靈長類動物結構變異的機制
2013年度基因組生物學大會(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美國紐約冷泉港實驗室召開。這是基因組學領域最大的會議之一，吸引了多個著名研究所的大牛參加。會議主題包括高通量基因組學和遺傳學、復雜性狀的遺傳學、功能和癌癥基因組學、計算基因組學、進化基因組學以及群體基因組變異。 歐洲分子生物學實驗室的研究生Verena Tischler在會議上報告稱，靈長類動物基因組中結構變異的差異可能要歸因于不同的形成機制。 對于人類而言，結構變異與多種疾病狀態相關聯，包括自閉癥和精神分裂癥。但是對于其他靈長類動物，結構變異的程度、形成機制及其影響還不清楚。為了解決這些問題，Tischler及其同事利用全基因組測序建立了黑猩猩、猩猩和恒河猴的結構變異圖譜。 通過這樣一張圖譜，她們對靈長類動物中驅動de novo結構變異形成的機制進行了研究。大規模變異可通過幾種方式發生，包括非等位基......閱讀全文
Cell－Rep：用CRISPR/Cas誘導基因組結構變異
2月10日，德國馬克斯普朗克分子遺傳學研究所的研究人員在《Cell Reports》發表一項最新研究成果，題為“Deletions, Inversions, Duplications: Engineering of Structural Variants using CRISPR/Cas in
遺傳發育所完成基因組結構變異檢測基準測試
結構變異廣泛存在于植物基因組中，在基因表達調控、表型建成和適應性進化等方面發揮著關鍵作用。由于結構變異跨度大、結構復雜等特性，結構變異的精準檢測頗具挑戰性。近年來，三代測序的發展提升了測序的長度和準確性，為結構變異的全基因組精準檢測提供了契機。然而，主流的結構變異分析算法和軟件多為人類基因組設計和開
北京基因組所構建完成質體基因組結構變異數據庫
多相催化是實現高效定向化學轉化的關鍵技術，其中的一個重要基礎科學問題是如何通過精確設計和調控催化活性位結構及所在環境，從而強化其定向催化功能并創造新型高效催化劑。近日，中國科學技術大學熊宇杰教授課題組和江俊教授課題組繼在電催化體系中提出表面極化概念后,再次通過與黃偉新教授課題組合作，證實界面極化
北京生科院在基因組結構變異識別領域取得新進展
基因組結構變異是指基因組上由于一段或者多段基因序列因遺傳、病變或自然突變等原因在基因組上產生的插入、刪除、倒位、移位等變異。從規模上講，包括小至若干堿基對的變異到大至上萬堿基對甚至染色體規模的復雜變異。每一個人的基因組上都存在大量不同規模、不同類型的結構變異，這些結構變異不僅是造成人與人之間表型
天津大學研究成果填補基因組結構變異的技術空白
?? 天津大學元英進教授帶領的合成生物學研究團隊在《自然通訊》期刊同期發表《精確控制合成型單倍體和二倍體酵母基因組重排》《體外DNA重排》《雜合二倍體與跨物種基因組重排》三篇研究長文，文中介紹了精確控制基因組重排技術等一系列研究成果。該成果填補了基因組結構變異的技術空白，提高了細胞工廠的生產效率，加
昆明動物所發布中國恒河猴基因組并解析猿類結構變異
恒河猴（Macaca mulatta）是生物科學研究和新藥研發廣泛應用的非人靈長類實驗動物。構建一個高質量的恒河猴基因組是開展相關研究的重要基礎。當前國際上廣泛使用的是印度恒河猴的參考基因組，但這個主要基于二代測序的恒河猴參考基因組組裝質量較差，序列碎片化和缺失嚴重，極大地限制了它的應用，特別是
研究人員提出基因組結構變異檢測和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
長讀長測序顯優勢－基因組復雜結構變異檢測實現新突破
基因組結構變異是很多癌癥、遺傳病等疾病的重要誘因。目前基于二代測序技術檢測基因組結構變異存在很大的局限性，而三代測序存在錯誤率較高等多種問題，尤其針對復雜結構變異大多軟件識別能力較差。針對這一問題，近日，在Nature Methods發表的一項最新研究中，研究人員開發了基因組比對工具NGMLR和
Nature子刊：癌癥基因組三維結構和拷貝數變異關系
