分子生物學家連發Cell，Nature文章破解基因組奧秘
來自賓州大學的分子生物學教授Frank Pugh主要從事真核細胞基因組中轉錄調控機制方面的研究，近期其研究組接連發表文章，分別解析了基因組中相同類型位置上編碼和非編碼RNA的起始點，以及利用一種新技術，破解了兩種染色體重構因子在基因組范圍內的組織調控方式。 在真核細胞中，ATP依賴的染色體重構復合物對調控啟動子，對轉錄的功能都非常重要。SWR-C/SWR1和INO80是染色體重構復合物中的組成成分，它們能分別催化組蛋白變體H2A.Z從基因起始點上的第一個核小體的聚集和去除，具有重要意義。 然而這些因子如何靶向核小體，行使功能的，至今科學家們還并不十分清楚，在這篇文章中，Pugh教授領導的研究組采用了一種新技術——ChIP-exo，識別出了整個酵母基因組中20個這些亞基的亞核小體分布情況。 這種被稱作ChIP-exo的技術相對于其他技術的優勢在于，它能夠將基因組上基因調節蛋白的結合位點從上百萬到幾十億個核......閱讀全文
核蛋白基因組指紋技術
Fine Mapping of Genomic Targets of Nuclear Proteins in Cultured CellsAchim Breiling and Valerio OrlandoDulbecco Telethon Institute, Institute of Genet
《基因組蛋白質組與生物信息學報》：蛋白質組學技術面臨
《基因組蛋白質組與生物信息學報》：蛋白質組學技術面臨挑戰 2003年4月人類基因組圖譜基本繪制完成，但對基因的調節與功能問題仍未能解讀。由于基因的功能主要是通過其編碼的蛋白質來實現，蛋白質才是生命活動真正的執行者，所以越來越多的科學家致力于蛋白質的研究，試圖找出人類疾病的致病機理，最終解決人類
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
全基因組擴增技術介紹
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。QIAGEN的全基因組擴增技術通過以包括單細胞在內的小量樣本或珍貴樣本擴增獲得基因組DNA，解決此類難題。REPLI-g?Kit能夠準確地復制原始DNA樣本，不會造成偏差，擴增后的DNA可以直接應用于廣泛的遺傳學分析。什么是全基因組擴增(w
《科學》：古老蛋白塑造細菌緊湊基因組
該發現可能有助于開發其它標靶Rho的抗生素 ?與人類相比，細菌不攜帶過多的“垃圾DNA”，它們的基因組要“整潔”得多。比如大腸桿菌大約90%的基因組都包含編碼蛋白質的DNA，而人類基因組的90%都是非編碼的“垃圾DNA”。?美國科學家近日研究發現，細菌基因組的這種“整潔”可能要歸功于一種名為R
蛋白定量技術
（一）雙縮脲測定法1．原理? 蛋白質中的肽鍵有雙縮脲反應，在堿性溶液中與二價銅離子形成藍紫色的絡合物，在一定的范圍內，顏色的深淺與蛋白質的含量成正比。此法特異性強，游離的氨基酸、小肽和核酸均不產生這種反應，但此法不夠敏感，僅能測出毫克水平。??? 2．試劑配制???? 硫酸銅（CuSO4·5H2O）
基因組重排技術的特點介紹
基因組重排技術結合了傳統誘變技術和細胞融合技術,是一項對整個微生物基因組重排的新型育種技術。基因組重排技術通過多親本原生質體遞歸融合,可以使工程菌快速獲得多樣復雜優良表型,并且無須了解其基因組學、代謝組學等具體背景。介紹了基因組重排技術的過程及應用,展現了基因組重排技術的優點,并給出了基因組重排技術
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
“十二五”基因組和蛋白質組技術發展戰略研究啟動
