多篇文章介紹掌上測序儀的新興應用
Oxford Nanopore的MinION掌上測序儀近來有點火。這邊廂,公司正忙著升級儀器,發布新產品;那邊廂,用戶也在不斷發表研究成果,從全長cDNA測序到快速的病原體測序。 上個月,康涅狄格大學健康中心的研究人員在BioRxiv預印本網站上發表了一項成果。他們利用MinION對四個果蠅基因的cDNA進行了測序,并鑒定出那些基因所表達的近8000個全長亞型。 在此之前,研究人員已經利用PacBio的技術對全長的cDNA亞型進行測序,但“此平臺的高額費用可能讓一些用戶望而卻步,”作者指出,而MinION“需要很少的資金投入,可以產生非常長的讀取,并有望徹底改變轉錄組鑒定以及基因組學的其他領域”。 “我們預計全轉錄組的納米孔測序將成為鑒定轉錄本亞型的一種快速而強大的方法,特別是隨著技術通量和準確性的改進,以及文庫制備的簡化甚至省略,”研究人員總結道。 其他研究小組也報告了MinION在病原體分析上的應用。例如,英國伯......閱讀全文
CRISPR先驅發表研究新成果
細菌和古生菌一直在與入侵者做斗爭,為此它們演化出了多種防御機制,CRISPR-Cas適應性免疫系統就是其中之一。Cas1-Cas2蛋白復合體會捕獲30–40bp的外源DNA,將它們整合到CRISPR的間隔區,形成自己的免疫記憶。如果這種外源DNA再次入侵,細菌就能夠及時將其剪切,從而保護自身安全
Cell發表衰老研究重要成果
衰老是一個復雜的生物學過程,伴隨著有毒蛋白質聚集物在細胞中數量遞增。科學家們將它們視作是阿爾茨海默氏癥、亨廷頓氏病和帕金森病等各種神經退行性疾病的病因。然而目前對于這些有毒蛋白質聚集物的確切作用仍知之甚少。 現在由馬克斯普朗克生物化學研究所(MPIB)的F.-Ulrich Hartl帶領的一個
北大研究員發表癌癥研究新成果
PTEN是一個重要的腫瘤抑制基因,許多腫瘤都存在PTEN突變、下調或功能障礙。PTEN的磷酸酶活性依賴于膜轉位(激活),已知組蛋白去乙酰化酶HDAC抑制劑(尤其是曲古菌素A)能夠促進PTEN的膜轉位,但人們并不清楚這背后的具體機制。 多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過,不同類型
Nature在線發表4篇華人研究
對于華人學者在學術界做出的突破性研究,我們總是倍感親切。今日,在頂尖學術期刊《自然》在線發表的多篇文章中,我們很高興地看到,有4篇生物醫藥領域的研究來自于華人學者的課題組。在這篇文章里,我們也將為各位讀者介紹這4篇論文。 Yueh-hsiu Chien課題組 A multi-cohort s
Nature-Medicine發表HIV研究新成果
HIV在世界范圍內廣泛傳播,嚴重威脅著人類的健康。近年來HIV防治工作已經取得了很大的進展,新HIV感染者的數量大大減少,HIV感染者的壽命也顯著延長。然而,科學家們仍未找到治愈這種疾病的有效途徑,也沒有開發出相應的疫苗。 HIV是高度變異的病毒,能在感染過程中對免疫應答做出適應。Alabam
Science發表干細胞研究重要成果
斯坦福大學和東京大學的研究人員在Science雜志上發表文章指出,調整膳食可以去除造血干細胞。這種膳食療法有望替代化療和放療,顯著降低骨髓移植的毒副作用。 纈氨酸是一種需要從膳食中獲取的必需氨基酸。研究顯示,缺乏纈氨酸的膳食可以有效去除小鼠的造血干細胞,成功移植其他小鼠的造血干細胞。纈氨酸缺乏
Cell發表干細胞研究新成果
并非所有的干細胞都是完全一樣。當一些正忙于再生受損的組織時,它們安靜的兄弟們則充當了戰略后備人員只在需求上升時才會踏入。來自斯托瓦斯醫學研究所(Stowers Institute for Medical Research)的研究人員現在發現了一條重要的分子信號,它使得靜息狀態的小鼠造血干
Cell子刊發表CRISPR研究新成果
能夠編輯所需序列,在其中添加、刪除、激活或抑制特異的基因,制定化的基因組編輯技術具有很大的潛力應用于醫學、生物技術、食品和農業等領域。 現在,來自北卡羅來納州立大學的研究人員和同事們,針對幫助驅動CRISPR-Cas基因組編輯系統的6個核心分子元件展開了調查。他們的研究論文發表在《分
張鋒Cell發表CRISPR研究新成果
