Northernprotocol(RULESFORRNAWORK)
1. Wear gloves at all time including filling pipet tip in racks, filling jars with Eppendorf tubes, and weighing chemicals to prepare solutions.2. Pull weighing paper or weighing boat from middle of pile. Tap chemicals out of bottles. Use weighing boats or specimen cups found in chemicals in buckets for spoonin......閱讀全文
RNA印跡(Northern-Blot)
【實驗原理】將RNA變性及電泳分離后,轉移到固相支持物上,用于與DNA探針雜交以鑒定其中特定 RNA分子的大小與含量。基本原理與Southern印跡相同,但RNA變性方法與DNA不同,不能用堿變性,因為堿會導致RNA的水解。Northern印跡主要用于組織細胞靶基因表達水平的研究以及對同一組織細胞的
Northern-protocol(RULES-FOR-RNA-WORK)
1.???????? Wear gloves at all time including filling pipet tip in racks, filling jars with Eppendorf tubes, and weighing chemicals to prepare solution
Northern印跡和總RNA雜交實驗——Northern印跡分析
試劑、試劑盒甲醛凝膠溶液RNA 電泳緩沖液儀器、耗材凝膠模梳齒凝膠用具實驗步驟1. 用肥皂和水徹底清洗凝膠模,梳齒和凝膠用具。2. 準備甲醛凝膠溶液。甲醛凝膠溶液(300 ml 1% 瓊脂糖凝膠):瓊脂糖,3.0 g10x RNA 電泳緩沖液,30 ml? ???Milli-Q 或用玻璃器皿蒸餾過的
Northern印跡和總RNA雜交實驗
Northern印跡分析雜交和放射自顯影試劑、試劑盒甲醛凝膠溶液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?RNA 電泳緩沖液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
Northern印跡和總RNA雜交實驗
試劑、試劑盒 甲醛凝膠溶液RNA 電泳緩沖液儀器、耗材 凝膠模梳齒凝膠用具實驗步驟 1. 用肥皂和水徹底清洗凝膠模,梳齒和凝膠用具。2. 準備甲醛凝膠溶液。甲醛凝膠溶液(300 ml 1% 瓊脂糖凝膠):瓊脂糖,3.0 g10x RNA 電泳緩沖液,30 ml ? ??Milli-Q 或用玻璃器皿蒸
培養細胞中RNA檢測-Northern-Blot
培養細胞中RNA檢測-Northern Blot1.制膠:(1%)瓊脂糖????????????????2.5g10×Mops緩沖液???25.0mlH2O???????????????192.0ml2.在微波爐中加熱煮沸使膠完全溶于水并滅菌。3.取出膠冷卻到60℃,于通風柜中加45ml甲醛,混勻。
Northern印跡和總RNA雜交實驗
Northern印跡分析 雜交和放射自顯影 ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 甲醛凝膠溶液 RNA 電泳緩沖液
總RNA提取與Northern雜交(1)
一、 總RNA的提取1、 取組織10-50毫克,剪切成大小在0.5厘米以內的碎片,加入×5的RNA later(約2毫升)。樣品在37度可保存1天。室溫下1周,4度下1個月。2、 勻漿:用Rnase Erase spray(ICN)清理勻漿器頭部(7mm),用DEPC水和乙醇清洗,將上述樣品用鑷
總RNA提取與Northern雜交(2)
4、Loading buffer(10ul每個樣) ? 總體積 100ul 200 ul 500ul 10×MOPS
總RNA提取與Northern雜交(3)
第二天:將上述物品揭開,將膠正面朝下,膜正面朝上,用鉛筆作好標記。將膠浸泡在EB中1-2分鐘,用DEPC H2O清洗,將膜放在濾紙上面,夾好,4度下保存,或者直接進行預雜交。UV雜交(有助于RNA結合到膜上面)。五、預雜交和雜交預雜交和雜交 buffer: 100ul20×SSC 25ml (5×S
Northern雜交試驗指導手冊(1)-RNA提取
方法一、改良異硫氰酸胍提取法試劑及其配制異硫氰酸胍變性液:貯存液-在含484ml 水(經DEPC處理), 17.6ml 0.75mol/L檸檬酸鈉(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入250g異硫氰酸胍,加熱至60~65℃并持續攪拌使之充分溶解。貯存液室溫保存備用(不超過3個
Northern雜交試驗指導手冊(5)-RNA探針制備
五、RNA探針制備(根據the DIG system user's guide)A. 地高辛標記的體外轉錄試劑及其配制(試劑盒提供):10× NTP標記混合物:in Tris-HCl (pH 7.5)10mmol ATP10mmol CTP10mmol GTP6.5mmol UTP3.5mm
Northern雜交試驗指導手冊(2)-RNA質量檢測
二、RNA質量檢測提取的RNA需要對其質量和數量進行檢測。實驗室常用的方法有紫外吸收值檢測和電泳檢測兩種。方法一、紫外吸收檢測試劑:TE ( 10mmol/L Tris, 1mmol/LEDTA)。dH2O試驗程序1.預熱紫外分光光度計10~20min.。2.取兩個1ml的狹縫石英杯,一個裝入1ml
Northern-Blotnorthern雜交
Northern BlotPreparation of Formaldehyde Agarose GelThe gel conditions (1% agarose, 1X MOPS, 6.3% formaldehyde) are designed for ~4 hours of electroph
