Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以及腫瘤和患者DNA的表觀遺傳調控。 最新一期(3月29日)的《科學》(Science)雜志以“ Cancer Genomics”為題對癌癥基因組學進行了專題介紹，其中包括1篇介紹性文章，1篇評論文章，2篇新聞文章和4篇綜述文章。除此之外在Science Signaling和Science Careers也有相關的內容。 由于一直以來沒有任何單一的遺傳變異或表觀遺傳效應被確定為對抗所有癌癥的靶標，因而不幸目前還沒有治療癌癥的靈丹妙藥。在一篇題為“Cancer Genome Landscapes”的綜述評論中，......閱讀全文
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作，向醫生推廣藥物基因組學檢測；印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心，旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤，從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
每個癌癥患者都應進行DNA測序
英國首席醫療官薩利·戴維斯女士近日發布了一份年度報告，主旨是建議每個癌癥患者接受DNA測序，以防止誤診、不必要的反復確診和無效的化療。 目前，英國每年有超過35萬人被診斷患有癌癥，每年約有16.3萬人因此死亡。薩利表示，是時候結束“診斷性惡性腫瘤”了，這類患者一般要咨詢5位以上醫生，在確診前平
PNAS：新測序方法助力癌癥研究
在去年圣誕節期間的加拿大落基山脈冰攀之旅中，兩位來自華盛頓大學的年輕研究人員：Michael Schmitt和Jesse Salk突發奇想，談到了一個簡單但功能強大，可用于檢測癌細胞，獲得更好結果的新方法――如果他們能降低DNA測序中的錯誤率，那么就可以更好的檢測出這些細胞中的變異，這種改進
測序技術發展過快？基因組學千萬大獎告吹
X獎基金會近日決定取消了獎金高達1000萬美元的基因組學Archon X獎(Archon Genomics X Prize)，因為基因組測序成本的直線下降已使得競爭毫無意義。 X獎基金會的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了關閉競賽的決定。他表示，這是因為如今
基因組學大牛Science發布癌癥重大成果
Whitehead研究所的科學家們發現，稱作為“隔絕鄰域”的環狀染色質結構遭到破壞可以激活能夠推動侵襲性腫瘤生長的癌基因。這一研究發現對于癌癥診斷及治療均具有重大的意義。相關論文發布在《科學》(science)雜志上。 領導這一研究的是Whitehead生物醫學研究所的Richard A Yo
檢測癌癥相關DNA修飾新測序方法
牛津Ludwig癌癥研究所助理成員Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler領導的這項研究表明，他們開發的新方法，TET輔助吡啶硼烷測序（TET-assisted pyridine borane sequencing，TAPS）是一種比亞硫酸氫鹽測序（bis
細胞核重編程與癌癥基因組學論壇召開
近日，由《自然—遺傳學》雜志主辦、中科院廣州生物醫藥與健康研究院承辦的“細胞核重編程與癌癥基因組學”論壇在廣州召開。 據了解，在干細胞研究中，誘導多能干細胞的重編程是該領域最受關注的問題之一。目前，干細胞研究和腫瘤研究存在很多交叉。將這兩個領域的研究結合起來，有利于更好地使再生醫學得以應用并輔
采用新一代測序法的宏基因組學研究
直到不久之前，宏基因組學研究還因為高費用、低流通量以及在應用Sanger-方法克隆步驟中出現的結果不準確而受到限制。而今借助于新一代序列測定方法即可獲得宏基因組樣品全面的圖像。宏基因組學研究（metagenomics）是指研究一種復雜微生物群體在其生命空間的全部基因信息。研究的主要目的在于刻畫
新一代測序將如何改變法醫基因組學
Bruce Budowle博士是北德克薩斯大學健康科學中心(UNTHSC)應用遺傳學研究所的執行主任。自2009年成立以來，該研究所集中了一大批致力于完善遺傳學方法的知名科學家，以增強幾個研究領域，包括法醫DNA。在UNTHSC的法醫科學項目(全美只有14個)
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
Cell新文章：癌癥全基因組測序
根據華盛頓大學醫學院的一項新研究，具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發表在9月13日的《細胞》(Cell)雜志上。 論文的資深作者、華盛頓大學基因組研究所主任Richard K. Wilson 說：“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因
Nature子刊：癌癥單細胞測序新技術
只有通過近距離觀看修拉(Seurat)的繪畫，你才能鑒別出點描法背后的復雜性。其在模式中應用了不同的純色小點，從遠處看就形成了一幅圖像。與之相似，生物學家們和遺傳學長期以來也在尋求在單細胞水平上分析基因的圖譜，然而技術局限性使得直到現在也只能在遠處遙望。 發布在7月22日《自然生物技術》(
應用癌癥基因組學方法，發現與年齡相關的血液疾病