來自Broad研究所、東京大學的研究人員,在新研究中揭示出了Cpf1/向導RNA/靶DNA復合物的晶體結構。這一重要的研究成果發布在4月21日的《細胞》(Cell)雜志上。 Broad研究所核心成員張鋒(Feng Zhang)博士及東京大學醫學科學研究所基礎醫學系Osamu Nureki教授是
《自然》發表驗證STAP細胞的研究論文
日本發育生物學研究所小保方STAP細胞是2014年最著名的學術不端鬧劇,從2014年1月在《自然》發表兩篇論文,隨后被人指出論文存在偽造部分研究數據的嫌疑,被日本理化研究所調查證實存在學術不端,很快人們發現這一突破研究無法被重復而懷疑全面偽造,并被進一步調查,相關研究人員或者認為沒有錯誤,或者認
Science發表基因組研究重要成果
科學家們日前發現,人類基因組的遺傳學差異主要來自于拷貝數變異(CNV)。在此之前人們對CNV的了解并不多,因為CNV一直是基因組測序的一大挑戰。 華盛頓大學的遺傳學家Evan Eichler領導研究團隊克服了這一困難。他們對來自全球125個族群的人進行了深度基因組測序,全面分析了基因組中的SN
吉林大學發表癌癥研究重要成果
宮頸癌是全球女性癌癥死亡的第四大原因,在中國每年有近150000例新診斷的病例。宮頸癌在發展中國家尤其常見,因為在那里早期篩查還不普遍。科學家們發現,幾乎所有宮頸癌都是人乳頭瘤病毒(HPV)感染引起的,HPV引起的宮頸癌會發生LKB1(Liver kinase B1)突變失活。但他們還不清楚LK
華裔學者Cell發表lncRNA研究的利器
長非編碼RNA(lncRNA)是長達兩百個核苷酸以上的轉錄本,絕大多數位于細胞核內。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質,但它們在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,這說明lncRNA具有重要的生物學意義。在測序技術的幫助下,人們已經發現了數千種lncRNA,但這些lncRNA的生物學功能依然
Science發表基因組研究重要成果
科學家們日前發現,人類基因組的遺傳學差異主要來自于拷貝數變異(CNV)。在此之前人們對CNV的了解并不多,因為CNV一直是基因組測序的一大挑戰。 華盛頓大學的遺傳學家Evan Eichler領導研究團隊克服了這一困難。他們對來自全球125個族群的人進行了深度基因組測序,全面分析了基因組中的SN
《Science》發表中科院研究成果
來自中國科學院南京地理與湖泊研究所,美國北卡羅琳娜大學的研究人員在Science(317卷)發表了今年夏季太湖藍藻水華大量暴發的現場報道。 原文檢索:Science 31 August 2007:Vol. 317. no. 5842, p. 1166 DOI: 10.1126/science.3
植物種子大小研究綜述發表
植物種子大小是重要的產量性狀,種子大小的調控也是重要的發育生物學問題。因此,解析種子大小調控的分子機制,可以為作物的高產育種提供理論基礎和基因資源。近年來植物種子大小的調控機制研究進展迅速,目前已成為植物領域研究的熱點和前沿。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所李云海研究組長期致力于植物種子大小
中大長江學者發表腫瘤研究新成果
骨肉瘤也叫成骨肉瘤,是較常見的發生在20歲以下的青少年或兒童中的一種惡性骨腫瘤,在小兒骨惡性腫瘤中最多見,約為小兒腫瘤的5%。目前,原發性非轉移骨肉瘤患者的五年總體生存率是75%到77%,而轉移性骨肉瘤的五年總生存率則不到20%。盡管現在有多種治療方法,但是,患者的腫瘤轉移和復發,仍然提出了一個
江南大學PNAS發表腫瘤研究新成果
近日來自江南大學、香港中文大學和中科院的研究人員發表了題為“Transient receptor potential channel TRPC5 is essential for P-glycoprotein induction in drug-resistant cancer cells ”的
中南大學Hepatology發表癌癥研究新成果
來自中南大學湘雅醫院的研究人員證實,BTBD7蛋白促進了肝癌上皮間質轉化(EMT),可作為肝癌的一個預后生物標記物。相關研究在線發表在6月12日國際著名肝臟疾病雜志Hepatology(最新影響因子11.665)上。 論文的通訊作者是中南大學湘雅醫學研究實驗中心的申竑(Hong She
人類演化研究團隊發表青藏高原考古研究新成果
