兩大牛人攜手發布新測序技術
經濟高效的單分子測序平臺能為人們提供很大的幫助，比如破解完整基因組序列、確定單倍型和鑒定mRNA可變剪接。為此，哥倫比亞大學的車靖岳（Jingyue Ju）和哈佛大學的George Church教授合作開發了基于納米孔的單分子邊合成邊測序（SBS）系統。 他們給四種核苷酸分別標記上不同的聚合物。聚合酶會將標記的核苷酸添加到延伸中的DNA鏈上，同時釋放出聚合物標簽。這些標簽隨后通過納米孔，引起納米孔電流的改變。檢測這些標簽造成的電信號差異，就可以準確分辨相應的堿基。 Jingyue Ju的George Church的研究團隊最近對這一測序技術進行升級，打造了高通量的單分子納米孔測序平臺。這一重要成果發表在美國國家科學院院刊PNAS雜志上。 Jingyue Ju是基因測序領域的專家，曾發明四色可逆終止子測序技術。George Church被譽為是個人基因組學和合成生物學的先鋒。1984年Church等人發表了首個直接基因組測......閱讀全文
美首次對老鼠基因組的調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分――調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗室主任任兵教
《自然》：美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗
法國擬建高速基因組測序分析平臺
法國總理菲利普17日在巴黎宣布，法國在法蘭西島大區（又稱“巴黎大區”）和中部奧弗涅—羅訥—阿爾卑斯大區啟動建設兩個高速基因組測序分析平臺，以推動法國基因組相關研究的發展。 法國政府去年6月提出“法國基因組醫學2025”計劃，這兩個基因組測序分析平臺的建設就隸屬該計劃，預計將于2018年正式開始
中科院基因組測序平臺聯盟成立
2月12日上午，在中國科學院條件保障與財務局的支持和推動下，中科院基因組測序平臺聯盟成立大會暨簽約儀式在中科院北京基因組研究所召開。條財局副局長曹凝及中科院廣州、武漢、上海、昆明及北京各區域中心專家代表和部分研究所代表共計20余人出席會議。 會上，北京基因組所副所長、黨委
西北農林科技大學PLOSGenetics發表紅棗基因組序列測序結果
高品質的干棗基因組序列，以及從其近緣種樹木的基因序列，能夠闡明這種人類已經種植超過7000年的古老果樹的馴化歷史。近期，西北農林科技大學與美國康奈爾大學Boyce Thompson植物研究（BTI）以及北京林業大學的研究人員合作，對中國干棗進行了基因組測序，相關結果發表在12月22日的《PLOS G
萬元全基因組測序在望－全新分析平臺登場
今年早期，ABI公司應用SOLiD 3系統領先的寡核苷酸連接和檢測技術對人類基因組進行了測序，費用低于6萬美元。這臺新儀器的技術改進使更高的樣品和數據通量成為可能，從而有望進一步降低基因組測序的費用。例如，更廉價的基因組數據有望加速疾病關聯和生物標志物的發現，從而改善診斷和疾病處理，支持與個人最佳治
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
HiFi測序助力第一個完整的人類基因組序列
讀這篇文章，你無疑會感到有些似曾相識的感覺。畢竟，人類基因組參考在2000年、2001年和2003年都被宣布“完成”。 但是從那時起，任何使用過參考資料的科學家都知道，從來沒有一個完整的人類基因組測序。直到現在。 HiFi測序助力第一個完整的人類基因組序列 端粒到端粒(T2T)聯盟是一
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源：monticelloshop.org 近日，法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味，廣受稱贊，這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日，相關論文在線刊登于《自然
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月，在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序，它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先，這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列；其次，這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前，人們通過傳統的遺傳學方法已確定
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中，有超過100種已經進行了基因組測序，但是，只有9種爬行動物（在10000個物種當中）的基因組對科學界來說是可用的。最近，瑞士日內瓦大學（UNIGE）的一個研究小組，構建了一個大的數據庫，其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序，這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
九大測序平臺對比（一）