來自北京大學生命科學學院，清華-北大生命科學聯合中心等處的研究人員發表了題為“3D genome of multiple myeloma reveals spatial genome disorganization associated with copy number variations”的
染色體結構變異實驗
實驗方法原理：染色體結構變異主要有缺失、重復、倒位、易位四種。其發生過程是由于同源染色體或非同源染色體之間發生斷裂，然后發生錯誤重接的結果。各種結構變異的雜合體，在細胞分裂過程中常常表現不正常的細胞學行為，可以進行細胞學鑒定。在減數分裂過程粗線期，可以觀察到缺失雜合體的“缺失環”，重復雜合體的染色體
染色體結構變異實驗
實驗方法原理染色體結構變異主要有缺失、重復、倒位、易位四種。其發生過程是由于同源染色體或非同源染色體之間發生斷裂，然后發生錯誤重接的結果。各種結構變異的雜合體，在細胞分裂過程中常常表現不正常的細胞學行為，可以進行細胞學鑒定。在減數分裂過程粗線期，可以觀察到缺失雜合體的“缺失環”，重復雜合體的染色體突
染色體結構變異實驗
實驗方法原理?染色體結構變異主要有缺失、重復、倒位、易位四種。其發生過程是由于同源染色體或非同源染色體之間發生斷裂，然后發生錯誤重接的結果。各種結構變異的雜合體，在細胞分裂過程中常常表現不正常的細胞學行為，可以進行細胞學鑒定。在減數分裂過程粗線期，可以觀察到缺失雜合體的“缺失環”，重復雜合體的染色體
武漢植物園在菱屬泛基因組和結構變異研究中獲進展
水稻、玉米和小麥是三大主糧作物，但主糧來源單一成為糧食安全和營養安全的隱患，因此對“孤兒作物”（orphan crop）的重視利用是應對糧食安全危機的有效手段之一。然而，隨著城鄉現代化進程的持續推進和現代集約化農業的快速發展，“孤兒作物”野生種和地方品種資源正日趨減少，與主糧作物相比，其種質資源
研究揭示：基因組中復雜結構變異對藏綿羊適應高原有重要貢獻
日前，記者從西北農林科技大學獲悉，該校近期聯合西藏農牧科學院等多家科研機構，在藏綿羊基因組中發現了一個包含β-珠蛋白（HBB）的受選擇位點。科研人員進一步分析，該位點包含一段較為復雜的結構變異。這一發現揭示了藏綿羊快速適應青藏高原嚴苛自然環境的遺傳機制，對高原家畜遺傳資源的保護和利用具有重要指導意義
Science：一種發現人類基因組中結構變異的新方法
自從20多年前首次對人類基因組進行測序以來，對人類基因組的研究幾乎完全依賴于單一的參考基因組，并與其他基因組進行比較，以確定遺傳變異。科學家們早就認識到，單一參考基因組不能代表人類的多樣性，而且使用它給這些研究帶來普遍的偏差。如今，在一項新的研究中，來自美國加州大學圣克魯茲分校和田納西大學等研究
葉綠體和線粒體基因組變異檢測獲突破
近日，《公共科學圖書館―綜合》發表了中國農業科學院油料作物研究所博士后曾長立與合作導師伍曉明研究建立的能高通量檢測葉綠體和線粒體基因組遺傳變異的新方法。 據曾長立介紹，葉綠體和線粒體基因組作為植物細胞質基因組，對光合作用、呼吸作用等重要生命過程具有重要意義。 研究葉綠體和線粒體基因組
全基因組測序確定腦瘤的基因變異
日前，圣猶達兒童研究醫院（St. Jude Children's Research Hospital）的研究人員在新研究中鑒別出了一種兒童腦瘤亞型一半以上患者的致病性突變。此外他們還證實這些腫瘤對已經在研發中的一些藥物敏感。這項研究論文刊登在了近期出版的《自然-遺傳學》（Nature Genet
靈長類動物結構變異的機制
2013年度基因組生物學大會(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美國紐約冷泉港實驗室召開。這是基因組學領域最大的會議之一，吸引了多個著名研究所的大牛參加。會議主題包括高通量基因組學和遺傳學、復雜性狀的遺傳學、功能和癌癥基因組學、計算基因組學、進化基因組學以
植物誘導染色體結構變異
實驗概要了解染色體結構發生變異后，在有絲分裂的細胞中，可以觀察到在后期出現染色體橋或染色體斷片，在間期的細胞可以觀察到微核。實驗原理染色體結構變異主要有缺失、重復、倒位、易位四種。其發生過程是由于同源染色體或非同源染色體之間發生斷裂，然后發生錯誤重接的結果。各種結構變異的雜合體，在細胞分裂過程中常常
構建水稻基因組倒位變異圖譜
