活性，一是參與RNA 5’-端加帽的N7-甲基轉移酶，二是進行RNA
新冠病毒已突變
新冠病毒是否已經發生突變？如何突變？這是目前學界研究的焦點之一。中國科研團隊最新發現顯示：新冠病毒已于近期產生了149個突變點，并演化出了兩個亞型，分別是L亞型和S亞型。研究發現，在地域分布及人群中的比例，這兩個亞型表現出了很大測差異。其中S型是相對更古老的版本，而L亞型更具侵略性傳染力更強。對
Nature子刊公布癌癥基因組研究重要成果：新的遺傳突變
在一項多達10萬人（包括17,000名最常見類型的卵巢癌患者）的遺傳分析研究中，研究人員確定了12種新的增加卵巢癌患病風險的遺傳變異，并找到了它們與以前發表的18種變異之間的關聯。 這項研究成果公布在3月27日的Nature Genetics雜志上，由OncoArray Consortium聯
研究人員首次破譯艾滋病病毒完整基因組
新華網華盛頓8月6日電 美國北卡羅來納大學6日報告說，該校的一個科研小組成功破譯了艾滋病病毒的完整基因組。這對于人類理解艾滋病病毒感染人體的機制，尋找抗“艾”新療法提供了有力幫助。 相關論文發表在6日出版的英國《自然》雜志上。研究小組負責人凱文·威克斯介紹說，艾滋病病毒的遺傳信息由單鏈核糖
遺傳發育所在植物基因組編輯突變體篩選方法研究取進展
如何快速高效進行突變體檢測和鑒定是植物基因組編輯技術迅速發展面臨的重要問題之一。目前植物基因組編輯突變檢測方法主要包括PCR/RE、T7EI錯配切割、臨界退火溫度PCR (ACT-PCR)、Sanger測序和二代測序(NGS)等。以上所有的檢測方法都基于PCR反應，且都有各自的不足之處。PCR/
AI揭示影響人腦發育基因組突變
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494310.shtm 科技日報北京2月21日電?（記者張夢然）美國研究人員使用人工智能（AI）模型揭示了可能影響人類認知進化的基因組突變。這項人類基因組學的開創性研究可能會促進發現復雜腦部疾病的新療法
AI揭示影響人腦發育基因組突變
科技日報北京2月21日電 美國研究人員使用人工智能（AI）模型揭示了可能影響人類認知進化的基因組突變。這項人類基因組學的開創性研究可能會促進發現復雜腦部疾病的新療法。該研究發表在新一期的《科學進展》上。 認知是人類進化的一個決定性特征，使人類有別于其他靈長類動物。盡管自人類與黑猩猩分道揚鑣以來發生
單細胞基因組突變檢測新突破
愛因斯坦研究人員已經開發并驗證了一種準確識別單細胞基因組中突變的方法。這種新方法可以幫助預測癌癥是否將在看似健康的組織中發展，在今天的自然方法的在線版本中發表的論文中被描述。相應的作者是Lola和Saul Kramer分子遺傳學主席Jan Vijg博士。 在科學家可以分析單個細胞的基因組之前，
人類腸道宏基因組的古菌病毒研究新進展
2022年12月30日，中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所馬迎飛團隊在《自然-通訊》（Nature Communications）上，發表了題為Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in
新冠病毒全基因組大小和序列的研究進展
2月3日，《自然》在線發表論文介紹了上海公共衛生臨床中心和復旦大學公共衛生學院教授張永振等人對2019-nCov的基因組序列的分析。該病毒基因組從就職于出現首批患者的海鮮市場的一名病人身上獲得。基因組分析顯示，該病毒與此前在中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關。 通過對從患者收集的