Northern
繼分析DNA的Southern雜交方法出現后,1977年Alwine等人提出一種與此相類似的、用于分析細胞總RNA或含poly A尾的RNA樣品中特定mRNA分子大小和豐度的分子雜交技術,這就是與Southern相對應而定名的Northern雜交技術。這一技術自出現以來,已得到廣泛應用,成為分析mR
Northern印跡的制備和Northern印跡
Northern印跡的制備 預備: 1.按下述步驟,每泳道加10~20μg總RNA或 0.5~1μgpoly(A)+RNA進行甲醛/ 瓊脂糖凝膠電泳,將凝膠放在紫外線透照儀上,旁邊置一標尺進行拍照。 a. 總RNA(10~20μg)用下列溶液在65℃溫育5min:
Northern印跡和總RNA雜交實驗——雜交和放射自顯影
實驗材料mRNA試劑、試劑盒甲酰胺SSPEDenhardt 試劑SDS儀器、耗材濾膜實驗步驟1. 濾膜進行 1~2 小時預雜交。在 42℃:50% 甲酰胺5x SSPE2 x Denhardt 試劑0.1% SDS或者在 68℃:6x SSC2x Denhardt 試劑0.1% SDS2. 把已變性
Northern-Blot
Northern Blot Northern Blot ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 20XMOPS 緩沖液 20
Northern雜交
實驗方法原理 轉移并固定到膜上的 RNA 樣品可以與特異的探針雜交,從而用來對所感興趣的 RNA 進行定位。視實驗人員和條件的差異,可以從多種方法中選擇任意一種來標記和檢測探針。用抑制非特異吸收探針的封閉試劑處理膜之后,在適于探針和固定的靶 RNA 雜交的條件下將膜同探針孵育,而后廣泛洗
Northern雜交
轉移并固定到膜上的 RNA 樣品可以與特異的探針雜交,從而用來對所感興趣的 RNA 進行定位。視實驗人員和條件的差異,可以從多種方法中選擇任意一種來標記和檢測探針。用抑制非特異吸收探針的封閉試劑處理膜之后,在適于探針和固定的靶 RNA 雜交的條件下將膜同探針孵育,而后廣泛洗膜以去除非特異結合的探針,
Northern雜交
Northern雜交1.在10~20 ml?預雜交液中68℃溫育膜2h。2.若使用雙鏈探針,在100℃下加熱32P標記的雙鏈DNA 5 min,使之變性,然后迅速移至冰水中冷卻。3.把變性的或單鏈放射性標記的探針直接加到預雜交液中,在合適的溫度下繼續溫育12~16h。4.雜交后,將膜從塑料袋中取出,
Northern雜交
實驗概要本實驗介紹了Northern雜交的基本流程。主要試劑液氮,TRIzol ?(Invitrogen),DEPC水,氯仿,異丙醇,70%酒精,酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),水飽和酚(PH4.3),無水乙醇,NaOAc,抽提緩沖液(0.02M ?NaOAc,1 mM EDTA,0.5% SD
Northern-Blot
試劑、試劑盒 20XMOPS 緩沖液 20XSSC 50XDenhardt 液 雜交液 10%SDS儀器、耗材 水平電泳裝置 水浴 硝酸纖維素膜或尼龍膜 3 MM 濾紙 紫外交聯儀 雜交管 雜交爐 [32P] 標記的 DNA 或 RNA 探針實驗步驟 一、材料與設備1) 水平電泳裝置2) 水浴3)
Northern雜交
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 轉移并固定到膜上的 RNA 樣品可以與特異的探針雜交,從而用來對所感興趣的 RNA 進行定位。視實驗人員和條件的差異,可以從多種方法中選擇任意一種來標記和檢測探針。用抑制非特異吸收探針的封閉試劑處理膜之后,在適于探針和固定的
Northern-blot技術
經乙二醛和二甲基亞砜變性處理后進行的RNA電泳 這一方法原于McMaster和Carmichael(1977)。 含有乙二醛-DMSO的凝膠比含有甲醛的凝膠更難于進行電泳, 因為前者泳動速率較慢而且需將電泳液時行循環以避免電泳過程中形成過高的H+梯度。盡管上述兩種凝膠具有近乎相等的分辨率(Mill
Northern-blot技術
經乙二醛和二甲基亞砜變性處理后進行的RNA電泳 這一方法原于McMaster和Carmichael(1977)。 含有乙二醛-DMSO的凝膠比含有甲醛的凝膠更難于進行電泳, 因為前者泳動速率較慢而且需將電泳液時行循環以避免電泳過程中形成過高的H+梯度。盡管上述兩種凝膠具有近乎相等的分辨率(Mill
Northern-blot實驗
Northern blot技術 Northern Blot ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 將RNA樣品通過變性瓊脂糖凝膠電泳進行分離,再轉移至尼龍膜等固相膜載體上,
Northern-Blot技術
[儀器、試劑、材料](一)儀器恒溫水浴箱,電泳儀,凝膠成像系統,真空轉移儀,真空泵,UV 交聯儀,雜交爐,恒溫搖床,脫色搖床,漩渦振蕩器,分光光度計,微量移液器,電爐(或微波爐),離心管,燒杯,量筒,三角瓶,等。?(二)材料總RNA樣品或mRNA樣品,探針模板DNA(25 ng),尼龍膜(三)試劑N
Protocol-of-Northern-blot
Protocol of Northern blot質粒的轉化和擴增質粒的鑒定目的基因片段的切割3.1樣品雙酶切(175μl水解體系)DW 115μlBuffer B(10×) 17.5μlBaM H 15μlPst I 17μlDNA(MMP-9) 16μlBSA 4.5μl37℃水浴,3h。3.2
Northern雜交技術
經乙二醛和二甲基亞砜變性處理后進行的RNA電泳這一方法原于McMaster和Carmichael(1977)。?含有乙二醛-DMSO的凝膠比含有甲醛的凝膠更難于進行電泳,因為前者泳動速率較慢而且需將電泳液時行循環以避免電泳過程中形成過高的H+梯度。盡管上述兩種凝膠具有近乎相等的分辨率(Miller,