DNA酶I足跡分析法實驗——粗制品的DNA酶足跡分析法
實驗方法原理DNA酶足跡分析常用來尋找粗制品中的蛋白質,因而提供了一種在純化過程中采用的分析方法。通過改變條件,如在反應體系中加入大量的競爭性DNA,或增加反應中鹽的濃度,可抑制非特異性的DNA結合蛋白結合到標記的DNA上。實驗材料含有DNA結合位點的質粒DNA試劑、試劑盒適當的限制性內切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE緩沖液[α-32P] dNTP (3000?6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段緩沖液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol L 4dNTP 混合液脫氧核糖核酸酶I (DNA酶I; EC3.L4.5)分析緩沖液A或B干冰DNA酶I終止緩沖液DNA酶I儲存緩沖液甲酰胺加樣緩沖液儀器、耗材10 mL 一次性塑料管硅烷化1.5 mL微量離心管可調節水浴鍋(±0. 1℃)12 in×7.5 in大小的玻璃或不銹鋼碟有蓋子的塑料微量離心管6 mm寬間隔12 mm的DNA測序......閱讀全文
DNA酶I足跡分析法實驗——粗制品的DNA酶足跡分析法
實驗方法原理DNA酶足跡分析常用來尋找粗制品中的蛋白質,因而提供了一種在純化過程中采用的分析方法。通過改變條件,如在反應體系中加入大量的競爭性DNA,或增加反應中鹽的濃度,可抑制非特異性的DNA結合蛋白結合到標記的DNA上。實驗材料含有DNA結合位點的質粒DNA試劑、試劑盒適當的限制性內切核酸酶10
DNA酶I足跡分析法實驗——NA酶I足跡分析法
本分析方法用來檢測DNA上特異的蛋白質結合位點。位點上結合的蛋白質可保護 D N A 的 磷 酸 二 酯 鍵 骨 架 免 于 受 D N A 酶 I 催 化 的 水 解 。 水 解 后 D N A 片 段 在 變 性DNA測序膠上分離,通過放射自顯影可使結合位點顯示出來。足跡法已進一步發展成為確定D
DNA酶I足跡分析法實驗
DNA酶I足跡分析法 用光密度及數值分析法決定蛋白質結合的平衡常數 粗制品的DNA酶足跡分析法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理
DNA酶I足跡分析法
實驗方法原理 實驗材料 含有DNA結合位點的質粒DNA試劑、試劑盒 適當的限制性內切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE緩沖液[α-32P] dNTP (3000?6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段緩沖液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol
DNA酶I足跡分析法實驗2
實驗材料含有DNA結合位點的質粒DNA試劑、試劑盒適當的限制性內切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE緩沖液[α-32P] dNTP (3000?6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段緩沖液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol L 4dNTP 混合液脫氧
DNA-酶-I-足跡分析實驗
DNA 酶 I 足跡分析實驗 ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 32P-標記 DNA 酶 I 足跡探針 酚 氯仿
DNA-酶-I-足跡分析實驗
試劑、試劑盒 32P-標記 DNA 酶 I 足跡探針酚 氯仿乙醇聚乙烯醇競爭 DNA 緩沖液 Z'(或緩沖液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 終止液蛋白酶 K甲酰胺加樣緩沖液實驗步驟 材料32P-標記 DNA 酶 I 足跡探
DNA-酶-I-足跡分析實驗
試劑、試劑盒32P-標記 DNA 酶 I 足跡探針酚 氯仿乙醇聚乙烯醇競爭 DNA 緩沖液Z'(或緩沖液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 終止液蛋白酶 K甲酰胺加樣緩沖液實驗步驟材料32P-標記 DNA 酶 I 足跡探針酚/
DNA-酶-I-足跡探針的制備實驗