6月9日至10日，科技部中國生物技術發展中心在深圳組織召開了“基因組和蛋白質組技術發展戰略研討會”，標志著該領域的“十二五”發展戰略規劃研究正式啟動。國內從事基因組學和蛋白質組學研究的院士、專家、學者共40多人參加了會議。科技部基礎司張先恩司長應邀出席會議，生物中心馬宏建副主任、深圳市委常委、常
十二五基因組和蛋白質組技術發展戰略研究啟動
6月9日至10日，科技部中國生物技術發展中心在深圳組織召開了“基因組和蛋白質組技術發展戰略研討會”，標志著該領域的“十二五”發展戰略規劃研究正式啟動。國內從事基因組學和蛋白質組學研究的院士、專家、學者共40多人參加了會議。科技部基礎司張先恩司長應邀出席會議，生物中心馬宏建副主任、深圳市委常委、常
融合蛋白技術的技術特點
融合基因可在原核細胞(如大腸桿菌) 也可在真核細胞中進行表達。原核表達系統的特點是時程短，費用低，是科研中的主要工具。其缺點是真核蛋白表達沒有得到確切修飾；大量蛋 白常常沉淀成不溶性包涵體聚合物，需要復雜的變性和復性過程；大量蛋白的分泌較困難。真核表達系統的特點是蛋白翻譯后加工機會多，甚至可被改造成
Science：新技術實現精確基因組編輯
麻省理工學院、布洛德研究所以及洛克菲勒大學的研究者開發出了一種新穎的技術，可以通過添加或去除基因來對活細胞的基因組進行修改。研究者表示，這種技術易于操作且成本低，可以用于對產生物燃料的生物將進行基因工程操作，設計用于人類疾病研究的動物模型，開發新的疾病療法，以及其他的潛在應用
基因組DNA提取與PCR擴增技術
一、基因組DNA提取實驗目的基因組DNA的制備是基因分析的前提。 本實驗要求掌握基因組DNA提取的基本方法。實驗原理 DNA在生物體內是與蛋白質形成復合物的形式存在的。核酸與蛋白質之間的結合力包括離子鍵、氫鍵、范德華力等，破壞或降低這些結合力就可把核酸與蛋白分開。 DNA、RNA所含有的嘌呤環和嘧啶
宏基因組分析和診斷技術概述
近年來，造成人類感染的病原微生物日益復雜，種類增多，抗菌藥物濫用致使細菌耐藥，病原微生物已成為全球關注的焦點。感染是急危重癥患者死亡的主要原因之一，隨著新發病原微生物的出現、耐藥病原微生物的增多以及免疫抑制宿主的增加，感染的發病率和死亡率居高不下。據WHO統計，在全球，感染性疾病導至患者死亡占全部死
Nature－Genetics：多種技術解析草莓基因組
近日，美國密歇根州立大學和加州大學戴維斯分校的研究人員組裝出近乎完整的栽培草莓基因組，并揭示了這種復雜的異源多倍體的起源和進化過程。 一轉眼又到了草莓上市的季節。這種小巧可愛的果實有著酸甜可口的味道，可搭配出各種各樣的美妙滋味。不過，對于草莓的基因組，你又了解多少？ 世界各地廣泛種植的鳳梨草
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
Nature子刊：基因組編輯新技術
許多的實驗室都在利用近期發現的一種細菌和古細菌天然防御機制作為基因組編輯工具。與真核生物的RNA干擾過程相似，這一CRISPR-Cas系統通過序列特異性切割外源核酸，保護了原核生物免受病毒攻擊。而CRISPR-Cas系統有可能發生非特異性靶向，導致基因組別處突變，也引起了人們越來越多的關注。
簡述全基因組測序的技術路線
全基因組測序的技術路線：提取基因組DNA，然后隨機打斷，電泳回收所需長度的DNA片段（0.2~5Kb），加上接頭, 進行DNA簇（Cluster）制備，最后利用Paired-End（Solexa）或者Mate-Pair（SOLiD）的方法對插入片段進行測序。然后對測得的序列組裝成Contig，通
融合蛋白技術簡介
在基因操作中，對一些分子數小的多肽基因常采用融合的方法與某一基因（如lac）相連，二者之間接上某一酶（如凝血酶）的切口，以增加在體內表達后產物的穩定性，也有的故意使兩個分子串連融合以提高療效，如IL-3與GM-CSF。也有與分泌性蛋白的信號肽基因組成融合基因，以使表達產物分泌到膜外或胞外。融合蛋白技
病毒蛋白與基因組RNA－構筑DNA蛋白復合結構多級可控構筑