1.sanger企業：Life Technology推出時間：1977年發明，1986年第一臺商業化測序儀主流型號：3730XL樣品要求：PCR產物：濃度≥50ng/ul 體積≥10ul；質粒：含量≥5ug；菌液：體積≥1ml。測序原理:雙脫氧鏈終止法：Sanger法測序的原理就是，每個反應含有所有
九大測序平臺對比（二）
Helicos企業: Helicos Biosciences推出時間: 2008年主流型號: HeliScope? Single Molecule Sequencer（2008年推出）樣品要求: 1-3 μg，起始DNA體積不超過100 μL.測序原理: 邊合成邊測序,可逆阻斷測序待測DNA被隨機打
九大測序平臺對比（四）
5.Helicos企業: Helicos Biosciences推出時間: 2008年主流型號: HeliScope? Single Molecule Sequencer（2008年推出）樣品要求: 1-3 μg，起始DNA體積不超過100 μL.測序原理: 邊合成邊測序,可逆阻斷測序待測DNA被隨
九大測序平臺對比（六）
8.PGM企業: Ion Torrent推出時間: 2010年主流型號: Ion Personal Genome Machine?（2010年）樣品要求: 5 μg DNA，起始DNA體積不超過130μL測序原理: 半導體芯片測序該測序儀使用了一種高密度半導體小孔芯片。該芯片置于一個離子敏感層和離子
九大測序平臺對比（三）
4.HiSeq2000企業: Illumina推出時間: 2010/1/1主流型號: Illumina HiSeq2000樣品要求: 6ug/sample,無RNA、蛋白污染，無降解，OD260/OD280=1.8-2.0測序原理: 邊合成邊測序這種測序技術通過將基因組DNA的隨機片斷附著到光學透明
九大測序平臺對比（五）
7.The PacBio RS system企業: Pacific Biosciences推出時間: 2010年2月開始早期試用主流型號: PacBio RS樣品要求: 1kb以下500ng，純化的基因組 DNA, BACs, cDNA 文庫 或PCR 產物測序原理: 邊合成邊測序，single m
九大測序平臺對比（一）
1.Sanger2.4543.Solid 4.HiSeq20005.Helicos6.DNA Nanoball array7.The PacBio RS system8.PGM9.MiSeq??sanger企業：Life Technology推出時間：1977年發明，1986年第一臺商業化測序儀主流
基因測序的云計算平臺
?? 自二代測序的技術問世以來，就一直是研究和臨床領域關注的重點。隨著整個行業的技術發展，二代測序也帶動了整個基因研究的產業鏈。在二代測序的產業鏈中，上游做檢測，中游做分析，下游做應用。在測序價格持續下降的情況下，中游測序數據的生物信息學分析成為了提高效率最大的瓶頸。 傳統的測序數據分析依賴于本地
九大測序平臺對比（二）
2.454企業: Roche推出時間: 2005年主流型號: Genome Sequencer FLX Titanium（2008年推出）樣品要求: 5 μg of DNA，濃度≥300 ng/μL測序原理：焦磷酸測序在測序時，使用了一種叫做“Pico TiterPlate”（PTP）的平板，它
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度（Sequencing depth）是指測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體，如果采用的是雙末端或Ma
液相序列捕獲系統與高通量測序
Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷倫寡核苷酸序列合成技術的液相序列捕獲系統 – 高通量平行靶向測序的最佳解決方案來自美國麻省理工學院和哈佛大學Broad研究院的研究人員，利用安捷倫(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技術，合成
測序技術及DNA序列測定結果分析
實驗概要?在分子生物學研究中，DNA的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用于測序的技術主要有Sanger等（1977）發明的雙脫氧鏈末端終止法和Maxam和 ? Gilbert（1977）發明的化學降解法。這二種方法在原理上差異很大，但都是根據核苷酸在某一固定的點開始，隨機在某一個特定的
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日，由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱，他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序，繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱，這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程，對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