研究揭示貝葉斯全證據定年對物種采樣偏差具有穩健性
隨著基因組數據的涌現以及形態學數據的積累，綜合利用分子序列和形態性狀進行整合的數據分析逐漸成為演化生物學尤其是系統學研究的熱點。與單獨依賴化石信息或分子數據相比，整合多方面的數據能夠得到更可靠的統計推斷結果，對探討諸多演化生物學問題具有基礎重要性。由于模型的復雜性，合理運用整合分析并在模型和方法上有所突破是當前領域的難點。 近期備受關注的問題是個別數據在進行貝葉斯全證據定年分析時，估算的分化時間過于古老，其結果和化石證據不吻合。這一現象稱為深根吸引（deep root attraction）。針對膜翅目昆蟲和胎盤哺乳動物兩組數據，已有研究表明使用物種多樣化采樣策略（diversified sampling，圖1）的化石生滅模型（fossilized birth-death model）能夠在較大程度上解決深根吸引問題。然而，多樣化采樣的假設僅考慮較為極端的情況。現實情況中物種的采樣模式可能難以建模。這便引出一個問題，即是否......閱讀全文
研究揭示貝葉斯全證據定年對物種采樣偏差具有穩健性
隨著基因組數據的涌現以及形態學數據的積累，綜合利用分子序列和形態性狀進行整合的數據分析逐漸成為演化生物學尤其是系統學研究的熱點。與單獨依賴化石信息或分子數據相比，整合多方面的數據能夠得到更可靠的統計推斷結果，對探討諸多演化生物學問題具有基礎重要性。由于模型的復雜性，合理運用整合分析并在模型和方法
npj:－層狀材料設計—主動學習與貝葉斯優化
由過渡金屬二硫屬化合物單層垂直堆疊而成的異質結在光電和熱電器件領域擁有巨大的應用潛力。發現用于特定領域的最優層狀材料，需要先估算關鍵的材料特性，例如電子能帶結構和熱輸運系數。然而，通過嚴格從頭算方法搜索整個材料結構空間來篩選材料特性大大超過了目前計算資源的限制。此外，材料特性函數對其結構的依賴性
英國科學家利用貝葉斯原理詮釋細胞信號網絡
繁復的細胞信號網絡的解析一直是困擾生物學界的一個難題，眾多的傳導路徑往往使研究人員無從入手，給具體實驗研究帶來極大困擾。而英國格拉斯哥大學研究人員最近證實，通過貝葉斯統計模型，不僅能對細胞信號通路模型進行評級，遴選出最優的傳導路徑，還可對細胞信號網絡模型進行全新的詮釋。這一代表了細胞
數學院等在貝葉斯模型選擇漸進行為研究中取得進展
近日，中國科學院數學與系統科學研究院和英國倫敦大學科研人員合作的關于貝葉斯模型選擇的漸進行為的研究成果，在線發表在PNAS上。研究表明，貝葉斯模型選擇的病態漸進行為是使用貝葉斯方法進行物種進化樹估計得到不合理結果的可能原因。 模型選擇與假設檢驗是統計學中比較棘手的問題。經典統計與貝葉斯統計的處
分子物種定界可使用貝葉斯模型選擇方法和參數估計方法
物種定界是分類學最基本的問題，基于貝葉斯模型選擇方法的BPP軟件是最為廣泛使用的分子物種定界軟件。一些對貝葉斯物種定界的模擬研究認為BPP軟件檢測到的是群體分化而非物種分化，并且當分析多基因數據時，該軟件傾向于過度定界，即過度劃分物種。 近日，中國科學院數學與系統科學研究院科研人員在分子物種定
歐洲山毛櫸枝條光合過程中碳同位素測量的貝葉斯模擬...