生物大分子在自然進化中發展出一套獨特的“自下而上”自組裝方式進行各種復合結構的可控裝配，為多功能生物納米材料的加工制備提供了絕佳范例。其中，核酸-蛋白質納米復合體系的可控構筑，不僅將實現生物學上兩種基本組裝模式的有效結合，以提供愈加復雜的生物結構模板，還有助于體內生物大分子相互作用的深入理解，對
利用－MS/MS－研究燕麥中表達球蛋白儲存蛋白的基因組鑒定
最近發表在《植物科學前沿》（1）上的一篇論文介紹了一整套表達的球蛋白基因，這些基因編碼燕麥中的主要儲存蛋白及其染色體位置。為了獲取這些信息，研究人員利用串聯質譜法 (MS/MS) 分析分離的球蛋白，以確認種子中的身份和表達。研究人員在燕麥基因組上確定了 32 個球蛋白基因序列；其中，可以確認 RNA
蛋白蛋白相互作用技術介紹
技術內容蛋白質并非孤立存在的生物分子，而是具有特定三維空間結構并與其他蛋白質相互作用，共同執行功能。因此，蛋白質的模塊及空間組織與其表達水平具有同樣的重要性。為了解析蛋白質組的組織結構單元而開發的基于質譜的蛋白質組學方法通常結合了質譜檢測與各種生化試驗。其中最經典的技術為1999[1]首次報導的親和
蛋白蛋白相互作用技術內容
技術內容 蛋白質并非孤立存在的生物分子，而是具有特定三維空間結構并與其他蛋白質相互作用，共同執行功能。因此，蛋白質的模塊及空間組織與其表達水平具有同樣的重要性。為了解析蛋白質組的組織結構單元而開發的基于質譜的蛋白質組學方法通常結合了質譜檢測與各種生化試驗。其中最經典的技術為1999[1]
Nature：基因組編輯新技術－或超越CRISPR
能夠將缺陷基因的功能性拷貝插入到患者的基因組中，對于許多從事遺傳疾病治療的臨床醫生來說是一個誘人的目標。現在，斯坦福大學醫學院的研究人員設計出了一種新方法來實現這種遺傳技能。他們的研究論文“Promoterless gene targeting without nucleases amelior
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
Southern 印跡 放射性標記的探針與固定化核酸進行雜交 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強，當電泳后凝膠經過DNA變
美用新技術完成炭疽基因組測序
美國喬治亞理工學院科學家使用一種稱為RNA測序的新技術，描繪出了炭疽芽孢桿菌的基因表達。公布在最新一期《細菌學》雜志網絡版上的此項研究成果，標志著任何細菌轉錄(細菌表達不同基因時產生的完整信使RNA集合)自此可被全面定義，并為研究細菌如何調控基因表達提供了更多細節。 喬治亞理工學院光電系統
數字PCR技術精確檢測癌癥基因組擴增
來自斯坦福大學以及Bio-Rad的研究人員證實，數字PCR系統能夠精確測定長期存放的癌組織樣本中的癌癥基因組擴增。該研究成果發表在《Translational Medicine》雜志上。 某些拷貝數變異(如基因組擴增)可能導致特定癌基因的過表達，推動癌癥發展。靶定擴增的癌基因有望實現癌
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
實驗材料 基因組 DNA試劑、試劑盒 限制性緩沖液儀器、耗材 瓊脂糖凝膠實驗步驟 1. 7~20 μg 基因組 DNA 稀釋到 500 μl 合適的限制性緩沖液中。4℃ 過夜。2. 每管加 10~20 單位限制性酶。孵育 4~6 小時。10 μl 消化液在小瓊脂糖凝膠上電泳檢測消化的程度。如果需要，
Cell發布突破性基因組研究技術
來自美國麻省大學醫學院的研究人員開發出了一項新技術，可以提供真核生物基因組的詳細三維（3-D）圖像，這有可能幫助科學家們解答一些有關染色質結構的關鍵問題。在發表于《細胞》（Cell）雜志上的研究論文中，這一稱作為Micro-C的新技術使得研究人員能夠以核小體分辨率來分析染色體折疊，填補了以往一些