Nature,Science兩大頂級雜志聚焦“第二基因組”
人體內有兩個基因組,一個是從父母那里遺傳來的人基因組;另一個則是出生以后才進入人體、特別是腸道內的多達1000多種的共生微生物,其遺傳信息的總和叫“微生物組”,也可稱為“元基因組”,相當于人的第二個基因組,它們所編碼的基因有100萬個以上。兩個基因組相互協調、和諧一致,保證了人體的健康。 早在2007年,美國國立衛生研究院就出資1億多美元啟動了人類微生物組路線圖計劃,日本也啟動了人類元基因組研究計劃。近年來這些研究也取得了一些成果,如去年Nature就公布了一項大型微生物組的研究成果,研究人員對來自非洲、南美和美國的531份人類糞便樣本展開了研究,揭示了隨著年齡人類腸道微生物的改變以及在不同國家人群中的差異。 腸道微生物與肥胖 來自華盛頓大學醫學院等處的研究人員在Science雜志上發表了題為“Gut Microbiota from Twins Discordant for Obesity Modula......閱讀全文
首個草魚腸道微生物基因目錄構建
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515836.shtm10日,記者從中國農業科學院獲悉,該院飼料研究所水產微生物與飼料創新團隊成功構建了首個草魚腸道微生物基因目錄。該成果日前發表于國際期刊《微生物組》。腸道菌群在魚類的新陳代謝過程和免疫系
華大基因完成腸道微生物基因組關聯分析
從物種、功能及生態群落上展示腸道微生物與結直腸腺瘤及結直腸癌的關聯特征,這是深圳華大基因研究院、奧地利因斯布魯克醫科大學、奧本多夫醫院、丹麥哥本哈根大學、華南理工大學等多家單位最新的聯合取得的科研進展。3月11日,國際學術期刊《自然通訊》雜志發表了這項研究成果。該研究對結直腸腺瘤、結直腸癌的早期
母親與嬰兒腸道微生物可共享基因
近日,研究人員發現了一種母嬰微生物群垂直傳播的新模式。從圍產期一直延續到出生后的幾周,母體腸道中的微生物與嬰兒腸道中的微生物共享基因。相關研究近日發表于《細胞》雜志。 研究表明,這種水平基因轉移使母體微生物菌株能夠在其沒有持續轉移的情況下,影響嬰兒微生物組的功能。這項大規模綜合分析,提供了一系列
基因測序找出腸道核心微生物群
人類腸道中有數以萬億計的微生物,也稱為腸道菌群,與多種疾病如腸炎、肥胖、糖尿病等都有關系。最近,比利時魯汶大學和荷蘭格林寧根大學兩個團隊分別在《科學》雜志發表論文,通過兩項大型研究計劃找出了腸道核心微生物群,為進一步建立生物標記體系,評估腸道菌群是否正常提供了線索。 腸道微生物組能產生維生素
原來腸道也必須吃東西!腸道微生物到底影響了哪些基因
胃腸道微生物在宿主的生理、代謝和營養中起著重要作用。腸道微生物群落的改變與許多腸道疾病有關,包括癌癥、肥胖和各種腸道疾病。杜克大學(Duke University)的研究人員報告說,他們在小鼠身上進行的新研究表明,微生物能夠影響腸道中的哪些基因正在發揮作用。 該研究結果發表在《細胞與分子胃腸病
華大基因構建全球首個小鼠腸道微生物參考基因集
2015年9月28日,中國深圳—深圳華大基因研究院、哥本哈根大學等研究機構共同構建了全球首個小鼠腸道微生物參考基因集,為以小鼠為基礎的人類疾病模型研究提供有益參考。最新研究成果今日在線發表于《自然生物技術》。 人類的腸道中居住著種類繁多,數量驚人的微生物,而在這些微生物中,細菌的比例高達90%
首個草魚腸道微生物基因目錄構建成功
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516186.shtm近日,中國農業科學院飼料研究所水產微生物與飼料創新團隊構建了首個草魚腸道微生物基因目錄,并解析了草魚腸道微生物組的主要互作模式和功能特征,為魚類腸道菌群調控提供了理論基礎。相關研究成果
腸道免疫系統由腸道微生物守護!
科學家們早就知道腸道細菌對宿主有各種各樣的作用,例如分解膳食纖維、制造維生素K和B7等等。然而,一項新研究揭示,微生物還有另一個作用。 布朗大學的研究小組發現,小鼠體內腸道微生物正在參與調控宿主免疫。與其說宿主的防御系統可能攻擊這些有益細菌,不如說細菌可以與動物的免疫系統和平共存。 對立的外
Nature腸道微生物研究爭論:是環境,還是基因影響更大?