PNAS：讓病毒“吐出”基因組
病毒感染導致的手足口病，會使兒童出現可能致命的腦腫脹和麻痹，現在科學家們找到了治療這種疾病的潛在途徑，這一發現也為對抗其他相關病毒提供了寶貴線索。 在中國和東南亞國家，每年都會出現手足口病的爆發，這種疾病是由腸道病毒71型(EV71)引起的。在一些受到感染的兒童中，病毒會引發腦炎造成永久性
美國最新研究：新冠病毒或已發生突變－更容易受感染
綜合報道，美國佛羅里達州科研人員日前稱，他們認為新冠病毒或已發生突變，從而導致人體細胞更容易受感染。不過報道指出，目前，該研究結果尚未得到該領域其他專家的審查。 報道稱，佛羅里達州斯克利普斯研究所的科研人員指出，病毒突變對刺突蛋白(spike protein)產生影響。據稱，這種蛋白是病毒外部
突變的寨卡病毒更毒
?埃及伊蚊傳播寨卡病毒和登革熱。? ? 圖片來源：Shutterstock / khlungcenter 一項近日發表于《細胞報告》的新研究顯示，一種突變可能會使由蚊子傳播的寨卡病毒更具傳染性和危險性。 寨卡病毒通
新測序技術揭開病毒突變“王國”
最近，新加坡A*STAR的研究人員，設計出一種測序技術，可在患者體內病毒（如乙型肝炎病毒）迅速變異時，跟蹤所產生的特異病毒變體。這一突破對“進化中的病毒種群的結構”提供了前所未有的視圖，并能有助于開發新藥，防止病毒株對藥物和免疫反應發展出抵抗力。相關研究結果發表在最近的《Genome Biolo
突變的寨卡病毒更毒
? ? ?埃及伊蚊傳播寨卡病毒和登革熱。? ? 圖片來源：Shutterstock / khlungcenter? ? 一項近日發表于《細胞報告》的新研究顯示，一種突變可能會使由蚊子傳播的寨卡病毒更具傳染性和危險性。? ? 寨卡病毒通常不會在成人身上引發癥狀，但如果女性在懷孕期間感染，可
定義癌癥突變：破壞基因組3D相互作用的突變
在細胞中，DNA緊密地包裹在蛋白質周圍，并以一種復雜的3D結構包裝，我們稱它們為“染色質”。染色質不僅可以保護我們的遺傳物質不受損傷，而且通過調節基因組在3D空間的表達來組織整個基因組：展開呈現給細胞基因表達機器，然后再將它們卷回去。 在3D染色質結構中，一些區域被稱為“拓撲關聯域（TADs）
體細胞突變研究
體細胞突變發生在體細胞中的突變，即在體細胞發生了基因突變或染色體畸變。體細胞突變率一般為 0.1～1×10-6/代。其突變性狀一般不能傳給下一代個體，除非突變部分可以由無性繁殖方式傳給后代或者突變部分以后能產生生殖細胞。但突變細胞的突變性狀能通過有絲分裂傳給子細胞。例如許多芽變就是體細胞突變，若發現
證實基因組測序成功鑒定癌癥相關突變
最近，UT西南醫學中心的癌癥研究人員表明，全基因組測序可以用來確定患者遺傳性癌癥的風險，這可能會促進癌癥的預防、診斷和護理。 這項研究首次采用全基因組測序來評估258名癌癥患者的基因組，以提高癌癥誘發突變的診斷能力。相關研究結果發表在12月份的國際期刊《EBioMedicine》。 UT西南
全基因組突變新技術原理簡介
人類遺傳圖譜中，基因只占了全部DNA的2.5％，基因與基因之間的“非編碼”大片段并不全是“垃圾”，有些能夠調節基因的開啟和關閉，有些負責DNA折疊和將DNA打包運往細胞核。不止基因突變，控制基因的DNA發生突變也可能導致疾病。小鼠是疾病研究的常用模型，想要弄清小鼠基因組中每個DNA片段的功能，需要依
Science：人巨細胞病毒病毒基因組測序
人巨細胞病毒是一種很常見的皰疹病毒，感染約50-100%的成人，但通常沒有不良影響，并且它可以保持潛伏多年。人巨細胞病毒感染是比較常見的，發展中國家感染人數比發達國家人數多。 該病毒可導致出新生兒生缺陷和免疫系統受損，可能會導致致命疾病。該病毒也與癌癥發展有關聯。這項新的研究分析了病毒的蛋