試劑、試劑盒 TE牛腸堿性磷酸酶緩沖液 T4 多核苷酸激酶緩沖液TBE 加樣緩沖液TBE質粒 DNA合適的限制酶粉 氯仿氯仿 異戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛腸堿性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸銨 乙酸鈉丙烯酰胺雙丙烯酰胺過硫酸銨TEMED儀器、耗材 SpeedVac 旋轉濃縮器
DNA-酶-I-足跡探針的制備實驗
試劑、試劑盒TE牛腸堿性磷酸酶緩沖液T4 多核苷酸激酶緩沖液TBE 加樣緩沖液TBE質粒 DNA合適的限制酶粉 氯仿氯仿 異戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛腸堿性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸銨乙酸鈉丙烯酰胺雙丙烯酰胺過硫酸銨TEMED儀器、耗材SpeedVac 旋轉濃縮器實驗步驟
DNA-酶-I-足跡探針的制備實驗
DNA 酶 I 足跡探針的制備實驗 ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 TE 牛腸堿性磷酸酶緩沖液 T4 多核苷
DNA酶足跡法的功能介紹
DNA酶足跡法是一種用來測定DNA-蛋白質專一性結合的方法。用于檢測與特定蛋白質結合 的DNA序列的部位,可展示蛋白質因子同特定DNA片段之間的結合區域。
DNA酶足跡法的原理介紹
DNA和蛋白質結合以后便不會被DNAase分解,在測序時便出現空白區(即蛋白質結合區),從而了解與蛋白質結合部位的核苷酸對數目。在用酶移出與蛋白質結合的DNA后,又可測出被結合處DNA的序列。
DNA-酶-I-足跡法對-DNA-上的蛋白質結合位點作圖實驗
實驗材料 新鮮組織、培養的細胞、來自細胞或組織的蛋白成分試劑、試劑盒 細胞勻漿緩沖液細胞重懸緩沖液細胞淋洗緩沖液乙醇Ficoll 400甲酰胺染色液MgCl2 CaCl2 溶液NaClNonidetP-40酚:氯仿磷酸鹽緩沖液聚乙烯醇終止液組織勻漿液組織重懸緩沖液臺盼藍染料DNA 酶 I
DNA-酶-I-足跡法對-DNA-上的蛋白質結合位點作圖實驗
本方案介紹在放射性標記的 DNA 片段上確定蛋白質結合位點的作圖方法。本方案使用 DNA 酶 I 切割 DNA, 而在替代方案中是用羥自由基斷裂 DNA。如果希望得到優化足跡法反應的建議,請參見本方案最后部分的疑難解析以及優化 DNA 酶 I 足跡法反應的欄目。本實驗來源于分子克隆實驗指南(第三版)
DNA-酶-I-足跡法對-DNA-上的蛋白質結合位點作圖實驗
DNA 酶 I 足跡法對 DNA 上的蛋白質結合位點作圖實驗 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 新鮮組織、培養的細胞、來自細胞或組織的蛋白成分
DNA酶足跡法的原理和應用
DNA酶足跡法是一種用來測定DNA-蛋白質專一性結合的方法。用于檢測與特定蛋白質結合 的DNA序列的部位,可展示蛋白質因子同特定DNA片段之間的結合區域。其原理為:DNA和蛋白質結合以后便不會被DNAase分解,在測序時便出現空白區(即蛋白質結合區),從而了解與蛋白質結合部位的核苷酸對數目。在用酶移
DNA酶足跡法的基本原理
原理為:DNA和蛋白質結合以后便不會被DNAase分解,在測序時便出現空白區(即蛋白質結合區),從而了解與蛋白質結合部位的核苷酸對數目。在用酶移出與蛋白質結合的DNA后,又可測出被結合處DNA的序列。
DNA足跡法介紹
DNA足跡法,中文名稱:DNA足跡法英文名稱:DNA footprinting定義:檢測DNA序列中DNA結合蛋白識別部位的一種方法。
DNA足跡法的原理介紹
DNA被蛋白質結合后,由于蛋白質的構象保護,DNaseI不能降解這一結合位點,如果對該DNA進行一端的末端標記,并控制好DNaseI的酶量和作用時間,可將該DNA切割成大小不等的DNA片斷而蛋白質保護區域不被酶解,這段區域到標記末端的片斷是缺失的,對其電泳,可找出蛋白質結合位點的精確位置。
DNA足跡法的基本原理
原理:DNA被蛋白質結合后,由于蛋白質的構象保護,DNaseI不能降解這一結合位點,如果對該DNA進行一端的末端標記,并控制好DNaseI的酶量和作用時間,可將該DNA切割成大小不等的DNA片斷而蛋白質保護區域不被酶解,這段區域到標記末端的片斷是缺失的,對其電泳,可找出蛋白質結合位點的精確位置。
DNA聚合酶I的簡介
DNA聚合酶I的二級結構以螺旋為主,可劃分為A至R共18個螺旋肽段。螺旋肽段之間由非螺旋結構連接。其中H區與I區之間的無規則結構較長,有50個氨基酸殘基,I螺旋與O螺旋之間由較大的空隙,可以容納DNA鏈,而50個氨基酸的無規結構,就像一個蓋子那樣與I、O螺旋區共同把DNA鏈包圍起來,使其向一個方
什么是DNA聚合酶I?