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內多家單位發布了迄今為止最大的水稻群體水平倒位變異圖譜，并挖掘獲得了新的水稻耐熱優異等位基因，該研究對水稻育種改良具有重要意義。相關研究成果發表在《科學通報（Science Bulletin）》上。 水稻中的基因組倒位變異是指染色體上的DNA序列發
全基因組研究識別出飲酒吸煙相關變異
根據《自然》近日發表的遺傳學研究，在一項涉及近340萬人的多血統全基因組關聯研究（GWAS）中，發現了近4000個與吸煙和飲酒行為相關的遺傳變異。這些發現對這類復雜行為的潛在遺傳影響提供了見解。 吸煙和飲酒是多種疾病和紊亂的主要風險因素，雖然它們也受文化背景、公共健康政策等環境因素影響，有顯著證
數字PCR和基因組拷貝數變異研究
概述什么是拷貝數變異？為什么要對拷貝數變異進行研究？復旦大學杜仁騫、金力和張鋒三位老師發表于2011年8月《遺傳》的綜述，給出了簡明扼要的說明與回答，特引述如下：“拷貝數變異（Copy number variation, CNV）是由基因組發生重排而導至的，一般指長度為1 Kb以上的基因組大
染色體結構變異的種類介紹
在自然條件或人為因素的影響下，染色體發生的結構變異主要有4種： 1.缺失 染色體中某一片段的缺失 例如，貓叫綜合征是人的第5號染色體部分缺失引起的遺傳病，因為患病兒童哭聲輕，音調高，很像貓叫而得名。貓叫綜合征患者的兩眼距離較遠，耳位低下，生長發育遲緩，而且存在嚴重的智力障礙；果蠅的缺刻翅的形成
黃瓜變異組研究奠定全基因組設計育種基礎
中國農業科學院蔬菜花卉研究所領導的國際黃瓜變異組研究團隊，對115個黃瓜品系進行深度重測序，構建了包含360多萬個位點的全基因組遺傳變異圖譜，為全面了解黃瓜進化及多樣性提供了新思路，并為全基因組設計育種打下了基礎。相關成果10月20日在線發表于《自然·遺傳學》雜志。 據國際黃瓜基因組計劃首
染色體結構變異的相關應用介紹
1、基因定位 （1）利用缺失進行基因定位：利用假顯性現象，雜合體表現隱性性狀，進行基因定位，其關鍵為使載有顯性基因的染色體發生缺失→隱性等位基因很有可能表現“假顯性”；對表現假顯性現象個體進行細胞學鑒定→鑒定發生缺失某一區段的染色體 （2）利用易位進行基因定位：將易位半不育現象看做一個顯性性
結構變異：甘藍進化的“分子加速器”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517537.shtm結球甘藍、抱子甘藍、羽衣甘藍、球莖甘藍，加上芥藍、青花菜、花椰菜……這些看起來長得非常不一樣的蔬菜，都是甘藍。 甘藍群體具有豐富的形態多樣性。受訪者供圖“甘藍類蔬菜作物表型變異
酸漿屬果實進化發育基因組變異機制研究獲進展
近日，中科院植物研究所研究員賀超英團隊與合作者在酸漿屬果實進化發育基因組變異機制上取得新進展，他們提出了“中國燈籠”這一形態創新起源的原創性模型，即“雄性育性遺傳腐蝕-恢復”模型。相關研究成果發表于《園藝研究》。茄科酸漿屬宿存花萼在受精后隨漿果發育迅速膨大，形成“中國燈籠”或膨大花萼綜合征（ICS）
基因組組構的結構特征
中文名稱基因組組構英文名稱genome organization定 義生物的基因組在諸如各基因的排列順序、基因的結構、同源基因的序列差異等基因組結構上的特征。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
基因組重構的結構特征
中文名稱基因組重構英文名稱genome reorganization定 義由于進化中的選擇壓力所造成的物種間在基因組結構特征上的改變。可以通過染色體重排(如缺失、擴增、置換等)形成。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
HIV的結構和基因組
HIV的結構和基因組 HIV屬逆轉錄病毒科慢病毒屬。為逆轉錄RNA病毒。形狀為圓形或桿狀，直徑100～140nm. 1.HIV的結構蛋白：①包膜蛋白：含外膜蛋白和跨膜蛋白，信號肽。②核心蛋白：在細胞內合成，包括p24、pl7和pl2三種結構蛋白、RNA逆轉錄酶、蛋白酶和整合酶。 2.HlV基因