歐洲山毛櫸枝條光合過程中碳同位素測量的貝葉斯模擬方法LYDIA GENTSCH, ALBIN HAMMERLE, PATRICK STURM, JéR?ME OGéE, LISA WINGATE, & ROLF SIEGWOLF et al. (2014). Carbon isotope dis
“隱世”百年的貝葉芒毛苣苔現身
墨脫縣位于西藏自治區東南部的南迦巴瓦峰南麓，地形復雜，交通不便，是中國最后一個通公路的縣。西南季風沿雅魯藏布江河谷將來自印度洋的暖濕氣流源源不斷的向北輸送，在此遇到巨大的地形屏障阻擋形成比其他同緯度地區更為豐富的降水，使得該地區成為青藏高原南緣山地最溫暖、濕潤的地區。獨特的地形氣候條件使得墨脫地區在
全葉延胡索的介紹
全葉延胡索(原變種) 產 黑龍江省、吉林省、遼寧省，生于海拔700-1000米的灌木林下或林緣。俄羅斯遠東的符拉迪沃斯托克（ 海參崴）和朝鮮有分布。
利用貝葉斯方法推斷中生代鳥類分化時間和特征演化速率
近日，《英國皇家學會開放科學》（Royal Society Open Science）在線發表了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所張馳和王敏的研究工作。該研究利用貝葉斯末端定年法（Bayesian tip dating）推斷了中生代主要鳥類支系的系統發育關系、分化時間及特征的演化速率，并包含這些
全葉延胡索的形態特征
多年生草本，高8-14（-20）厘米。塊莖球形，直徑約1-1.5厘米，有時瓣裂，內質近白色，微苦。莖細長，基部以上具1鱗片，枝條發自鱗片腋內。葉二回三出，小葉披針形至倒卵形，全緣，有時分裂，長6-25（-40）毫米，寬5-16（-20）毫米，常具淺白色的條紋或斑點，光滑或邊緣具粗糙的小乳突。總狀
全葉延胡索的形態特征
多年生草本，高8-14（-20）厘米。塊莖球形，直徑約1-1.5厘米，有時瓣裂，內質近白色，微苦。莖細長，基部以上具1鱗片，枝條發自鱗片腋內。葉二回三出，小葉披針形至倒卵形，全緣，有時分裂，長6-25（-40）毫米，寬5-16（-20）毫米，常具淺白色的條紋或斑點，光滑或邊緣具粗糙的小乳突。總狀
全葉延胡索的產地生境
產黑龍江、吉林、遼寧，生于海拔700-1000米的灌木林下或林緣。俄羅斯遠東的符拉迪沃斯托克（海參崴）和朝鮮有分布。
古鳥類葉食性的起源有了新證據
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505801.shtm被子植物決定了現代地球陸地生態系統主要景觀構成，維持著包括人類在內大量多門類生物類群的生存需求。長久以來，科學家認為鳥類可能在被子植物起源和早期多樣性方面扮演著協同演化的重要角色。然而
一種基于貝葉斯頻率估計算法的窄帶有源噪聲控制系統
窄帶有源噪聲控制是一種通過發出與初始噪聲幅度相同、相位相反的聲波從而有效降低低頻窄帶噪聲的控制手段。窄帶有源噪聲控制算法需要預先獲得初始噪聲的頻率信息，包括頻率個數及各個頻率值。 傳統的基于自適應陷波器（adaptive notch filter，ANF）的頻率估計方法需要人為設置頻率個數，且
顧勇團隊揭示多模態感覺信息整合與決策的神經機制－?
生物體處在一個復雜多變的環境中，不同感覺信息輸入的可靠性往往隨著時間發生改變。例如，當我們在高速公路上突然駛入一團迷霧時，由于路面視覺信息輸入的可靠性迅速降低，大腦需要立即調整策略，更多地依賴儀表讀數、前庭覺、觸覺和聽覺等其它信息來判斷車輛的行駛速度和方向，從而隨時做出“是否需要剎車”和“是否需
多模態感覺信息整合與決策的神經機制研究獲進展
10月10日，《神經元》期刊在線發表了題為《利用線性不變概率性群體編碼實現基于復雜多模態感覺信息的最優決策》的研究論文，該研究由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心（神經科學研究所）、中科院靈長類神經生物學重點實驗室、上海腦科學與類腦研究中心空間感知研究組與瑞士日內瓦大學認知計算神經科學研究組
Neuron：多模態感覺信息整合與決策的神經機制
2019年10月10日，中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心、中科院靈長類神經生物學重點實驗室、上海腦科學與類腦研究中心空間感知研究組顧勇研究員團隊與瑞士日內瓦大學認知計算神經科學Alexandre Pouget研究組合作在Neuron雜志上發表了題為“Neural Correlates of
全葉延胡索的形態特征及產地生境
形態特征 多年生草本，高8-14（-20）厘米。塊莖球形，直徑約1-1.5厘米，有時瓣裂，內質近白色，微苦。莖細長，基部以上具1鱗片，枝條發自鱗片腋內。葉二回三出，小葉披針形至倒卵形，全緣，有時分裂，長6-25（-40）毫米，寬5-16（-20）毫米，常具淺白色的條紋或斑點，光滑或邊緣具粗糙的