Nature：全基因組測序重新定義癌癥之王基因組突變藍圖
近日，一項發表于國際著名雜志Nature上的研究論文中，來自英國和澳大利亞的研究人員對100位胰腺癌患者癌癥組織的基因組進行了深入分析，結果發現了4種不同的亞型，這或許可以幫助后期開發治療胰腺癌患者的新型療法。文章中研究人員利用全基因組測序技術揭示了腫瘤基因組結構性改變的光譜模式，該技術可以幫助
樹懶基因組中發現“化石”病毒
????? 二趾樹懶(Choloepus hoffmanni，如上圖)的基因組中隱藏著一個“化石”病毒。 據美國《科學》雜志在線新聞報道，就像恐龍在焦油中留下的腳印一樣，逆轉錄酶病毒會將其DNA中的一些片段插入到一種動物的基因組中。研究人員在樹懶的基因組中發現了泡沫病毒的古老片段。研究人
蛋白質突變“導致病毒傳播”
一項新的研究表明，齊昆古尼亞病毒的一個簡單的蛋白質突變可以讓它適應新的蚊子宿主，并傳播到更多地區。 美國德克薩斯大學醫學分校進行的研究發現，該病毒外殼蛋白質的單個氨基酸突變可以幫助它適應新的蚊子宿主白紋伊蚊（Aedes albopictus）。這項發現發表在了上周（12月7日）的《公共科學圖書館·
新研究揭示乙肝病毒DNA與人基因組互作景觀圖
乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）感染是全球性重大公共衛生健康問題之一，目前，全球乙肝病毒慢性感染者人數較多。HBV屬嗜肝DNA病毒科，在人體肝臟細胞核內可形成cccDNA、整合入人體基因組等病毒DNA形式穩定存在，這是HBV維持長期慢性感染的關鍵。因此，研究乙肝病毒與宿
科學研究！新冠病毒RNA是否能夠整合進宿主基因組？
新型冠狀病毒SARS-CoV-2是造成COVID-19在全球范圍肆虐的病因。該病毒為一種單股正鏈RNA病毒，具有高傳染性特性，能夠感染人體各代謝系統的多種組織器官，并引發嚴重的臨床癥狀，深入研究新冠病毒基因組RNA的特性十分必要。 2021年8月2日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中
體細胞的突變研究
體細胞突變發生在體細胞中的突變，即在體細胞發生了基因突變或染色體畸變。體細胞突變率一般為 0.1～1×10-6/代。其突變性狀一般不能傳給下一代個體，除非突變部分可以由無性繁殖方式傳給后代或者突變部分以后能產生生殖細胞。但突變細胞的突變性狀能通過有絲分裂傳給子細胞。例如許多芽變就是體細胞突變，若發現
為什么僅僅通過NGS來測基因組突變...
Illumina最近的一個大動作就是投入一億美金，分出一部分骨干，成立一個以“液態活檢”為中心的公司。所謂液態活檢，就是不用組織穿刺，通過 血液，尿液這類非侵犯性取才得來的標本對疾病進行診斷和評估。液態活檢是精準醫療的重要組成部分，試圖在血液里找到腫瘤細胞，或腫瘤DNA，通過高通量測 序
全基因組測序揭示肝癌相關基因突變
由亞洲癌癥研究組織(ACRG)、深圳華大基因研究院等多家單位合作完成的與肝細胞癌相關的基因突變研究成果于2013年6月20日在《基因組研究》(Genome Research)雜志上發表。這是繼2012年3月份在《自然-遺傳學》上發表的乙肝病毒整合機制研究之后，該研究團隊在肝癌研究中所取得的又
寧夏構建病原型別新冠突變病毒株技術研究快速鑒別平臺
記者近日從寧夏科技廳獲悉，該廳支持自治區疾病預防控制中心牽頭實施的“基于新型冠狀病毒感染的病毒性肺炎防控機制和關鍵技術的應用研究”項目，構建了呼吸道病原體多病原快速鑒定平臺，已具備4小時內快速鑒定和初步鎖定病原型別的新冠突變病毒株（VOC）的能力。 “快速檢測能力是疫情防控的基礎保障，2020