克隆造血是一種生物過程，在這個過程中，血液干細胞(產生多種血細胞類型的細胞群)獲得了有利的突變，超過了鄰近的細胞。當這種突變出現在一個特定個體2%的血細胞中時，克隆造血就被診斷出來。驅動克隆造血的有利突變處于正選擇狀態，就像導致細胞惡性化的癌癥基因突變一樣。在ICREA研究教授Núria López
三代測序的DNA提取和宏基因組學分析（一）
改進的人類腸道微生物組的高分子量DNA提取，納米孔測序和宏基因組學裝配Improved high-molecular-weight DNA extraction,nanopore sequencing and metagenomicassembly from the human gut microb
三代測序的DNA提取和宏基因組學分析（二）
優勢與局限這種DNA提取方法已被優化用于從人類糞便樣本中提取高分子量(HMW)DNA，但也已在模擬微生物群落和細菌分離株上得到驗證。我們希望該方案可以適用于其他樣品類型，盡管可能需要對裂解前和裂解后步驟進行修改以解釋特定于樣品的制備和污染物清除的問題是必要的。機械裂解方法（如珠子擊打）仍然是連續裂解
Nature外顯子測序發現癌癥等相關突變
來自西雅圖兒童醫院，芝加哥大學等處的研究人員發表了題為“De novo germline and postzygotic mutations in AKT3, PIK3R2 and PIK3CA cause a spectrum of related megalencephaly syn
CollabRx公司:－推出分析工具角逐癌癥基因測序市場
位于舊金山的生物技術公司 CollabRx宣布將要競逐癌癥基因測序市場，公司目前推出了一套Genetic Variant Annotation (GVA)的服務軟件，能幫助研究人員分離定位并鑒定癌癥基因。利用生物信息學確定癌癥基因已經成為癌癥研究人員研究的重要途徑之一，因此也使得這個領域成為
單細胞測序技術在癌癥治療中的應用
單細胞測序技術在癌癥治療中的應用具有重要意義，以下是詳細的介紹：腫瘤異質性分析癌癥通常由具有不同基因表達模式和突變特征的細胞群體組成。單細胞測序能夠揭示腫瘤內細胞的異質性，包括不同的亞型、分化狀態和惡性程度。這有助于更全面地理解腫瘤的發展和演進，為制定個性化治療方案提供依據。發現新的治療靶點通過對大
多種測序技術或將深入推動癌癥領域研究
本文中小編整理了多篇文章，來解讀測序技術在闡明癌癥發生機制、癌癥診斷及療法開發等方面的巨大潛力，與各位一起學習！ 【1】JAMIA：新工具深入挖掘外顯子測序結果 幫助找到最佳癌癥治療藥物 doi：10.1093/jamia/ocw022 科羅拉多大學的研究人員最近在國際學術期刊JAMIA上
證實基因組測序成功鑒定癌癥相關突變
最近，UT西南醫學中心的癌癥研究人員表明，全基因組測序可以用來確定患者遺傳性癌癥的風險，這可能會促進癌癥的預防、診斷和護理。 這項研究首次采用全基因組測序來評估258名癌癥患者的基因組，以提高癌癥誘發突變的診斷能力。相關研究結果發表在12月份的國際期刊《EBioMedicine》。 UT西南
單細胞基因組學：通往個體化醫療之門
隨著第二代測序技術的普及，單細胞測序迎來了迅猛發展。 近日，南方科技大學生物學系副教授賀建奎在美國冷泉港參加了單細胞分析會議后，在科學網博客里寫道：“這是一個非常令人激動的前沿學術會議，我深深地體會到了單細胞基因組學時代的來臨。” 他對《中國科學報》表示：“單細胞基因測序技術的突破，只是開了
北大特聘教授探討破解癌癥耐藥性的基因組學方法
近日，北京大學的張澤民教授在Trends in Genetics雜志上發表文章，探討了破解癌癥耐藥性機制的基因組學方法。 癌癥精確醫療面臨的主要障礙是，靶向性治療總是會遇到抵抗。因此了解和克服癌癥耐藥性，成為研究的焦點。 癌癥耐藥性背后的生化和遺傳機制非常復雜。為了克服這一巨大的挑戰，近年來人
北大特聘教授探討破解癌癥耐藥性的基因組學方法
近日，北京大學的張澤民教授在Trends in Genetics雜志上發表文章，探討了破解癌癥耐藥性機制的基因組學方法。 癌癥精確醫療面臨的主要障礙是，靶向性治療總是會遇到抵抗。因此了解和克服癌癥耐藥性，成為研究的焦點。 癌癥耐藥性背后的生化和遺傳機制非常復雜。為了克服這一巨大的挑戰，近年來人
Nature發布大規模癌癥蛋白質基因組學研究重要成果
基于來自癌癥基因組圖譜(TCGA)計劃的數據，一個多機構科學家小組完成了首個大規模的乳腺癌“蛋白質基因組學”（ proteogenomic）研究，將一些DNA突變與蛋白質信號聯系到一起，并幫助確定了一些驅動癌癥的基因。 這項研究旨在通過蛋白質和它們的修飾來更好地認識癌癥。發表在5月25日《自然
基因測癌：在大數據中醞釀“中國突破”
研制鼻咽癌疫苗，引進國際先進的基因檢測平臺……我國科學家表示，如果加大對臨床試驗的數據采集和共享，有望通過基因測序技術讓更多癌癥患者受益。 中醫提倡“治未病”，西醫也在研究通過基因提前治病。一批國際知名的生命科學學者和臨床醫學專家，近日共同交流基因測序的最新研究成果，并探討如何在臨床轉化上取
基因測癌：科學家在大數據中醞釀“中國突破”
研制鼻咽癌疫苗，引進國際先進的基因檢測平臺……我國科學家表示，如果加大對臨床試驗的數據采集和共享，有望通過基因測序技術讓更多癌癥患者受益。 中醫提倡“治未病”，西醫也在研究通過基因提前治病。一批國際知名的生命科學學者和臨床醫學專家，近日共同交流基因測序的最新研究成果，并探討如何在臨床轉化上取得