DNA聚合酶I的二級結構以螺旋為主,可劃分為A至R共18個螺旋肽段。螺旋肽段之間由非螺旋結構連接。其中H區與I區之間的無規則結構較長,有50個氨基酸殘基,I螺旋與O螺旋之間由較大的空隙,可以容納DNA鏈,而50個氨基酸的無規結構,就像一個蓋子那樣與I、O螺旋區共同把DNA鏈包圍起來,使其向一個方
DNA的酶切實驗
采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進行酶切以獲得相應的粘末端進行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度不同)或反應溫度不同,這時可以采用如下措施解決:1)先用一種酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一種酶切;2
DNA-酶-I-超敏感位點作圖
實驗材料 真核細胞試劑、試劑盒 緩沖液 AEDTA乙醇裂解緩沖液磷酸鹽緩沖液臺盼藍染料DNA 酶 I 稀釋緩沖液DNA 酶 I 溶液蛋白酶 K 溶液RNA 酶溶液酚:氯仿SDS 緩沖液TE儀器、耗材 Sorvall H1000B 轉頭或等價物帶螺帽的試管振蕩水浴鍋實驗步驟 材料緩沖液和溶液貯存液、緩
DNA-酶-I-超敏感位點作圖
DNA 酶 I 超敏感位點作圖法經常用于定位真核基因的調控區。由于還未被理解的原因,基因帶有對 DNA 酶 I 切割敏感的分開的序列,而且這些所謂超敏感位點圖譜是隨基因的激活狀態而變化的(Weintrauband Gmudine1976)。本實驗來源于分子克隆實驗指南(第三版)下冊,作者:〔美〕J.
DNA-酶-I-超敏感位點作圖
? ? ? ? ? ? 實驗材料 真核細胞 試劑、試劑盒 緩沖液 A EDTA 乙醇 裂解緩沖液
關于DNA聚合酶I的功能簡介
1)通過核苷酸聚合反應,使DNA鏈沿5’→3’方向延長(DNA聚合酶活性) 2)催化由3’端水解DNA鏈(3’→ 5’核酸外切酶活性,用于切除錯配的堿基) 3)催化由5’端水解DNA鏈(5’→ 3’核酸外切酶活性,用于切除引物) 4)催化由3’端使DNA鏈發生焦磷酸解 5)催化無機焦磷酸
關于DNA聚合酶I的基本介紹
DNA聚合酶I(DNA-pol I),分子量109kD,為單肽鏈組成,400分子數/細胞,是原核生物的DNA聚合酶,由于發現最早命名為DNA聚合酶I,其他原核生物的DNA聚合酶,按發現的先后順序分別命名為DNA聚合酶Ⅱ、DNA聚合酶Ⅲ、DNA聚合酶Ⅳ和DNA聚合酶Ⅴ。
DNA酶切實驗(圖)
采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進行酶切以獲得相應的粘末端進行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度不同)或反應溫度不同,這時可以采用如下措施解決: 1)先用一種酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一種酶切