關于對微生物組成的相對影響以及微生物對疾病的影響,到底是宿主遺傳學,還是環境作用更大,一直都是腸道微生物研究的爭論熱點。 一項最新研究指出,環境在確定人類腸道微生物群的組成方面起著比宿主遺傳學更大的作用。這一研究發現,在預測人類特征(如膽固醇水平或肥胖)時,將微生物組學特征納入評估標準,能使得
人類腸道微生物基因集-為研究提供精準數據支持
7月7日,由華南理工大學生物科學與工程學院博士研究生李俊樺為第一作者,與深圳華大基因研究院、丹麥哥本哈根大學等單位共同合作完成的《人腸道微生物組參考基因集》研究成果在《自然—生物技術》上發表。這是“華工—華大”基因組科學創新班學子在國際頂級學術期刊上以第一作者身份發表的第二篇文章。 據介紹,人
口腔、腸道微生物菌群元基因組關聯分析
2015年7月28日,北京協和醫院和華大基因等機構的研究人員共同合作完成了類風濕關節炎(RA)口腔和腸道微生物元基因組研究。本項研究揭示口腔和腸道微生物菌群異常是RA病理生理和疾控的重要環節,并且為元基因組學輔助的RA個性化診療方案提供基礎。研究成果于今日發表在《自然醫學》雜志。 RA是一種致
微生物所在人體腸道細菌耐藥基因研究方面取得進展
人體腸道中棲息著種類繁多的微生物,其數量超過人體自身細胞的10倍以上。這些微生物的基因組中(microbiome)蘊含大量的遺傳信息,被稱為是“人體的第二個基因組(the second genome of human body)”。人體腸道微生物對人體腸道內營養物質的代謝、人體自身的發育
腸道微生物影響飲食效果
當你試著在新年里改善自己的飲食時,體內的微生物群卻可能會“搗亂”。近日,刊登在《細胞—宿主和微生物》期刊上的論文稱,研究人員探索了為何小鼠從自由的美式飲食轉換到健康低卡路里的植物性飲食后,沒有立刻出現效果。他們發現,若想一項新飲食計劃取得成功,必須去除某些人體腸道細菌。 “如果我們想開飲食處方
腸道微生物藥物的研發
在人類的腸道里存在一個巨大的微生物群體,稱之為“腸道微生態系統”,其作為宿主最重要的微生態系統組成部分,大約包含有15000~36000個菌種,由專性厭氧菌(>99%)、兼行厭氧菌和好氧菌共同組成,這些細菌共同構成胃腸道的動態微生態平衡。腸道在消化、吸收各種營養物質的同時又能將細菌及其代謝產物通
腸道微生物加入抗癌斗爭
2015年,Bertrand Routy還是法國古斯塔夫·魯西癌癥中心的一位博士生,他常去醫院收集癌癥患者的糞便樣本。醫生嘲笑他,甚至給他取了個外號:便便先生。 但Routy的研究結果發布后,人們停止了對這類研究的嘲笑。研究表明,某些腸道細菌似乎可以提高人們對抗癌治療的反應。醫生也盼望研究者能
腸道微生物可以影響體重
根據最近發表在《Mayo Clinic Proceedings》雜志上的一篇文章,對于特定人群來說,腸道微生物的特殊活性或許有助于減肥。這一效應不依賴于控制飲食以及日常鍛煉等行為。 “我們知道不同人的減肥效率存在差別,即使在接受了相同的卡路里攝入以及相同強度的鍛煉之后依然如此”,該研究的作者P
中國科研人員構建最優質人腸道微生物參考基因集
7月7日,由華南理工大學生物科學與工程學院博士研究生李俊樺為第一作者,與深圳華大基因研究院、丹麥哥本哈根大學等單位共同合作完成的《人腸道微生物組參考基因集》研究成果在《自然—生物技術》上發表。這是“華工—華大”基因組科學創新班學子在國際頂級學術期刊上以第一作者身份發表的第二篇文章。 據介紹,人
流程化、更高效的基因編輯工具:打開腸道微生物組“窗口”
基因,就像是指揮官手里拿著的建筑總圖紙,調控著生物體的一切生命活動。這份施工的圖紙決定了整個建筑的所有呈現形式。那怎么才能對“圖紙”——基因進行編輯呢?CRISPR/Cas編輯系統被認為是最佳的一種工具。 1月6日,中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所、深圳合成生物學創新研究院戴磊課題
微塑料改變海鳥腸道微生物
與攝入微塑料較少的海鳥相比,攝入大量塑料顆粒的海鳥的消化系統含有更多樣化的細菌。但目前尚不清楚腸道微生物組多樣性的增加對海鳥意味著什么。相關研究3月27日發表于《自然-生態與進化》。海洋環境中存在大量微塑料污染。圖片來源:blickwinkel/Alamy海鳥很容易吃到微塑料(寬度小于5毫米的碎片)