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505261.shtm人類究竟是在何時、以怎樣的適應性策略實現了高原的終年定居,并最終形成獨特的人群與文化,是目前考古學與人類學界所關注的重要議題。近年來,青藏高原的史前考古與DNA研究取得了一系列重大發現
癌癥研究大師Cell子刊發表新研究成果
來自哈佛醫學院的研究人員證實,SPOP通過促進ERG癌蛋白泛素化和降解抑制了前列腺癌進展。這一重要的研究發現發布在9月3日的《分子細胞》(Molecular Cell)雜志上。 哈佛大學醫學院病理學系的WenyiWei博士及著名癌癥遺傳學家Pier Paolo Pandolfi是這篇論文的共同
上海交大Hepatology發表腫瘤研究新成果
來自上海交通大學、復旦大學和第二軍醫大學的研究人員,采用外顯子組測序方法揭示出了肝母細胞瘤(hepatoblastoma)的一些新突變和癌基因,并證實它們與Wnt信號通路以及泛素連接酶復合體相關。這項研究已被在國際著名肝臟疾病雜志Hepatology(最新影響因子12.003)接受并在線發布。
動物所發表造血干細胞研究綜述
造血發生是一個動態有序的過程,其維持依賴于一群數量極其稀少的多能干細胞——造血干細胞。造血干細胞一方面通過自我更新維持造血干細胞庫的穩定,另一方面通過分化產生各種類型的成熟血細胞。為了描繪造血干細胞完整的分化過程,科學家在2000年首次提出了經典的造血層級結構(hematopoietic hie
上海交大《PLOS》發表干細胞新研究
2014年7月23日,國際生物學領域著名期刊《Plos One》在線發表了上海交通大學的一項最新研究成果“Differentiation of Human Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells into Prostate-Like Epithelial Ce
《英國醫學雜志》發表“針灸研究”專輯
近日,《英國醫學雜志》發表了“針灸研究”專輯。該專輯由中國中醫科學院與加拿大麥克馬斯特大學牽頭,國內外100多位專家學者參與研究與文章撰寫。該專輯將對全球與針灸相關證據的產生和利用,以及臨床實踐指南、衛生政策和醫保決策制訂產生深遠影響。 該專輯包括1篇觀點、4篇分析性文章、1篇研究方法和報告共
高福院士Nature-Communications發表研究新成果
來自中國農業大學、中國科學院微生物研究所、中國疾病預防控制中心等機構的研究人員,在新研究中揭示了人感染H10N8禽流感病毒優先結合禽類受體的結構基礎。研究結果發表在1月9日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。 甲型流感病毒家族以病毒表面突起的兩種蛋白質,即血凝素
華東理工特聘教授PNAS發表代謝研究
放線菌能夠大量生產有益的代謝產物,在藥物、化合物、能源等工業生產上有很大的價值。對多種碳源進行有效共利用,是放線菌工業生產的一個主要技術挑戰。一直以來,人們對放線菌攝取和利用多種碳水化合物的調控機制知之甚少。 華東理工大學的研究人員日前發現,氮代謝的核心調控子GlnR也控制著non-PTS(非
《Cell》發表創新性蛋白質研究技術
就像一臺小型的、運轉良好的機器,酶是由多個相互連鎖的分子元件構成的一類蛋白質,在每個細胞中執行著各種各樣的任務。然而,這些元件是如何精確協同作用來完成任務的?這一問題長期困擾著科學家們。現在,一個研究人員小組發現了一種繪制酶潛在分子機器圖譜的新方法,根據它揭示的模式,研究人員能夠預測一種酶的行為
張鋒參與發表CRISPR新研究成果
2016年7月29日,國際學術期刊《Journal of Biological Chemistry》在線發表了哈佛大學醫學院、麻省理工學院-哈佛大學Broad研究所和山西眼科醫院等處的一項最新研究成果,題為“The Clustered, Regularly Interspaced, Short
浙江大學發表肝癌研究新進展
肝癌是一種預后很差的常見惡性腫瘤。我國是肝癌高發國家,每年約有11萬人死于這種疾病。肝細胞癌(HCC)是原發性肝癌的主要類型, 也是惡性程度最高的腫瘤之一。盡管HCC的診斷和治療已經取得了一定的進展,但其預后情況仍然很差。 此前有不少研究顯示,激酶信號傳導的失調會促進HCC。浙江大學醫學院和美