希格斯粒子賦予其他基本粒子質量有了證據
大型強子對撞機ATLAS探測器實驗數據 世界最強大的粒子加速器——大型強子對撞機（LHC），其超環面儀器（ATLAS）實驗日前報告了可用來測試希格斯粒子機制的第一個證據，正是這一機制，讓希格斯粒子可以賦予其他基本粒子以質量。這一機制的出現，比希格斯粒子的產生本身更為罕見。此發現到目前為止與標準模型
動物所在物種進化歷史分歧時間估算方法研究中取得進展
物種分歧時間估算一直是生命之樹（Tree of Life）進化歷史研究中具挑戰性的熱點工作。分析過程通常涉及：核苷酸序列數據的系統發育分析；在重建的系統發育樹的基礎上，基于化石信息校準內部節點時點區間。在現有的絕大多數利用基因或基因組數據開展的工作中，來自化石或生物地質事件的外在時間校準信息多由
趙新全小組提供青藏高原返青期提前觀測證據
日前，記者從中科院西北高原生物所獲悉，該所趙新全課題組研究人員利用1990年到2006年間青藏高原東部5個觀測站點、11種優勢植物的野外物候觀測數據，分別在種、科和植被類型不同層次進行了分析，首次從不同水平提供了青藏高原植物返青期提前的實際觀測證據，發現高寒草甸和高寒草原具有不同的返青期變化趨勢
活細胞超分辨率顯微技術研究獲進展
2016年12月31日，中國科學院生物物理研究所徐平勇課題組、中國科學院計算技術研究所張法課題組以及美國科學院院士HHMI研究員Jennifer Lippincott-Schwartz合作在《細胞研究》（Cell Research）在線發表了題為Live-cell single molecule
古脊椎所等在角形類系統發育研究中取得進展
犀牛和貘在外形上差別較大，但兩者均屬于奇蹄目，形態和分子生物學的證據表明兩者構成姐妹群，由共同的祖先演化而來，統稱為角形類（Ceratomorpha）。雖然現生的犀僅包括四屬五種，貘僅有一屬四種，但是在新生代（6500萬年前至今）的較長時期內，角形類是非常繁盛、多樣的類群。約5000萬年前的早始
藏北羌塘中部中央隆起帶再次發現古特提斯洋證據
西藏羌塘盆地是青藏高原北部重要的含有多種資源潛力的盆地，近年來成為油氣、礦產資源勘查的重要地區。而羌塘盆地的構造演化是學術界關注和爭論的焦點。爭論的關鍵科學問題是羌塘盆地中部的中央隆起帶（高壓變質帶）是原位形成的，抑或是由北側的金沙江帶向南俯沖形成的；另一科學問題則是判斷羌塘盆地中部中央隆起帶是代表
超高分辨成像技術實現納米尺度的活細胞核內動態觀測
近日，在國家自然科學基金國家重大科研儀器研制項目（31327901）、面上項目（31271423、21573013）等資助下，北京大學研究人員首次應用新型超分辨成像技術實現了活細胞單 個轉錄工廠(RNA Pol II cluster)的動態過程觀測和定量分析，研究成果以“Study of RNA
低能宇宙相變參數空間研究取得進展
宇宙溫度從遠大于1012開爾文的高溫冷卻到如今接近絕對零度，經歷了138億年的歷史。早期宇宙是混沌的夸克-膠子等離子體，經歷了基于粒子物理模型的數次標志性相變后，當前宇宙相對穩定的結構得以形成。在相變發生過程中，真空泡泡不斷產生，膨脹、碰撞、融合，最終物理參數穩定在有效勢能的真空附近。原則上，相
凱氏一福斯自動定氮儀的性能實驗
蛋白質是極其復雜的含氮有機化合物，是構成活細胞原生質的主要成分，是動植物有機體內進行生命過程的物質基礎。因此谷物中蛋白質含量是衡量其品質和營養價值的最重要指標。 測定蛋白質的方法很多，國際上通常以凱氏定氮儀為主的凱氏定氮法。凱氏定氮法具有很高的準確度和精確度，但操作手續較繁，分析速度較慢，不適
2018年拉斯克獎揭曉
9月11日，2018年拉斯克獎獲獎者新鮮出爐。拉斯克獎是生物醫學領域最重要的獎項之一，包括基礎醫學研究、臨床醫學研究及特殊成就這三個獎項。今年的基礎醫學研究獎授予發現并解開組蛋白與基因調控關系的C. David Allis 和 Michael Grunstein；臨床醫學研究獎得主是發明了當下醫
福斯2011年培訓課程通知
尊敬的各位FOSS用戶： FOSS計劃在2011年度提供的培訓課程如下：課程主題起始時間結束時間地點第一期近紅外分析儀培訓班2011年4月4日4月7日北京第一期乳品分析儀器培訓班2011年5月16日5月19日北京第二期近紅外分析儀培訓班2011年7月18日7月21日北京第二期乳品
2009年拉斯克獎公布
英國科學家約翰·格登和日本科學家山中伸彌獲基礎醫學獎 美國Lasker基金會9月15日宣布了2009年拉斯克獎(Albert Lasker Award)的獲獎者，今年共有5位科學獎獲獎。 2009年拉斯克基礎醫學獎授予英國劍橋大學的John Gurdon和日本京都大學的Shinya