張成崗:與腸道微生物對話
張成崗 2月24日清晨,呼吸著北京的早春清冷的空氣,張成崗驅車前往河北省保定市。他此行的目的地是保定監獄,打算與那里的管理者討論一下“菌心說”與預防犯罪相關研究的事宜,為下一步研究作準備。 “菌心說”是張成崗于2013年提出的概念,其核心內容是認為人體內存在的菌群決定了身體甚至心理的狀態。“我還
微塑料改變海鳥腸道微生物
與攝入微塑料較少的海鳥相比,攝入大量塑料顆粒的海鳥的消化系統含有更多樣化的細菌。但目前尚不清楚腸道微生物組多樣性的增加對海鳥意味著什么。相關研究3月27日發表于《自然-生態與進化》。 海鳥很容易吃到微塑料(寬度小于5毫米的碎片),因為它們常在這些污染物聚集的海洋區域覓食。本月發表的另一項研究表
“萬能”的腸道微生物
公元前300多年,西方“醫學之父”希波克拉底曾揚言:“所有疾病始于腸道”。 兩千多年后,醫學工作者們發表了眾多研究成果,他的觀點正在一點一點地被證實。當我們談到許多慢性疾病的發病機制時(比如慢性腸炎、糖尿病,甚至阿爾茨海默癥、衰老、肥胖癥、藥物療效等),我們逐漸意識到,腸道微生物幾乎是繞不開
Science:腸道微生物干擾了藥效
在最近一項研究中,加州大學舊金山分校的研究人員描述了微生物組如何干擾藥物預期作用的第一個具體例子。他們專注于左旋多巴(L-dopa),這是帕金森病的主要治療藥物,他們確定了數萬億種細菌中的哪些細菌負責降解藥物以及如何阻止這種微生物干擾現象的發生。 帕金森病會攻擊大腦中產生多巴胺的神經細胞,如果
生活方式決定腸道微生物
腸道菌群負責人體健康和營養的許多方面,但是大多數研究都集中在“西方”人群。目前,包括德國Max Planck進化人類學研究所在內的一項國際合作研究,首次分析了一個現代狩獵采集群體(坦桑尼亞的哈扎人)的腸道菌群。這項工作的結果表明,哈扎人擁有獨特的腸道微生物屬性,其特征在其他任何人群中都沒有見
腸道微生物DNA的提取方法
實驗概要腸道微生物DNA是進行微生物分子生態學研究的前提。能否獲得高的DNA提取率和高質量的DNA,從而真實地反映微生物群落的實際情況,是保障研究結果是否可靠的關鍵。如何獲取高質量、較完整的腸道菌群基因組DNA是腸道微生物研究中的關鍵。本研究采用物理方法,化學方法,酶解法等進行DNA提取,并對其進行
腸道微生物與老年相關疾病
按照WHO的標準,一個國家或地區65歲人口超過7%,或≥60歲人口超過10%即為老齡化。根據國家統計局2017年最新數據,我國≥60周歲人口為24090萬人,占總人口的17.3%,其中≥65周歲人口為15831萬人,占總人口的11.4%。我國已經成為世界上老年人口最多的國家,呈現出老齡化速度快、老年
腸道微生物竟可逆轉肥胖
從參與帕金森發病,到延緩“漸凍癥”的進展,腸道微生物都肩負重任,而昨日,美國猶他大學的研究人員在其“功勞簿”上再次畫上了濃墨重彩的一筆:腸道中的特定菌群--梭菌,可阻止免疫系統受損的小鼠發胖!不僅推動了腸道微生物的研究,也讓我們重新認識了肥胖與免疫系統的關系。 據不完全統計,全世界范圍內,現約
腸道微生物最新研究進展
腸道是人體最大的消化和排毒器官,其回旋盤轉的結構被形象地稱為人體第二大腦。腸道中寄生著數以計億的細菌,它們是人體內最重要的一種外環境,各種微生物按一定比例組合,相互制約,相互依存,在質和量上形成一種生態平衡。然而腸道菌群并不都是人類的朋友,按特性來講,它們可分為3大類,即好菌、壞菌和中性菌。當人
新型腸道微生物研究模型——HIO
當一個生命出生時,大自然為小家伙們的消化系統準備了可用一輩子的無價的饋禮——益生菌。《eLife》新文章表明,人體非常常見的大腸桿菌有助于新生兒腸道內襯排布,能為即將入住的多樣化菌群繁殖激增做好準備。 植入了大腸桿菌(綠色)的HIO 大家都知道糞便中的主要細菌是大腸桿菌,它們除了分解食物產生
腸道細菌篡改宿主基因
保持免疫系統平衡是個精妙的復雜事件,遇到外來入侵者時及時發出警報,同時,聰明地區分我軍組織和器官不亂殺無辜。 機體有一些幫助免疫系統維穩的工具。人類白細胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)和小鼠的主要組織相容性復合物(major histocompatibility